[發明專利]適用于藥物基因組學的生物樣本庫管理系統

在審

• 申請號: 201711008826.2
• 申請日: 2017-10-25
• 公開（公告）號: CN107871061A
• 公開（公告）日: 2018-04-03
• 發明（設計）人: 滕祥云;李琦;張璇;黃少亞;張戈;楊雪佳
• 申請（專利權）人: 長沙三濟生物科技有限公司
• 主分類號: G06F19/28
• 分類號: G06F19/28;G06F19/18
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

技術領域

本發明涉及藥物基因組學領域，具體涉及一種適用于藥物基因組 學的生物樣本庫管理系統。

背景技術

生物樣本庫(Biobank)又被稱為生物銀行，其作用在于對各類生物 樣本的收集、處理、存儲和應用過程進行標準化管理，同時對與樣本 相關各類信息進行管理，如樣本的臨床信息、病人隨訪信息、樣本質 量管理信息等。上個世紀以來，越來越多的生物樣本庫被建立，這些 生物樣本庫在基因組學研究和精準醫療研究紅扮演著越來越重要的 角色。

隨著生物樣本庫的不斷發展狀態，對于生物樣本的管理工作愈顯 繁重，傳統的人工管理方式難以滿足對當前生物樣本庫的管理工作。 同時，樣本庫數據的傳輸和交流也是當前解決的問題，傳統樣本數據 庫分散在不同地區，研究者和管理者難以對樣本的信息進行整合和匯 總統計。

因此，需要提供一種適用于藥物基因組學的生物樣本庫管理系統 以解決上述問題。

發明內容

本發明的目的在于提供一種適用于藥物基因組學的生物樣本庫 管理系統，該系統能實現以藥物分類或基因分類為中心的樣本管理、 在樣本應用服務時能更好地滿足臨床藥物基因組學的需求、以及可結 合疾病信息精準出庫某一用藥患者樣本以提高科研效率。

本發明的技術方案如下：

一種適用于藥物基因組學的生物樣本庫管理系統，包括：

數據庫，包括樣本表型數據庫、疾病分類數據庫、藥物分類數據 庫以及樣本數據庫；

樣本信息采集模塊，用于采集樣本信息，所述樣本信息包括樣本 基本信息以及與被采集樣本對應的疾病信息和用藥信息；

知識庫模塊，包括基因本體單元、疾病ICD-10編碼單元及藥物 ATC編碼單元，所述基因本體單元通過訪問所述樣本表型數據庫以獲 得所述樣本基本信息的標準命名，所述疾病ICD-10編碼單元通過訪 問所述疾病分類數據庫以獲得所述疾病信息的標準命名，所述藥物 ATC編碼單元通過訪問所述藥物分類數據庫以獲得所述用藥信息的標 準命名；

樣本入庫管理模塊，用于根據所述樣本基本信息、所述疾病信息 及所述用藥信息三者的標準命名生成入庫管理信息，并將所述入庫管 理信息以及所述樣本基本信息、所述疾病信息及所述用藥信息三者的 標準命名關聯后儲存于所述樣本數據庫中，所述入庫管理信息包括樣 本編號信息以及儲存位置信息；

樣本出庫管理模塊，用于生成樣本出庫信息以及修改樣本出庫后 的樣本狀態；

樣本應用服務模塊，用于訪問所述樣本數據庫中的所述樣本基本 信息、所述疾病信息及所述用藥信息中的任意一種或幾種，以獲得目 標數據，所述目標數據包括所述入庫管理信息以及與所述入庫管理信 息關聯后的其他數據。

優選地，所述適用于藥物基因組學的生物樣本庫管理系統還包括 樣本質控管理模塊，所述樣本質控管理模塊用于根據入庫后樣本的所 述入庫管理信息將樣本質檢信息與所述入庫管理信息關聯后錄入至 所述樣本數據庫中。

優選地，所述樣本質檢信息包括樣本編號、檢測類別、實驗員信 息、檢測結果以及實驗日期。

優選地，所述樣本編號信息為數字、條碼及二維碼中的任意一種。

優選地，所述樣本信息采集模塊還用于采集樣本擴展信息，所述 樣本入庫管理模塊還用于將所述樣本擴展信息與所述入庫管理信息 關聯后儲存至所述樣本數據庫中，所述樣本擴展信息包括受試者的地 址、姓名、性別及年齡。

優選地，所述樣本信息采集模塊還用于采集樣本處理信息，所述 樣本入庫管理模塊還用于將所述樣本處理信息與所述入庫管理信息 關聯后儲存至所述樣本數據庫中，所述樣本處理信息包括取樣方法、 取樣結果、樣本處理時長、樣本處理情況以及樣本處理條件。

優選地，所述儲存位置信息包括容器信息、凍存架信息、凍存盒 信息以及樣本盒信息。

優選地，所述儲存位置信息以圖形化的方式顯示樣本的儲存位 置。

優選地，所述樣本出庫信息包括出庫單號、申請人信息、申請人 部門、申請用途、申請日期、樣本所屬的項目信息及申請理由。

優選地，所述樣本應用服務模塊還用于導出從所述樣本數據庫查 詢得到的目標數據，所述目標數據包括所述入庫管理信息以及與所述 入庫管理信息關聯后的其他數據。