[發明專利]與桃果皮絨毛性狀相關的SNP標記及其應用

有效

• 申請號: 201711181446.9
• 申請日: 2017-11-23
• 公開（公告）號: CN107746896B
• 公開（公告）日: 2021-03-16
• 發明（設計）人: 謝華;徐搖光;任飛;于洋
• 申請（專利權）人: 北京市農林科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;A01H1/04
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢

本發明公開了與桃果皮絨毛性狀相關的SNP標記及其應用。本發明提供了三個與桃果皮絨毛性狀相關的SNP分子標記及成套的KASP引物組合，可用于桃育種材料果皮性狀及果實油桃和毛桃表型的快速鑒定。本發明的鑒定方法成本低、結果準確可靠、操作簡單周期短，利于大樣本量的檢測，在桃新品種的果實絨毛性狀及果實油桃和毛桃表型的預測上有重要的意義，能有效提升桃育種效率和準確性。

技術領域

本發明屬于農業生物技術領域，具體的說，涉及與桃果皮絨毛性狀相關的SNP分子標記及其應用。

背景技術

桃(Prunus persica)是我國重要的果樹類型之一，近年來隨著育種技術的提升，越來越多的新品種育成并成功投放到市場上，一方面滿足了人們日益增長的品質需求，更重要的是帶來了可觀的經濟和社會效益。油桃品種起源于中國的西北部，由于其沒有表皮的絨毛，可溶性固形物、可滴定酸的含量、去皮硬度、抗旱性、抗紫外輻射等性狀都有所提升，因此油桃新品種已經成為桃育種研究的重要方向，利用油桃改善果實的品質和風味已經成為有效的手段。

近年來分子標記輔助育種技術不斷用于桃的研究，遺傳圖譜定位、全基因組關聯分析、混池測序分析、轉錄組分析等手段不斷用于桃的性狀定位研究，結果表明桃果皮的絨毛是單基因調控的性狀，無毛是由隱性基因控制的，且是微小的結構變異導致，但是其機理還是不甚清楚，對于油桃品種的選育，也發展了部分的SSR、SNP等分子標記，其中SSR分子標記位點少、預測準確度低、實驗繁瑣；SNP分子標記由于遺傳穩定、密度高等優點雖然是被認為分子標記輔助育種最有前景的標記，但是在桃表型性狀關聯上都是單個標記，對于表型的預測效率及準確性低。隨著桃SNP分型的高通量測序技術的發展及高密度基因芯片的普及及應用，運用組合的SNP分子標記用于桃果實的表型鑒定的技術成為可能。其中，KASP(Kompetitive Allele Specific PCR，競爭性等位基因特異性PCR)可以對基因組DNA的SNP和InDel進行精準的雙等位基因分型，該技術具有成本低、高通量、速度快、靈敏度高、周期短等優點，使得其成為針對少量位點多個樣本進行現代農業分子育種的有效手段。

發明內容

本發明的第一個目的是提供一種檢測待測桃樹基因組的g.13627556位點、g.16646429位點和g.16980999位點的基因型的物質的新用途。

本發明提供了檢測待測桃樹基因組的g.13627556位點、g.16646429位點和g.16980999位點的基因型的物質在鑒定或輔助鑒定待測桃樹的果實為油桃還是毛桃中的應用。

本發明還提供了檢測待測桃樹基因組的g.13627556位點、g.16646429位點和g.16980999位點的基因型的物質在制備鑒定或輔助鑒定待測桃樹的果實為油桃還是毛桃的產品中的應用。

本發明還提供了檢測待測桃樹基因組的g.13627556位點、g.16646429位點和g.16980999位點的基因型的物質在鑒定或輔助鑒定待測桃樹的果實絨毛性狀中的應用。

本發明還提供了檢測待測桃樹基因組的g.13627556位點、g.16646429位點和g.16980999位點的基因型的物質在制備鑒定或輔助鑒定待測桃樹的果實絨毛性狀的產品中的應用。

本發明的第二個目的是提供一種鑒定或輔助鑒定待測桃樹的果實為油桃還是毛桃的方法。

本發明提供的鑒定或輔助鑒定待測桃樹的果實為油桃還是毛桃的方法包括如下步驟：

1)檢測待測桃樹基因組的g.13627556位點、g.16646429位點和g.16980999位點的基因型，分別根據每個所述位點的基因型判斷所述待測桃樹的果實為油桃還是毛桃：

若所述待測桃樹基因組的g.13627556位點的基因型為CC，則該待測桃樹的果實為油桃，若所述待測桃樹基因組的g.13627556位點的基因型為TC或TT，則該待測桃樹的果實為毛桃；