[發明專利]一種MGMT基因啟動子甲基化的檢測方法及其引物組在審
| 申請號: | 201711216625.1 | 申請日: | 2017-11-28 |
| 公開(公告)號: | CN109837341A | 公開(公告)日: | 2019-06-04 |
| 發明(設計)人: | 裘敏燕 | 申請(專利權)人: | 上海聯吉醫學檢驗所有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 200331 上海市*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 甲基化 檢測 啟動子 引物組 甲基化特異性PCR 啟動子CpG島 分子生物學 半導體芯片 分析和評估 樣本基因組 測序技術 基因技術 理論基礎 醫學領域 靈敏度 新途徑 擴增 通量 個性化 篩選 測試 敏感 分析 | ||
1.一種MGMT基因啟動子甲基化的檢測方法及其引物組,具體步驟為:
利用生物信息學知識和相關生物信息學軟件,對公開數據庫中所能檢索到的MGMT基因啟動子CpG島序列信息,用Primer Premier 5.0軟件設計PCR引物;
采用甲基化特異性PCR(MSP)方法對待檢測樣本基因組DNA進行C-T轉化及PCR擴增;
將PCR擴增產物進行擴增子文庫的構建,ISP(Ion Sphere? Particles, Ion微球)模板的制備,在Ion Torrent PGM系統上進行測序,并用軟件對相關測序序列進行分析。
2.如權利要求1所述一種MGMT基因啟動子甲基化的檢測方法及其引物組,其特征在于一組甲基化特異性PCR引物,其序列分別為:SEQ ID No: 1- SEQ ID No:2:
5’- agggagtggtgagtttcggatatgttgggatagt -3’ SEQ ID No: 1;
5’- acaacccaaacactcaccaaat -3’ SEQ ID No: 2。
3.如權利要求1所述一種MGMT基因啟動子甲基化的檢測方法及其引物組,其特征在于一組甲基化特異性PCR引物組成一種檢測MGMT基因啟動子甲基化的試劑盒。
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