[發明專利]一個NF?κB1基因插入/缺失多態性位點在制備檢測丙型肝炎易感性產品中的應用

在審

• 申請號: 201711041892.X
• 申請日: 2017-10-30
• 公開（公告）號: CN107574240A
• 公開（公告）日: 2018-01-12
• 發明（設計）人: 岳明;李軍;喻榮彬;張津瑋;金柯;張云;樊圓圓;凡豪志;韓亞萍
• 申請（專利權）人: 南京醫科大學第一附屬醫院;南京醫科大學;南京大學醫學院附屬鼓樓醫院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 江蘇圣典律師事務所32237
• 代理人: 楊文晰

技術領域

本發明涉及生物醫藥領域，特別是一種人基因組中NF-κB通路的NF-κB1基因rs28362491插入/缺失多態性位點在制備檢測丙型肝炎易感性產品中的應用。

背景技術

基因多態性(genetic polymorphism)是指在一個生物群體的基因水平上，在同一位置存在一種以上的基因變異，不同的基因變異形式稱為基因型(genotype)或等位基因(allele)。基因多態性包括以下幾種：單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)、插入/缺失(insertion/deletion,InDel或I/D)多態性、DNA重復序列多態性。SNP指的是單個核苷酸突變而引起的核酸序列的改變。InDel多態性指的是基因組中特定DNA片段的插入或缺失，它和SNP多態性都是二等位基因遺傳標記。根據DNA片段的大小，InDel多態性可分為以下五類：(1)1個堿基對(base pairs,bps)的InDel；(2)單一bp的InDel；(3)以2-15bps為重復單元的多bps的InDel；(4)轉座子InDel；(5)任意DNA序列的InDel。InDel多態性可能導致功能蛋白的異常表達，進而與生物體的生理健康或疾病有關。人類基因組的各種多態性導致了不同種族、人群的染色體基因組具有多樣性，也導致了人體對疾病的易感性、病程進展、轉歸，及藥物治療效果存在差異。目前InDel多態性已被視為一種遺傳標記，可用于研究遺傳變異與人類疾病的關系。

丙型病毒性肝炎是一種由丙型肝炎病毒(HCV)感染引起的病毒性肝炎。全球共有1.85億HCV感染者，中國的HCV感染率約為1.6％，輸血、注射吸毒、器官移植和血液透析已經成為國內主要的HCV傳播途徑。HCV急性感染可有兩種不同的結局：病毒自限性清除和持續性感染。自限性清除者指的是HCV感染人體后，機體未經治療、在感染后的12個月內自動清除HCV，從而免于持續性感染，表現為HCV RNA陰性，HCV抗體陽性。持續性感染指的是HCV感染人體后，機體未經治療、在感染后的12個月內不能清除HCV，表現為HCV RNA陽性，HCV抗體陽性。超過70％的HCV感染者可發展為持續性感染，其中一部分患者還可能發展成為肝硬化、肝細胞肝癌(HCC)。

HCV感染者的病情發展和轉歸可受多種因素可影響，包括病毒、宿主免疫和遺傳因素。在過去幾年中，在全球多項大型臨床試驗中，新的直接抗病毒藥物(direct-acting antiviral agents,DAAs)將慢性丙肝的治愈率顯著提高到95％以上，已成為傳統的聚乙二醇干擾素+利巴韋林治療方案的更優選擇。然而，隨著DAAs藥物的應用，不斷有新問題涌現：HBV/HCV合并感染者使用DAA藥物可致HBV再激活；在部分獲得持續性病毒應答(SVR)的肝硬化患者中，DAAs的應用并不能降低HCC的發生率；DAAs治療還可導致耐藥的發生，目前已確認的耐藥相關突變(resistance associated variants,RAVs)位點包括NS3/4A靶點相關、NS5A靶點相關和NS5B靶點相關的幾十個RAVs。

考慮到阻止HCV傳播的首要問題是篩查、識別易感人群。因此，進行中國人群遺傳背景與HCV感染的關系的研究，對于深入探索遺傳因素在丙肝病程進展的作用機制，為及時、有效防控丙肝流行提供有效的靶點、工具及理論基礎，具有重要的現實意義。

NF-κB是核轉錄因子，具有和某些基因上啟動子區的特定核苷酸序列結合而啟動基因轉錄、調節細胞增殖、凋亡、炎癥過程及免疫應答的功能。NF-κB可被細菌/病毒抗原、細胞因子等許多刺激物激活，繼而調節150多種基因的表達。NF-κB/ReL家族成員有c-ReL、NF-κB1(P50)、NF-κB2(P52)、RelA(P65)、ReLB。這些蛋白都有一個大約由300個氨基酸組成的氨基末端，稱為ReL同源區，包括DNA結合部位、二聚體化部位及與NF-κB抑制蛋白(IκB)結合位點。有活性的DNA結合的NF-κB是P50與P65二聚體。ReL蛋白成員間可形成同源或異源二聚體，不同的NF-κB/ReL蛋白二聚體具有不同的結合序列，而且各有特性，不同二聚體可識別不同的DNA靶目標，而對不同調節基因的表達能力得以提高。NF-κB蛋白P50/P65、P50/c-ReL、P65/c-ReL復合體具有轉錄激活作用，而P50/P50和P52/P52同源二聚體則具有轉錄抑制作用。