[發(fā)明專利]一種lncRNA作為生物標(biāo)志物在檢測腸道病毒EV71中的應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201710913071.4
• 申請日: 2017-09-30
• 公開（公告）號: CN107460256B
• 公開（公告）日: 2019-12-20
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 張振杰;史衛(wèi)峰;李娟;周宏
• 申請（專利權(quán)）人: 泰山醫(yī)學(xué)院
• 主分類號: C12Q1/70
• 分類號: C12Q1/70;C12Q1/6883;C12R1/93
• 代理公司: 37232 濟(jì)南千慧專利事務(wù)所(普通合伙企業(yè))
• 代理人: 王寬

本發(fā)明專利申請公開了長鏈非編碼RNA(lncRNA)ENST00000606915，其序列如SEQ ID No.1所示，所述lncRNA可以作為生物標(biāo)志物用于腸道病毒EV71的檢測和診斷，也可用于相關(guān)疾病的早期診斷或判斷疾病的分期分型，為改善疾病的診療及預(yù)后提供了依據(jù)。

技術(shù)領(lǐng)域：

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及l(fā)ncRNA作為生物標(biāo)志物在檢測腸道病毒EV71中的應(yīng)用。

背景技術(shù)：

隨著分子生物學(xué)理論和實(shí)驗(yàn)技術(shù)的迅速發(fā)展，生物標(biāo)志物成為一個非常熱門的研究領(lǐng)域。通過對關(guān)鍵生物大分子如長鏈非編碼RNA(LncRNA)的定量和分析，有助于對疾病的早期診斷或判斷疾病的分期分型，為改善疾病的診療及預(yù)后提供依據(jù)。在候選lncRNA標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和鑒定階段，RNA-Seq或者熒光定量技術(shù)是篩選差異表達(dá)基因的重要方式，能夠在核酸水平分析和鑒定傳染性疾病是將來臨床診斷的研究方向和趨勢。

腸道病毒EV71主要引起手足口病，還可引起無菌性腦膜炎、腦干腦炎和脊髓灰質(zhì)炎樣的麻痹等多種神經(jīng)系統(tǒng)疾病；其中，手足口病和中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染是EV71感染而引起的兩大常見臨床癥狀。目前，針對腸道病毒EV71的檢測，主要通過體外細(xì)胞進(jìn)行分離與培養(yǎng)，結(jié)合Real-time熒光定量RT-PCR檢測病毒核酸，這是臨床上進(jìn)行腸道病毒鑒定的“金標(biāo)準(zhǔn)”，但由于手足口病的特殊性及細(xì)胞培養(yǎng)條件的限制以及無菌操作的要求，使得病毒的分離在普通實(shí)驗(yàn)室中較難以完成。因此，尋找新的生物學(xué)標(biāo)志物成為臨床快速鑒定EV71感染迫切需要解決的問題。

基于熒光定量檢測與EV71感染相關(guān)的標(biāo)志物lncRNA的差異表達(dá)，無需進(jìn)行腸道病毒的分離和培養(yǎng)，檢測成本低、通量高、速度快，一次可以檢測數(shù)百個樣本，并可初步確定病毒感染的嚴(yán)重程度，lncRNA在生物標(biāo)志物的驗(yàn)證環(huán)節(jié)中顯示了較大的優(yōu)越性，再加上血清具有采集安全、生物性穩(wěn)定、存儲方便等特點(diǎn)。所以，如果能在血清中發(fā)現(xiàn)到有價值的特異性標(biāo)志物應(yīng)用于臨床，這將對腸道病毒EV71的檢測以及相關(guān)疾病的預(yù)防、早期診斷及治療帶來極大的幫助。

本發(fā)明運(yùn)用RNA-Seq篩選EV71感染后細(xì)胞中的差異表達(dá)的lncRNA，結(jié)合熒光定量PCR驗(yàn)證篩選的標(biāo)志物lncRNA的差異表達(dá)與EV71感染階段的相關(guān)性，并進(jìn)行差異lncRNA與不同型腸道病毒感染之間的特異性鑒定，從而為腸道病毒EV71的檢測和相關(guān)疾病的診斷提供新的思路。

發(fā)明內(nèi)容：

本發(fā)明一方面公開了一種長鏈非編碼RNA(lncRNA)，所述lncRNA為ENST00000606915，其序列如SEQ ID No.1所示，還公開了上述lncRNA可以作為生物標(biāo)志物用于腸道病毒EV71的檢測和診斷。

另一方面，本發(fā)明所述的lncRNA作為生物標(biāo)志物，其轉(zhuǎn)錄水平的下調(diào)能夠反映受試者感染了腸道病毒EV71，可以作為檢測EV71的指標(biāo)，也可用于診斷受試者是否感染了EV71。

另一方面，本發(fā)明所述的lncRNA作為生物標(biāo)志物，還可用于檢測和/或診斷由于受到腸道病毒EV71感染所導(dǎo)致的疾病，如：手足口病、中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病、無菌性腦膜炎、腦干腦炎和脊髓灰質(zhì)炎樣的麻痹等神經(jīng)系統(tǒng)疾病，優(yōu)選的，可用于疾病的早期診斷或判斷疾病的分期分型，為改善疾病的診療及預(yù)后提供依據(jù)。

另一方面，本發(fā)明提供了所述lncRNA在制備用于檢測和/或診斷腸道病毒EV71或受到腸道病毒EV71感染所致疾病的試劑和/或試劑盒中的用途。

另一方面，本發(fā)明提供了用于檢測和/或診斷腸道病毒EV71或受到腸道病毒EV71感染所致疾病的產(chǎn)品，所述產(chǎn)品包括能夠檢測所述lncRNA表達(dá)的試劑。

本發(fā)明所述能夠檢測所述lncRNA表達(dá)的試劑包括但不限于擴(kuò)增所述lncRNA的引物/引物組、或者能夠與所述lncRNA雜交的探針。