[發(fā)明專利]凝膠模式化的表面有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201710888139.8 | 申請(qǐng)日： | 2014-02-21 |
| 公開（公告）號(hào)： | CN107557269B | 公開（公告）日： | 2022-06-14 |
| 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人： | 史蒂芬·M·巴納德;M·謝恩·鮑恩;瑪麗亞·坎德拉里亞·羅杰特巴奇伽魯普;韋恩·N·喬治;安德魯·A·布朗;詹姆斯·特賽 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人： | 伊魯米那股份有限公司 |
| 主分類號(hào)： | C12M1/00 | 分類號(hào)： | C12M1/00;C12Q1/6837 |
| 代理公司： | 北京安信方達(dá)知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11262 | 代理人： | 李平;鄭霞 |
| 地址： | 美國加利*** | 國省代碼： | 暫無信息 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 凝膠 模式 表面 | ||
本申請(qǐng)涉及凝膠模式化的表面。提供了一種陣列，所述陣列包括具有表面的固體支撐體，所述表面具有多個(gè)孔，所述孔含有凝膠材料，所述孔被表面上的空隙區(qū)彼此分開，所述空隙區(qū)將所述孔的每一個(gè)中的凝膠材料與其他多個(gè)孔中的凝膠材料分離；和所述凝膠材料中的靶標(biāo)核酸的文庫，其中所述孔的每一個(gè)中的凝膠材料包含所述文庫的靶標(biāo)核酸的單一物質(zhì)。還提供了用于制備和使用陣列的方法。
本申請(qǐng)是申請(qǐng)日為2014年02月21日，申請(qǐng)?zhí)?01480007014.4，發(fā)明名稱為“凝膠模式化的表面”的申請(qǐng)的分案申請(qǐng)。
本申請(qǐng)要求2013年2月26日提交的美國臨時(shí)申請(qǐng)?zhí)?1/769,289和2013年3月6日提交的美國申請(qǐng)?zhí)?3/787,396的權(quán)益。以上申請(qǐng)的每一個(gè)在此通過引用以其整體被并入。
本公開內(nèi)容一般涉及固相分析化學(xué)并且對(duì)用于高通量基因組分析的核酸陣列具有特定的適用性。
將人類遺傳變異編目和將此變異與對(duì)疾病的敏感性相關(guān)聯(lián)的任務(wù)堅(jiān)持從基因組廣泛測序方法學(xué)的發(fā)展中獲益。此編目嘗試為鑒定每一個(gè)人的基因組中的標(biāo)志物帶來希望，其將有助于醫(yī)學(xué)專業(yè)人士確定該人對(duì)疾病的敏感性、對(duì)例如處方藥物的特定治療的響應(yīng)性、對(duì)危險(xiǎn)藥物副作用的敏感性和其他醫(yī)學(xué)上可操作的特征。編目嘗試正在順利進(jìn)行中。這很大程度上是由于商業(yè)上可得的基因組測序方法學(xué)，該方法學(xué)是足夠具有成本有效的以允許在研究環(huán)境中測試被評(píng)價(jià)的受試者。需要測序方法學(xué)的改進(jìn)以加速編目嘗試。此外，測序的相對(duì)高成本阻止了技術(shù)超越研究中心并進(jìn)入診所，其中醫(yī)生可以獲得一般人群中患者的序列。
測序方法學(xué)和用于實(shí)施其的系統(tǒng)利用復(fù)雜的技術(shù)集合。這些技術(shù)的一些中的改進(jìn)已經(jīng)顯示提供大幅度成本降低。然而，難以預(yù)測哪些(如果有的話)對(duì)成本降低改進(jìn)負(fù)有責(zé)任。考慮到測序系統(tǒng)中的技術(shù)之間的依賴性，甚至更加難以預(yù)測哪些可以被修改而對(duì)方法學(xué)或系統(tǒng)的整體性能沒有不利影響。因此，對(duì)鑒定可以給診所帶來基因組研究的希望的改進(jìn)存在需要，在診所中生命可以被改善并且在許多情況下被拯救。本發(fā)明滿足這種需要并且也提供相關(guān)優(yōu)勢。
本公開內(nèi)容提供了一種陣列，所述陣列包括具有表面的固體支撐體，所述表面具有多個(gè)孔，所述孔含有凝膠材料，所述孔被所述表面上的空隙區(qū)彼此分開，所述空隙區(qū)將所述孔的每一個(gè)中的凝膠材料與其他多個(gè)孔中的凝膠材料分離；和所述凝膠材料中的靶標(biāo)核酸的文庫，其中所述孔的每一個(gè)中的凝膠材料包含所述文庫的靶標(biāo)核酸的單一物質(zhì)(species)。
在一些實(shí)施方案中，基底被配置為孔的陣列并且分析物是核酸。相應(yīng)地，本公開內(nèi)容提供了一種陣列，所述陣列包括具有表面的固體支撐體，所述表面具有多個(gè)孔，所述孔含有凝膠材料，所述孔被所述表面上的空隙區(qū)彼此分開，所述空隙區(qū)將所述孔的每一個(gè)中的凝膠材料與其他多個(gè)孔中的凝膠材料分離；和所述凝膠材料中的靶標(biāo)核酸的文庫，其中所述孔的每一個(gè)中的凝膠材料包含所述文庫的靶標(biāo)核酸的單一物質(zhì)。
本公開內(nèi)容還提供了制備基底的方法。所述方法可包括以下步驟：(a)提供具有平面表面的固體支撐體，其中所述平面表面被一個(gè)或更多個(gè)凹特征中斷并且其中所述平面表面上的一個(gè)或更多個(gè)空隙區(qū)形成所述一個(gè)或更多個(gè)凹特征的邊界；(b)用凝膠材料包被至少一部分固體支撐體，其中所述部分包括至少一個(gè)凹特征和至少一個(gè)空隙區(qū)；以及(c)拋光所述平面表面以從所述至少一個(gè)空隙區(qū)移除所述凝膠材料并且維持所述凝膠材料在至少一個(gè)凹特征中。
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