[發明專利]基于108個基因的胃癌腹膜轉移預測模型及其應用

有效

• 申請號: 201711080076.X
• 申請日: 2017-11-06
• 公開（公告）號: CN107760783B
• 公開（公告）日: 2021-01-29
• 發明（設計）人: 陳強;張秀清;鄭建偉;施純玫;黃志清;祝中一;莊鎮堃;胡偉彭
• 申請（專利權）人: 福建醫科大學附屬協和醫院;深圳華大生命科學研究院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 福州元創專利商標代理有限公司 35100
• 代理人: 蔡學俊

胃癌是中國人最常罹患和最易致死的主要癌癥，而胃癌腹膜轉移是胃癌主要的致死原因，也是胃癌治療的瓶頸，然而目前尚無相關基因模型可以預測胃癌腹膜轉移的潛在風險。本發明提供基于108個基因的胃癌腹膜轉移預測模型及其應用，包括PCLO、UGGT1、ZNF714等108個基因；選定了最佳的分類器SVM以及陽性判斷閾值0.5，據此可有效特異地對腹膜轉移風險進行預測。本發明基因模型的應用將有助于預判胃癌患者的轉移情況，對于及時采取有效的臨床措施、制定個體化的診治方案，最終提高胃癌患者生存率的具有重要的價值和意義。

技術領域

本發明屬于基因檢測領域，具體涉及胃癌腹膜轉移預測基因模型及其應用。

背景技術

據最新統計，胃癌是全球發病率位居第四、死亡率位居第二的惡性腫瘤，而在我國胃癌死亡率則高居惡性腫瘤死亡率第三位。早期胃癌無明顯癥狀，大多數患者就診時已到中晚期，并無有效治療方法。腹膜轉移是胃癌轉移的主要方式，10-25％的胃癌患者在術前或術中即發現有腹膜轉移，而根治術后的患者中30-60％仍出現腹膜轉移。因此，胃癌腹膜轉移是胃癌主要的死亡原因，也是胃癌治療的瓶頸。

胃癌侵襲轉移過程非常復雜，主要包括黏附、降解、移動和血管生成4個階段，其中涉及眾多的分子途徑和信號通路上的基因。研究表明，胃癌腹膜轉移的始動過程可能包括的基因種類有: 抗氧化活性相關基因，細胞凋亡相關基因、細胞粘合相關基因、細胞代謝相關基因、細胞周期相關基因、酶調控活性相關基因、細胞信號轉導活性相關基因、細胞結構分子活性相關基因、轉錄調控活性相關基因、翻譯調控活性相關基因、轉運活性相關基因等多類功能基因。

目前胃癌腹膜轉移的分子機制還未得到系統解析，尚無相關基因模型可以預測或診斷胃癌的腹膜轉移風險。而及早預測胃癌患者的轉移風險，對于及時采取積極的臨床干預措施或者避免不必要的臨床治療措施如腹腔灌注化療，從而制定個體化的診治方案，提高胃癌患者生存率的都具有重要的價值和意義。

發明內容

本發明的目的是提供基于108個基因的胃癌腹膜轉移預測模型及其應用，克服目前缺乏胃癌腹膜轉移預測基因模型的不足，本發明在對胃癌樣本的基因組進行系統解析的基礎上提出了特定的基因模型，可以有效特異地對胃癌腹膜轉移風險進行評估。

本發明解決其技術問題所采用的技術方案如下：

本發明的目的1在于提供胃癌腹膜轉移預測基因模型，所述模型涉及108個人類基因的任一個或多個基因組合，優選地，包含但不限于全部108個基因； 所述108個基因具體為PCLO、UGGT1、ZNF714、KIAA0825、COL23A1、MED1、NPAS2、TTC14、RPS27A、ASPH、ARHGEF12、SIK1、PAPPA、HHIPL1、MYO9B、ITPKB、ZNF862、MKNK1、MUC6、TRRAP、DUOX1、KRTAP5-2、EPHA6、ZNF292、PXDC1、USP8、CA5B、C7orf31、PHLDB2、KRTAP4-9、DEPTOR、NR3C2、PCDHGA7、BIRC2、PAQR7、DIO1、NACA、ZNF750、ANKIB1、PNPO、CYLC1、SERPINI2、LRRC38、HERC4、RNF145、ERICH1、DIS3、MRPL45、GALNT12、CDYL、WISP1、ENOX1、HHLA3、CELA2B、SLC6A14、PTPN4、GJA9、TIMP2、LMTK3、MAP4K4、BICC1、PRKCE、TXLNB、PGAP1、ZNF528、SPATA31C2、GTF2H1、SLC17A4、PCDHA4、ANK3、FRYL、ANKRD17、COL27A1、DOCK2、TRPC4、USP6、MAP1A、QRICH2、TRAPPC11、MLLT10、NME8、HAVCR1、SLC14A2、CREBBP、FMN2、CASP10、LACE1、BRCA1、PRDM1、GRID2、SYNPO2、TXLNG、MUC5B、NGEF、DHX9、HCN4、KTN1、ZNF547、PLXNA4、CACNA1H、RARS、COL14A1、APLP2、RREB1、PAXIP1、AKAP13、NAV2和DISP1。