[發(fā)明專利]一種用于肝癌易感基因早篩的核酸質(zhì)譜的檢測方法

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201710986230.3
• 申請日: 2017-10-20
• 公開（公告）號: CN107557461B
• 公開（公告）日: 2021-02-19
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 尚小云;劉夢梅;刁波
• 申請（專利權(quán)）人: 武漢賽云博生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6858
• 分類號: C12Q1/6858;C12Q1/6886
• 代理公司: 上海精晟知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31253
• 代理人: 馮子玲

1.一種基于MassARRAY質(zhì)譜平臺的肝癌易感相關(guān)基因檢測試劑，其特征在于，包括可用來評估個體罹患肝癌風(fēng)險的特異性和敏感性的基因SNPs的擴增引物和延伸引物、基因突變位點的擴增引物和延伸引物；所述可用來評估個體罹患肝癌風(fēng)險的特異性和敏感性的基因SNPs位點為rs4730775、rs2233682、rs17006625、rs1800630、rs7574865、rs4678680、rs12979860、rs1056836、rs34237608、rs230496、rs1800566、rs28362491、rs17401966、rs4444903、rs2596542、rs648202、rs455804、rs9267673、rs2280883、rs3761549、rs9275319、rs9272105和rs8013403；所述可用來評估個體罹患肝癌風(fēng)險的特異性和敏感性的基因突變位點分別為CTNNB1基因的c.121AG、CTNNB1基因的c.110CG、CTNNB1基因的c.133TC和TP53基因的c.747GT；

所述肝癌易感SNPs基因位點和肝癌易感基因突變位點的PCR引物、延伸引物的序列為：

rs4730775

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGTGAAGGGTGATGGGCAGTTAG-3'

下游5'-ACGTTGGATGGTTTCCAGAGCTAACTCGTG-3'

延伸引物：5'-TTAGCAGACGGCGGA-3'

rs2233682

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGCCGAGTGTACTACTTCAACC-3'

下游5'-ACGTTGGATGTGCCCGTTTTTGCCACCACT-3'

延伸引物：5'-gCACTAACGCCAGCCA-3'

rs17006625

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGACCTTCTTCTCCTTTTGCCG-3'

下游5'-ACGTTGGATGGGGAAGATGAGGTTGAATTG-3'

延伸引物：5'-GCCGGGGCAGTTATCA-3'

rs1800630

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGGCTATGGAAGTCGAGTATGG-3'

下游5'-ACGTTGGATGTTCCATACCTGGAGGTCCTG-3'

延伸引物：5'-GCCCTGTCTTCGTTAAG-3'

rs7574865

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGGAGTGTGTATGCAGTAAAAG-3'

下游5'-ACGTTGGATGAATCCCCTGAAATTCCACTG-3'

延伸引物：5'-GTTGGTGACCAAAATGT-3'

rs4678680

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGCATGGGACTCTGATACAATA-3'

下游5'-ACGTTGGATGTTCTGCCTTGGGTTTGTTC-3'

延伸引物：5'-TGCTTTCTTCCCTTTTCT-3'

rs12979860

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGTCGTGCCTGTCGTGTACTGA-3'

下游5'-ACGTTGGATGAGCGCGGAGTGCAATTCAAC-3'

延伸引物：5'-caCAATTCAACCCTGGTTC-3'

rs1056836

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGTCCTTGTCCAAGAATCGAGC-3'

下游5'-ACGTTGGATGCAACCAGTGGTCTGTGAATC-3'

延伸引物：5'-TCCGGGTTAGGCCACTTCA-3'

rs34237608

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGGTGGAGTCAGACAGATATGG-3'

下游5'-ACGTTGGATGCAGGCACCTGGGAAGACTA-3'

延伸引物：5'-CCTGGGAAGACTAGATGAG-3'

rs230496

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGGACCACATGTCTGGATTTGC-3'

下游5'-ACGTTGGATGTGGGCCACCTTTAAGAGTAG-3'

延伸引物：5'-ggtgAGGTCAGGGGCAAAC-3'

rs28362491

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGTCTATCAGCGGCACTGCCAC-3'

