[發(fā)明專利]一種與豬腹股溝陰囊疝發(fā)生相關(guān)的分子標記及應用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201710936085.8
• 申請日: 2017-10-10
• 公開（公告）號: CN109652557B
• 公開（公告）日: 2022-02-08
• 發(fā)明（設計）人: 鄭嶸;鄒丹陽;榮雷;左波;王國水;毛慧敏
• 申請（專利權(quán)）人: 華中農(nóng)業(yè)大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 武漢宇晨專利事務所(普通合伙) 42001
• 代理人: 龔瑩瑩

本發(fā)明屬于豬的遺傳標記制備技術(shù)領(lǐng)域，具體公開了一種與豬腹股溝/陰囊疝性狀相關(guān)的分子標記及應用，該標記從豬PRKCE基因中篩選得到，在SEQ ID NO.1所示序列的230位堿基處發(fā)生一個C/T堿基突變,導致Taq^αI?RFLP多態(tài)性，利用該SNP位點設計引物，分析該SNP標記與腹股溝/陰囊疝的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)了豬PRKCE基因第十內(nèi)含子區(qū)內(nèi)的SNP突變位點與豬腹股溝/陰囊疝性狀顯著相關(guān)。本發(fā)明為豬標記輔助選擇提供了新的標記資源。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于豬的標記輔助選擇技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種與豬腹股溝陰囊疝發(fā)生相關(guān)的分子標記及應用，該分子標記分離自豬PRKCE基因的第十內(nèi)含子區(qū)域。

背景技術(shù)

腹股溝陰囊疝是在哺乳動物中普遍存在的一種復雜性疾病，主要表現(xiàn)為腹腔臟器(腸管或網(wǎng)膜)或腹水滲入腹股溝或陰囊內(nèi)，造成局部膨大凸起。有研究表明，腹股溝/陰囊疝的發(fā)生是遺傳和環(huán)境因素共同作用的結(jié)果，遺傳力由于統(tǒng)計種群的不同而表現(xiàn)出較大變異，一般在0.2-0.6(Gatphayak,et al.Present Situation of PorcineHemiainguinalis/scrotalis in Thailand.The Global FoodProduct Chain—Dynamics,Innovations,Conficts,Strategies.DeutscherTropentag.October 2005.),在純種閉鎖繁殖群中較多發(fā)，是一種典型的遺傳缺陷病。該疾病會引起豬只長期食欲不振，消化不良，生長緩慢，影響豬只的使用性能，嚴重時可發(fā)生內(nèi)毒素性休克而造成豬只死亡,給養(yǎng)殖戶造成較大的經(jīng)濟損失。豬腹股溝/陰囊疝是由多基因控制的復雜遺傳缺陷疾病，豬群的品種、飼養(yǎng)條件和來源差異以及人工表型選擇干預均會使疝氣的發(fā)病率表現(xiàn)出較大差異。單純地依靠常規(guī)的表型選擇只能小規(guī)模地降低患病率，而且需要很長的世代間隔。而以RCR-RFLP、微衛(wèi)星標記和基因芯片等作為主要研究方法的標記輔助選擇(MAS)技術(shù)可以很好地結(jié)合了分子抗病與育種，使常規(guī)育種獲得了快速進展。

酶切擴增多態(tài)性序列(Cleaved Amplified Polymorphism Sequences，CAPS)標記又稱為PCR-RFLP(PCR-restriction fragment length polymorphism)技術(shù)，是PCR技術(shù)與RFLP技術(shù)結(jié)合的一種方法。當SNP正好處于限制性內(nèi)切酶位點上時，可將它轉(zhuǎn)化為CAPS標記，并通過酶切片段大小的差異來檢查PCR產(chǎn)物的多態(tài)性。由于內(nèi)切酶的高度專一性，對待測的特定片段的針對性很強，只要酶切位點存在突變，在酶切條件合適的情況下就能檢測出來，確認其是否發(fā)生了突變，受其他外界干擾因數(shù)影響較少，結(jié)果穩(wěn)定，重復性好。作為一種分析速度快，成本低廉，信息量大的分子標記，PCR-RFLP技術(shù)已經(jīng)廣泛地應用于復雜疾病的鑒定，診斷及防治中。