[發明專利]一種包含基因突變的DNA鑒定親權指數的計算方法有效
| 申請號: | 201710839552.5 | 申請日: | 2017-09-18 |
| 公開(公告)號: | CN107748837B | 公開(公告)日: | 2021-05-04 |
| 發明(設計)人: | 汪軍;周密;王留柳;張韓秋;張科 | 申請(專利權)人: | 安徽工程大學 |
| 主分類號: | G16B30/00 | 分類號: | G16B30/00 |
| 代理公司: | 北京風雅頌專利代理有限公司 11403 | 代理人: | 楊紅梅 |
| 地址: | 241000 安*** | 國省代碼: | 安徽;34 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 包含 基因突變 dna 鑒定 指數 計算方法 | ||
1.一種包含基因突變的DNA鑒定親權指數的計算方法,其特征在于,快速掃描確定符合遺傳規律與基因突變不符合遺傳規律,并根據掃描結果快速計算親權指數,本方法通過概率理論方法重組與添加傳統的符合遺傳規律與基因突變不符合遺傳規律各種狀態計算公式,并將計算公式標識為字符串符號表;在鑒定過程中,對被鑒定者采用試劑盒檢測的常染色體每一個STR基因座的基因型,采用自掃描字符遞增法生成判定字符串,用字符串匹配的方法快速選擇計算公式,計算單基因座的基因型的親權指數,最后再求出多基因座的累計親權指數;
該方法包括以下步驟:
步驟1.對二聯體與三聯體鑒定中雙親與孩子的單基因座基因型排列組合,重組單基因座的親權指數(PI)計算公式,設計每個公式的計算函數;
步驟2.建立判定字符串與計算功能函數表映射表;將步驟1設計的每個PI計算函數名作為一個字符串,用字符串定位函數與求子串函數得到每個函數名字符串下劃線之后的子串,作為判定字符串,將判定字符串與對應的函數地址一一對應,根據鑒定類型分5個類別建立判定字符串與計算功能函數表映射表IdentifyStrPICalTable;
步驟3.輸入的二聯體或者三聯體鑒定類型,并輸入二聯體雙親-孩子基因數或者三聯體兩個雙親-孩子基因數的單基因座的數據;
步驟4.由于一對基因座的數據無先后關系,根據輸入的鑒定類型,排列單基因座的數據的先后關系,對于二聯體有四種排列,三聯體有八種排列;
步驟5.取匹配的計算函數,根據基因數搜索基因頻率數據庫中的每個基因數的等位基因頻率獲得計算函數的參數,計算出計算親權指數PI;
步驟6.二聯體、三聯體累積親權指數的計算,所述步驟6親子鑒定的STR基因座的親權指數使用累積親權指數定量評價,通過公式或計算。
2.根據權利要求1所述的一種包含基因突變的DNA鑒定親權指數的計算方法,其特征在于,所述步驟3中二聯體雙親-孩子基因數或者三聯體兩個雙親-孩子基因數的單基因座的數據,二聯體母子鑒定為15/15,16/17;三聯體親母疑父鑒定為15/16,15/17,17/17。
3.根據權利要求1所述的一種包含基因突變的DNA鑒定親權指數的計算方法,其特征在于,所述步驟4采用自掃描輸入的基因型的排列,字符串字符遞增法生成判定字符串算法。
4.根據權利要求1所述的一種包含基因突變的DNA鑒定親權指數的計算方法,其特征在于,所述步驟4包括以下步驟:
步驟4.1取雙親-孩子等位基因數的一種排列為一數組,設定初始的遞增字符A,從數組第一個數開始對每個等位基因數數組中每個數進行自掃描輸入;
步驟4.2如果這個數之前的已經掃描過的數中出現該數,則這個數的判斷字符與該數的字符相同,轉步驟4.3;如果這個數之前的所有數中沒有出現該數,則這個數的判斷字符為遞增字符,遞增字符加1,轉步驟4.3;
步驟4.3取等位基因數數組的下一個數,如果下一個數不存在,轉步驟4.4;如果存在轉步驟4.2,繼續;
步驟4.4將每個基因數數組中的數轉換成的判斷字符順序連接成一個字符串,則該字符串即為判定字符串;
步驟4.5在步驟2中建立的映射表IdentifyStrPICalTable中搜索,如果搜索到匹配的計算函數轉步驟5計算親權指數PI;如果這個等位基因數排列都不匹配,則轉步驟4.1,測試下一種排列;二聯體的四種排列或者三聯體有八種排列都未搜素到匹配的,則該基因座無法計算,親權指數設為1,不參與計算。
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