[發(fā)明專利]半滑舌鰨性逆轉遺傳控制位點、包含其的試劑盒及其應用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201711215933.2 | 申請日: | 2017-11-28 |
| 公開(公告)號: | CN109837346B | 公開(公告)日: | 2022-08-26 |
| 發(fā)明(設計)人: | 李恒德;蔣麗;崔瑜;王偉峰;王悅玲 | 申請(專利權)人: | 中國水產科學研究院 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12N15/11;A01K61/10 |
| 代理公司: | 北京康信知識產權代理有限責任公司 11240 | 代理人: | 韓建偉;張永明 |
| 地址: | 100141 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 舌鰨 逆轉 遺傳 控制 包含 試劑盒 及其 應用 | ||
1.一種判斷或檢測半滑舌鰨是否發(fā)生性逆轉的方法,其特征在于,所述方法包括:
擴增半滑舌鰨遺傳雌魚Z染色體上涵蓋性逆轉遺傳控制位點的DNA片段,以半滑舌鰨Z染色體全基因組序列NC_024328.1為基礎,所述逆轉遺傳控制位點包含第8564889位核苷酸位點;
檢測所述DNA片段比對到參考序列上的所述性逆轉遺傳控制位點是否至少為如下情況:第8564889位核苷酸為G;
若是,則所述遺傳雌魚不發(fā)生性逆轉;
若否,則進一步檢測所述遺傳雌魚Z染色體上第6676874位核苷酸的堿基類型;
若第6676874位核苷酸的堿基類型為A,則所述遺傳雌魚不發(fā)生性逆轉。
2.根據(jù)權利要求1所述的方法,其特征在于,所述逆轉遺傳控制位點還包含如下任意一個或多個核苷酸位點:第8565011位、第8565016位、第8565018位、第8565031位、第8565187位、第8565217位、第8565228位以及第8565219位與第8565220位之間的核苷酸位點;
檢測所述DNA片段比對到參考序列上的所述性逆轉遺傳控制位點是否至少為如下情況:第8565011位核苷酸為C,或第8565016位核苷酸T沒有缺失,或第8565018位核苷酸為C,或第8565031位核苷酸為T,或第8565187位核苷酸為G,或第8565217位核苷酸為G,或第8565228位核苷酸為T,或在第8565219位核苷酸與第8565220位核苷酸之間不存在7bp的插入片段AAACTAA;
若是,則所述遺傳雌魚不發(fā)生性逆轉;
若否,則進一步檢測所述遺傳雌魚Z染色體上第6676874位核苷酸的堿基類型;
若第6676874位核苷酸的堿基類型為A,則所述遺傳雌魚不發(fā)生性逆轉。
3.根據(jù)權利要求1所述的方法,其特征在于,采用SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的第一引物序列擴增涵蓋所述性逆轉遺傳控制位點的DNA片段。
4.根據(jù)權利要求3所述的方法,其特征在于,采用SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的第二引物序列檢測所述第6676874位核苷酸的堿基類型。
5.一種半滑舌鰨的育種方法,其特征在于,所述育種方法包括:
以半滑舌鰨Z染色體全基因組序列NC_024328.1為基礎,采用Z染色體上第8564889位核苷酸的基因型為ZGGZGG的雄性個體與任意雌性個體雜交,得到不發(fā)生性逆轉的子代雌性個體。
6.根據(jù)權利要求5所述的育種方法,其特征在于,所述育種方法包括:
采用Z染色體上第6676874位核苷酸和第8564889位核苷酸為如下任意一種基因型的雄性個體與任意雌性個體雜交,得到不發(fā)生性逆轉的子代雌性個體:
ZA,GGZ A,GG、ZA,GGZ T,GG、ZT,GGZ T,GG、ZA,GGZ A,AG、ZT,GGZ A,AG、ZA,AGZ A,AG、ZA,AAZ A,AA、ZA,GGZ A,AA、ZT,GGZ A,AA、ZA,AGZ A,AA,其中“,”之前代表第6676874位核苷酸的基因型,“,”之后代表第8564889位核苷酸的基因型。
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