[發(fā)明專(zhuān)利]谷子糊化溫度基因分子標(biāo)記及其應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201711029264.X
• 申請(qǐng)日: 2017-10-19
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN107723377A
• 公開(kāi)（公告）日: 2018-02-23
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 王永芳;李海權(quán);白輝;降彥苗;耿玲玲;刁現(xiàn)民;智慧;劉國(guó)慶
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 河北省農(nóng)林科學(xué)院谷子研究所
• 主分類(lèi)號(hào): C12Q1/6895
• 分類(lèi)號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 暫無(wú)信息
• 代理人: 暫無(wú)信息

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及植物基因領(lǐng)域，具體涉及一種谷子糊化溫度基因分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

由于A(yíng)LK基因同源克隆未發(fā)現(xiàn)糊化溫度的變異位點(diǎn)，推測(cè)谷子糊化溫度性狀可能是由多基因控制的數(shù)量性狀。利用粘度速測(cè)儀(RVA)法，對(duì)“S80X大黑谷”RIL群體的180個(gè)家系在石家莊、長(zhǎng)治2個(gè)環(huán)境收獲的種子進(jìn)行了蒸煮食味品質(zhì)測(cè)定和數(shù)據(jù)搜集工作。群體兩點(diǎn)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示，各指標(biāo)在兩個(gè)試驗(yàn)點(diǎn)均呈連續(xù)正態(tài)分布，說(shuō)明品質(zhì)相關(guān)性狀均為典型的數(shù)量性狀。而且除了糊化溫度和峰值時(shí)間兩試驗(yàn)點(diǎn)數(shù)據(jù)分布相當(dāng)之外，崩解值、消減值和回生值3個(gè)指標(biāo)在山西長(zhǎng)治比河北石家莊表現(xiàn)出了更廣泛的變異。

發(fā)明內(nèi)容

為解決上述問(wèn)題，本發(fā)明提供了一種谷子糊化溫度基因分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

為實(shí)現(xiàn)上述目的，本發(fā)明采取的技術(shù)方案為：

谷子糊化溫度基因分子標(biāo)記，包括CAAS3020標(biāo)記和SI038標(biāo)記，CAAS3020擴(kuò)增的125bp的片段和SI038擴(kuò)增的325bp的片段為高糊化溫度的標(biāo)記，CAAS3020擴(kuò)增的127bp的片段和SI038擴(kuò)增的329bp的片段為低糊化溫度的標(biāo)記。

上述谷子糊化溫度基因分子標(biāo)記可用于育種后代材料糊化溫度的檢測(cè)，從而進(jìn)行后代材料的輔助篩選。

本發(fā)明具有以下有益效果：

本具體實(shí)施的CAAS3020標(biāo)記擴(kuò)增的125bp的片段和SI038標(biāo)記擴(kuò)增的325bp的片段為高糊化溫度的標(biāo)記，CAAS3020標(biāo)記擴(kuò)增的127bp的片段和SI038標(biāo)記擴(kuò)增的329bp的片段為低糊化溫度的標(biāo)記，可以作為輔助選擇標(biāo)記用于育種后代材料篩選。

附圖說(shuō)明

圖1為本發(fā)明實(shí)施例中親本中多態(tài)性引物篩選示意；圖中，箭頭為多態(tài)性引物。

圖2為本發(fā)明實(shí)施例中SI038標(biāo)記和CAAS3020標(biāo)記在群體中的掃描示意圖。

圖3為本發(fā)明實(shí)施例中遺傳連鎖圖譜的示意圖。

圖4為本發(fā)明實(shí)施例中QTL定位結(jié)果的示意圖。

具體實(shí)施方式

為了使本發(fā)明的目的及優(yōu)點(diǎn)更加清楚明白，以下結(jié)合實(shí)施例對(duì)本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步詳細(xì)說(shuō)明。應(yīng)當(dāng)理解，此處所描述的具體實(shí)施例僅僅用以解釋本發(fā)明，并不用于限定本發(fā)明。

谷子糊化溫度基因分子標(biāo)記，其中第3染色體CAAS3020-SI038標(biāo)記間的QTL貢獻(xiàn)率最大，為17.02％，CAAS3020擴(kuò)增的125bp的片段和SI038擴(kuò)增的325bp的片段為高糊化溫度的標(biāo)記，CAAS3020擴(kuò)增的127bp的片段和SI038擴(kuò)增的329bp的片段為低糊化溫度的標(biāo)記。

本具體實(shí)施利用均勻覆蓋谷子各染色體的700個(gè)SSR標(biāo)記對(duì)“S80X大黑谷”RIL群體的親本進(jìn)行檢測(cè)(如圖1所示)，從中篩選出了140個(gè)均勻覆蓋全基因組的標(biāo)記對(duì)180個(gè)家系進(jìn)行了掃描(如圖2所示)，構(gòu)建了一張包含9個(gè)連鎖群、90個(gè)標(biāo)記的遺傳連鎖圖譜。如圖4所所示，遺傳連鎖圖譜總長(zhǎng)度為1160.5cM，標(biāo)記間平均距離為13.03cM。結(jié)合兩點(diǎn)品質(zhì)測(cè)定數(shù)據(jù)，進(jìn)行了QTL定位，共發(fā)掘3個(gè)環(huán)境下QTL位點(diǎn)26個(gè)，其中在第3、4、8染色體出現(xiàn)多性狀聚集的現(xiàn)象。在第3染色體上定位到3個(gè)性狀在兩種環(huán)境下均可穩(wěn)定遺傳且貢獻(xiàn)率較高的主效位點(diǎn)，為進(jìn)一步精細(xì)定位和基因挖掘奠定了基礎(chǔ)(如圖3所示)。糊化溫度在第3、4、6染色體上，其中第3染色體CAAS3020-SI038標(biāo)記間的QTL貢獻(xiàn)率最大，為17.02％。對(duì)CAAS3020和SI038兩個(gè)標(biāo)記再群體中擴(kuò)增片段和群體的糊化溫度數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)比較，兩個(gè)標(biāo)記呈共分離遺傳，如表1所示，CAAS3020擴(kuò)增的125bp的片段和SI038擴(kuò)增的325bp的片段為高糊化溫度的標(biāo)記，CAAS3020擴(kuò)增的127bp的片段和SI038擴(kuò)增的329bp的片段為低糊化溫度的標(biāo)記，可以作為輔助選擇標(biāo)記用于育種后代材料篩選。

表1“S80X大黑谷”部分家系中CAAS3220和SI038擴(kuò)增片段對(duì)應(yīng)的糊化溫度

以上所述僅是本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方式，應(yīng)當(dāng)指出，對(duì)于本技術(shù)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來(lái)說(shuō)，在不脫離本發(fā)明原理的前提下，還可以作出若干改進(jìn)和潤(rùn)飾，這些改進(jìn)和潤(rùn)飾也應(yīng)視為本發(fā)明的保護(hù)范圍。