下游5'-ACGTTGGATGTAGGGAAGCCCCCAGGAAG-3'

延伸引物：5'-tCCTGCGTTCCCCGACCATTG-3'

rs1800566

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGTGTGCCCAATGCTATATGTC-3'

下游5'-ACGTTGGATGTTCTGTATCCTCAGAGTGGC-3'

延伸引物：5'-acGGCTTCCAAGTCTTAGAA-3'

rs17401966

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGCCAGCACTTAATGAAAACAC-3'

下游5'-ACGTTGGATGAACCTCTAAGAACACTTGAC-3'

延伸引物：5'-CTAAGAACACTTGACTCAATA-3'

rs4444903

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGTCTTTCAGCCCCAATCCAAG-3'

下游5'-ACGTTGGATGAGAGCAAGGCAAAGGCTTAG-3'

延伸引物：5'-gaaaTGATGGAAAGTTCCAGC-3'

rs2596542

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGTGGGCACATCTTTTCATAGC-3'

下游5'-ACGTTGGATGAATCGTCTCCCAAAGAACAG-3'

延伸引物：5'-atctaCCAAAGAACAGCTACAC-3'

rs648202

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGCCCTTTCTCCCAAAAGGACA-3'

下游5'-ACGTTGGATGATGGATAATCTCCAGAGCCG-3'

延伸引物：5'-cTGTCAAATTCCAAAACTCTCTC-3'

rs455804

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGGAGAAGGTGTGTTGTTTTGC-3'

下游5'-ACGTTGGATGGGCTTGCATGTATTTTGTGG-3'

延伸引物：5'-cAAATCTGTCATAAACTAAGGCA-3'

CTNNB1基因的c.133TC

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGACTGGCAGCAACAGTCTTAC-3'

下游5'-ACGTTGGATGCTCAGGATTGCCTTTACCAC-3'

延伸引物：5'-ACTACCACAGCTCCT-3'

TP53基因的c.747GT

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGCCACCATCCACTACAACTAC-3'

下游5'-ACGTTGGATGTCCAGTGTGATGATGGTGAG-3'

延伸引物：5'-GATGGTGAGGATGGG-3'

rs9267673

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGATGAAGAGCCTCAATGGCTG-3'

下游5'-ACGTTGGATGCACTGTCCAGTGGGAGAGA-3'

延伸引物：5'-ATGGCTGCCTCAACT-3'

rs2280883

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGGAGATGAAGGAGTTGGGATG-3'

下游5'-ACGTTGGATGTGTCAATACACCCCCAACTG-3'

延伸引物：5'-AAGGAAAGGTTGGGAA-3'

rs3761549

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGACATCACCTACCACATCCAC-3'

下游5'-ACGTTGGATGACCCCACAGGTTTCGTTCC-3'

延伸引物：5'-GGTTTCGTTCCGAGAACT-3'

rs9275319

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGACTAGACTAGCGGTCTTCCA-3'

下游5'-ACGTTGGATGAGCCTTCAGTCTGTGGTTG-3'

延伸引物：5'-AGTCTGTGGTTGAAGGTC-3'

rs9272105

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGTATAAGTTTCCTCTGCTTC-3'

下游5'-ACGTTGGATGAGTCCTGTATGCTGATATCC-3'

延伸引物：5'-TCATTAATTTTATGATTGTGAGAG-3'

rs8013403

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGCCTCCAGGGAACAACATACT-3'

下游5'-ACGTTGGATGTTGCTTCTTTCTTTTGTAG-3'

延伸引物：5'-acTTCTTTGGAAGACAGACA-3'

CTNNB1基因的c.121AG

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGACTGGCAGCAACAGTCTTAC-3'

下游5'-ACGTTGGATGCTCAGGATTGCCTTTACCAC-3'

延伸引物：5'-tCATTCTGGTGCCACT-3'

CTNNB1基因的c.110CG

PCR引物：上游5'-ACGTTGGATGACTGGCAGCAACAGTCTTAC-3'

下游5'-ACGTTGGATGCTCAGGATTGCCTTTACCAC-3'

延伸引物：5'-gggcaTGGACTCTGGAATCCATT-3'。