[發(fā)明專利]用于檢測高大山羊草染色體臂的成套分子標記及其應(yīng)用

在審

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• 申請日: 2017-11-30
• 公開（公告）號: CN107868841A
• 公開（公告）日: 2018-04-03
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 葉興國;王坤楊;王軻;林志珊;杜麗璞;李仕金;王靜;石磊;陳海強;馬曉蘭
• 申請（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司11245
• 代理人: 關(guān)暢,何葉喧

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種用于檢測高大山羊草染色體臂的成套分子標記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

高大山羊草(2n＝2x＝14，S^lS^l，Aegilops longissima L.)是小麥族山羊草屬的一個二倍體種，它主要分布在中東地區(qū)的埃及和巴勒斯坦的海岸，另外，約旦等地也有少量的分布，屬于一年生植物。在進化關(guān)系上，高大山羊草的基因組與六倍體小麥的B基因組比較接近。高大山羊草對于生物脅迫(如銹病、白粉病、孢囊線蟲、根結(jié)線蟲、麥廮蠅和綠蚜等)和非生物脅迫(如干旱、寒冷和高鹽等)具備很廣泛的抗性，并含有特異麥谷蛋白等優(yōu)質(zhì)基因，因此是小麥抗性育種和品質(zhì)育種的優(yōu)質(zhì)基因源。例如，來自高大山羊草的3S染色體的Pm13基因，賦予了小麥對白粉病(PM)的廣泛抗性，并在小麥育種和生產(chǎn)中發(fā)揮了重要作用；通過對Pm13的應(yīng)用，已經(jīng)培育了多個具有抗白粉病的小麥品種，并應(yīng)用于小麥生產(chǎn)；另外，在高大山羊草1S^l染色體長臂上發(fā)現(xiàn)存在編碼高分子量麥谷蛋白亞基(HMW-GS)的2個基因(1Sx2.3和1Sy16)，在高大山羊草1S^l染色體短臂上發(fā)現(xiàn)存在編碼低分子量麥谷蛋白亞基(LMW-GS)的基因(1SLMW-s)。

目前，對于高大山羊草的各條染色體上所蘊含的抗病、抗逆和優(yōu)質(zhì)基因向普通小麥的導(dǎo)入，主要還是以染色體易位的形式進行。但是，迄今為止對高大山羊草的研究報道還較少，尤其對于高大山羊草的特定染色體上的特異性DNA片段進行克隆、分子標記開發(fā)也鮮有報道。因此，目前所取得的關(guān)于高大山羊草的研究結(jié)果，還遠遠不能滿足將高大山羊草中大量優(yōu)異基因向小麥中易位轉(zhuǎn)移的需要。所以，開發(fā)高大山羊草各個染色體臂和不同染色體區(qū)段特異的分子標記，對于將高大山羊草中存在的抗病、抗逆和優(yōu)質(zhì)等基因以染色體易位方式高效導(dǎo)入普通小麥，創(chuàng)制普通小麥-高大山羊草易位系材料，培育小麥新品種，改良小麥抗病、抗旱、耐鹽和品質(zhì)等性狀，具有重要時間意義。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供一種用于檢測高大山羊草染色體臂的成套分子標記及其應(yīng)用。

本發(fā)明首先提供了特異引物組合，由14個引物對組成；

引物對1由引物1SL-F和引物1SL-R組成；

所述引物1SL-F為如下(a1)或(a2)：

(a1)序列表的序列1所示的單鏈DNA分子；

(a2)將序列1經(jīng)過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列1具有相同功能的DNA分子；

所述引物1SL-R為如下(a3)或(a4)：

(a3)序列表的序列2所示的單鏈DNA分子；

(a4)將序列2經(jīng)過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列2具有相同功能的DNA分子；

引物對2由引物1SS-F和引物1SS-R組成；

所述引物1SS-F為如下(a5)或(a6)：

(a5)序列表的序列3所示的單鏈DNA分子；

(a6)將序列3經(jīng)過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列3具有相同功能的DNA分子；

所述引物1SS-R為如下(a7)或(a8)：

(a7)序列表的序列4所示的單鏈DNA分子；

(a8)將序列4經(jīng)過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列4具有相同功能的DNA分子；

引物對3由引物2SL-F和引物2SL-R組成；

所述引物2SL-F為如下(b1)或(b2)：

(b1)序列表的序列5所示的單鏈DNA分子；

(b2)將序列5經(jīng)過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列5具有相同功能的DNA分子；

所述引物2SL-R為如下(b3)或(b4)：

(b3)序列表的序列6所示的單鏈DNA分子；

(b4)將序列6經(jīng)過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列6具有相同功能的DNA分子；

引物對4由引物2SS-F和引物2SS-R組成；

所述引物2SS-F為如下(b5)或(b6)：

(b5)序列表的序列7所示的單鏈DNA分子；

(b6)將序列7經(jīng)過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列7具有相同功能的DNA分子；

所述引物2SS-R為如下(b7)或(b8)：

(b7)序列表的序列8所示的單鏈DNA分子；