[發明專利]一種與豬腹股溝陰囊疝發生相關的分子標記及應用

有效

• 申請號: 201710936085.8
• 申請日: 2017-10-10
• 公開（公告）號: CN109652557B
• 公開（公告）日: 2022-02-08
• 發明（設計）人: 鄭嶸;鄒丹陽;榮雷;左波;王國水;毛慧敏
• 申請（專利權）人: 華中農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 武漢宇晨專利事務所(普通合伙) 42001
• 代理人: 龔瑩瑩

本發明屬于豬的遺傳標記制備技術領域，具體公開了一種與豬腹股溝/陰囊疝性狀相關的分子標記及應用，該標記從豬PRKCE基因中篩選得到，在SEQ ID NO.1所示序列的230位堿基處發生一個C/T堿基突變,導致Taq^αI?RFLP多態性，利用該SNP位點設計引物，分析該SNP標記與腹股溝/陰囊疝的相關性，發現了豬PRKCE基因第十內含子區內的SNP突變位點與豬腹股溝/陰囊疝性狀顯著相關。本發明為豬標記輔助選擇提供了新的標記資源。

技術領域

本發明屬于豬的標記輔助選擇技術領域，具體涉及一種與豬腹股溝陰囊疝發生相關的分子標記及應用，該分子標記分離自豬PRKCE基因的第十內含子區域。

背景技術

腹股溝陰囊疝是在哺乳動物中普遍存在的一種復雜性疾病，主要表現為腹腔臟器(腸管或網膜)或腹水滲入腹股溝或陰囊內，造成局部膨大凸起。有研究表明，腹股溝/陰囊疝的發生是遺傳和環境因素共同作用的結果，遺傳力由于統計種群的不同而表現出較大變異，一般在0.2-0.6(Gatphayak,et al.Present Situation of PorcineHemiainguinalis/scrotalis in Thailand.The Global FoodProduct Chain—Dynamics,Innovations,Conficts,Strategies.DeutscherTropentag.October 2005.),在純種閉鎖繁殖群中較多發，是一種典型的遺傳缺陷病。該疾病會引起豬只長期食欲不振，消化不良，生長緩慢，影響豬只的使用性能，嚴重時可發生內毒素性休克而造成豬只死亡,給養殖戶造成較大的經濟損失。豬腹股溝/陰囊疝是由多基因控制的復雜遺傳缺陷疾病，豬群的品種、飼養條件和來源差異以及人工表型選擇干預均會使疝氣的發病率表現出較大差異。單純地依靠常規的表型選擇只能小規模地降低患病率，而且需要很長的世代間隔。而以RCR-RFLP、微衛星標記和基因芯片等作為主要研究方法的標記輔助選擇(MAS)技術可以很好地結合了分子抗病與育種，使常規育種獲得了快速進展。

酶切擴增多態性序列(Cleaved Amplified Polymorphism Sequences，CAPS)標記又稱為PCR-RFLP(PCR-restriction fragment length polymorphism)技術，是PCR技術與RFLP技術結合的一種方法。當SNP正好處于限制性內切酶位點上時，可將它轉化為CAPS標記，并通過酶切片段大小的差異來檢查PCR產物的多態性。由于內切酶的高度專一性，對待測的特定片段的針對性很強，只要酶切位點存在突變，在酶切條件合適的情況下就能檢測出來，確認其是否發生了突變，受其他外界干擾因數影響較少，結果穩定，重復性好。作為一種分析速度快，成本低廉，信息量大的分子標記，PCR-RFLP技術已經廣泛地應用于復雜疾病的鑒定，診斷及防治中。