[發(fā)明專利]長鏈非編碼RNA lnc-ALVE1-AS1 表達檢測引物及試劑盒有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710883276.2 | 申請日: | 2017-09-26 |
| 公開(公告)號: | CN107488750B | 公開(公告)日: | 2019-11-05 |
| 發(fā)明(設計)人: | 崔恒宓;胡序明;陳世豪 | 申請(專利權)人: | 揚州大學 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京知識律師事務所 32207 | 代理人: | 盧亞麗 |
| 地址: | 225009 *** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 引物 表達檢測 試劑盒 熒光定量PCR檢測 非編碼RNA 鏈特異性 長鏈 分子生物學領域 規(guī)律分析 禽白血病 生產實踐 可用 檢測 研究 | ||
本發(fā)明屬于分子生物學領域,具體涉及一種長鏈非編碼RNA lnc?ALVE1?AS1表達檢測引物及試劑盒。所述引物包括鏈特異性RT引物和熒光定量PCR檢測引物;其中鏈特異性RT引物的序列如SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.9所示;熒光定量PCR檢測引物的序列如SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11所示。本研究發(fā)明還提供了lnc?ALVE1?AS1表達檢測試劑盒,為lnc?ALVE1?AS1表達規(guī)律分析提供了方法和基礎,在生產實踐可用于檢測雞群的禽白血病天然免疫狀態(tài)。
技術領域
本發(fā)明屬于分子生物學領域,具體涉及一種長鏈非編碼RNAlnc-ALVE1-AS1表達檢測引物及試劑盒。
背景技術
內源性反轉錄病毒(endogenous retroviruses)是基因組成分,被認為源于進化中感染生物體的反轉錄病毒。作為遠古反轉錄病毒感染在宿主體內的殘留,加之過去對它的功能不夠了解,曾將其視為垃圾DNA(Junk DNA)。直至最近有研究表明,某些內源性反轉錄病毒不僅對早期胚胎發(fā)育和胚胎干細胞的多能性具有重要作用,還可能與細胞天然免疫有關。
最新研究發(fā)現(xiàn),內源性反轉錄病毒轉錄物是長鏈非編碼RNA(long non-codingRNA, lncRNA)的重要來源,具有激活干擾素應答反應的潛能。事實上,lncRNA在細胞生物學調控中的作用越來越受到重視,在抗病毒天然免疫中也具有重要調節(jié)作用。內源性反轉錄病毒衍生的lncRNA在對抗外源性反轉錄病毒增殖的作用機制將逐漸被闡明,有望成為抵抗外源性病毒的新型疫苗或免疫增強劑。
禽內源性白血病病毒ALVE是最早發(fā)現(xiàn)的內源性反轉錄病毒,可能與宿主免疫應答和遺傳抗性有關。特別是,來源于雞1號染色體上的內源性反轉錄病毒ALVE1(長度為7.5kb)與禽白血病病毒高度同源,可能與禽白血病病毒的感染和增殖具有一定關聯(lián)。
發(fā)明內容
本發(fā)明通過高通量測序在雞基因組中鑒定出一條禽內源性反轉錄病毒ALVE1衍生的反義長鏈非編碼RNA,命名為lnc-ALVE1-AS1。研究表明,lnc-ALVE1-AS1可以激活細胞抗病毒干擾素應答反應并抑制與其高度同源的外源性J亞群禽白血病病毒增殖。因此,進一步了解 lnc-ALVE1-AS1在不同抗性品系雞中的表達規(guī)律顯得尤為重要。本發(fā)明的目的是提供一種能檢測lnc-ALVE1-AS1表達的檢測引物及試劑盒。
本發(fā)明提供了一種用于長鏈非編碼RNA lnc-ALVE1-AS1表達檢測的引物,包括鏈特異性RT引物和熒光定量PCR檢測引物;所述鏈特異性RT引物的序列如SEQ ID NO.8和SEQID NO.9所示;所述熒光定量PCR檢測引物的序列如SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11所示。
本發(fā)明進一步公開了上述引物在制備lnc-ALVE1-AS1表達檢測試劑盒中的應用。
一種長鏈非編碼RNAlnc-ALVE1-AS1表達檢測試劑盒,包括鏈特異性RT引物、逆轉錄試劑、熒光定量PCR檢測引物和定量PCR檢測試劑;所述鏈特異性RT引物的序列如SEQ IDNO.8 和SEQ ID NO.9所示;所述熒光定量PCR檢測引物的序列如SEQ ID NO.10和SEQ IDNO.11 所示。
本發(fā)明提供的檢測lnc-ALVE1-AS1表達規(guī)律的表達檢測試劑盒,為檢測lnc-ALVE1-AS1 的表達規(guī)律提供了研究方法和基礎。此外,在生產實踐可用于檢測雞群的禽白血病天然免疫狀態(tài)。
附圖說明
圖1是lnc-ALVE1-AS1熒光定量PCR檢測結果圖。
圖2是lnc-ALVE1-AS1在雞1號染色體上的位置示意圖。
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