[發明專利]蘋果轉錄因子ERF17中絲氨酸殘基數目的應用有效
| 申請號: | 201711009930.3 | 申請日: | 2017-10-25 |
| 公開(公告)號: | CN109709332B | 公開(公告)日: | 2020-10-27 |
| 發明(設計)人: | 吳婷;韓振云;張美玲;韓振海;張新忠;王憶;許雪峰 | 申請(專利權)人: | 中國農業大學 |
| 主分類號: | G01N33/68 | 分類號: | G01N33/68;C12N15/11;C07K14/415;C12N15/29 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 蘋果 轉錄 因子 erf17 絲氨酸 殘基 目的 應用 | ||
本發明公開了蘋果轉錄因子ERF17中絲氨酸殘基數目的應用。蘋果轉錄因子ERF17自N末端第12位氨基酸殘基開始連續絲氨酸殘基的數目為8個和/或蘋果轉錄因子ERF17自N末端第12位氨基酸殘基開始連續絲氨酸殘基的數目為6個的待測蘋果的果皮葉綠素降解速率大于蘋果轉錄因子ERF17自N末端第12位氨基酸殘基開始連續絲氨酸殘基的數目為3個的待測蘋果。實驗證明,蘋果轉錄因子ERF17自N末端第12位氨基酸殘基開始連續絲氨酸殘基的數目可以作為檢測對象,預測待測蘋果果皮葉綠素降解速率。本發明具有重大的應用價值。
技術領域
本發明屬于生物技術領域,具體涉及蘋果轉錄因子ERF17中絲氨酸殘基數目的應用,尤其涉及蘋果轉錄因子ERF17中自N末端起第12位氨基酸殘基開始連續絲氨酸殘基的數目的應用。
背景技術
蘋果果皮色澤是果實重要的外觀品質之一,而開展在果皮著色前葉綠素降解的相關研究尤為重要。葉綠素的降解常發生在衰老的植物細胞中,并且受到強光照射、低溫等環境和內源激素乙烯誘導(Oeller et al.,1991;Hortensteiner,2006;Pino et al.,2008)。在高等植物中葉綠素降解途徑的相關研究已較清楚(Takamiya et al.,2000;Hortensteiner,2006):在葉綠體類囊體上,NYC(Non-Yellow Colouring)催化葉綠素b轉換為葉綠素a,葉綠素a被轉運至葉綠體基質中,在葉綠素酶(Chlorophyllase,CLH)作用下形成葉綠素,隨后由鎂離子螯合劑(Metal Chelating Substance,MCS)去除鎂離子后的脫鎂葉綠酸在PAO(Pheide a Oxygenase)和RCCR(Red Chl Catabolite Reductase)共同作用下形成了pFCC(blue-fluorescing intermediate)。
參與果實葉綠素降解的基因可以被分為兩類:一類是結構基因,其編碼的蛋白質可以直接參與葉綠素的降解代謝,如NYC、CLH、PAO;另一類是調控基因,其編碼的蛋白可以調控結構基因的轉錄水平,如乙烯響應因子(Ethylene Responsible Factors,ERF/AP2)。乙烯響應因子是植物中家族成員最多的轉錄因子之一,其含有ERF/AP2氨基酸保守結構域,并具有與DNA結合、轉錄激活、蛋白互作、核定位等結構域功能(Fukao et al.,2006)。現有研究表明,乙烯響應因子CitERF5、CitERF6、CitERF7和CitERF13在柑橘屬果實褪綠過程中起到重要作用(Xie et al.,2014);乙烯響應因子CitERF13與CitPPH基因(葉綠素降解關鍵基因)的啟動子結合,可增強CitPPH基因的轉錄水平,促使葉綠素降解(Yin et al.,2016)。
發明內容
本發明所要解決的技術問題是如何預測待測蘋果果皮葉綠素降解速率。蘋果果皮中葉綠素含量降低,則果皮顏色越紅。
為解決上述技術問題,本發明提供了預測待測蘋果果皮葉綠素降解速率的方法。
本發明所提供的預測待測蘋果果皮葉綠素降解速率的方法,具體可為方法一,可包括如下步驟:檢測待測蘋果的蘋果轉錄因子ERF17自N末端第12位氨基酸殘基開始連續絲氨酸殘基的數目;“蘋果轉錄因子ERF17自N末端第12位氨基酸殘基開始連續絲氨酸殘基的數目為8個(第9個氨基酸殘基為非絲氨酸殘基)和/或蘋果轉錄因子ERF17自N末端第12位氨基酸殘基開始連續絲氨酸殘基的數目為6個(第7個氨基酸殘基為非絲氨酸殘基)”的待測蘋果的果皮葉綠素降解速率大于“蘋果轉錄因子ERF17自N末端第12位氨基酸殘基開始連續絲氨酸殘基的數目為3個(第4個氨基酸殘基為非絲氨酸殘基)”的待測蘋果。
上述方法一中,所述蘋果轉錄因子ERF17為蛋白質,自N端至C端依次可由區段Ⅰ、區段Ⅱ和區段Ⅲ組成;區段Ⅰ的C末端的氨基酸殘基可為T,區段Ⅱ可由3-8個絲氨酸殘基組成,區段Ⅲ的N末端的氨基酸殘基可為M。
所述區段Ⅰ可為如下a1)或a2)或a3):
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