[發明專利]一種利用SSR分子標記鑒定栽培茄與野生茄種間雜交F1 有效
| 申請號: | 201710759409.5 | 申請日: | 2017-08-30 |
| 公開(公告)號: | CN107447012B | 公開(公告)日: | 2021-03-16 |
| 發明(設計)人: | 楊旭;劉飛;張宇;成玉富 | 申請(專利權)人: | 揚州大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6858 | 分類號: | C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 南京鐘山專利代理有限公司 32252 | 代理人: | 戴朝榮;鄭慧娟 |
| 地址: | 225009 江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 利用 ssr 分子 標記 鑒定 栽培 野生 間雜 base sub | ||
1.一種利用SSR分子標記鑒定栽培茄與野生茄種間雜交F1雜種的方法,其特征在于,包括以下步驟:
步驟一:種間雜交F1雜種及其親本的DNA提取;
步驟二:建立SSR反應體系及擴增反應程序:利用SSR標記引物emg01J09和emh21J12進行雜種鑒定,所述雜種為:迷你茄×赤茄、蘇州牛角×赤茄、西安綠茄×旋花茄、迷你茄×紅茄、迷你茄×旋花茄或蘇州牛角×旋花茄的F1雜交后代,引物emg01J09-F具有SEQID NO.1的核苷酸序列;引物emg01J09-R具有SEQID NO.2的核苷酸序列;引物emh21J12-F具有SEQIDNO.3的核苷酸序列;引物emh21J12-R具有SEQID NO.4的核苷酸序列;
步驟三:聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測;
步驟四:雜交種真實性的鑒定;在雜交后代的擴增產物中,是否具有父母本互補型或父本型條帶,若有則為真雜交種,反之,則為假雜交種。
2.如權利要求1所述的利用SSR分子標記鑒定栽培茄與野生茄種間雜交F1雜種的方法,其特征在于,步驟一中,以親本和雜交種植株的葉片為材料,提取DNA;提取的DNA用1%的瓊脂糖凝膠電泳進行純度的檢測。
3.如權利要求2所述的方法,其特征在于,所述DNA樣品置于-20℃保存。
4.如權利要求1所述的利用SSR分子標記鑒定栽培茄與野生茄種間雜交F1雜種的方法,其特征在于,步驟二中,所述SSR反應體系:6.7μl ddH2O,1.0μl 10×Buffer,0.2μl dNTPs,1.0μl 引物,0.1μl rTaq聚合酶、1.0μl DNA模板。
5.如權利要求1所述的利用SSR分子標記鑒定栽培茄與野生茄種間雜交F1雜種的方法,其特征在于,步驟二中,擴增反應程序為:94℃預變性5min;94℃變性5min,55~60℃退火30s,72℃延伸45s,進行35個循環;最后72℃充分延伸10min,4℃保存。
6.如權利要求1所述的利用SSR分子標記鑒定栽培茄與野生茄種間雜交F1雜種的方法,其特征在于,步驟三中,電泳檢測具體步驟為:擴增產物在6%的非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,每個樣品取1.4μl和0.7μl Loading Buffer混合點樣,以DL500 DNA Maker為對照,在180V恒壓下,電泳1.5h,隨后進行銀染觀察。
7.如權利要求6所述的利用SSR分子標記鑒定栽培茄與野生茄種間雜交F1雜種的方法,其特征在于,銀染具體步驟如下:
(1) 用自來水將電泳槽和四塊玻璃板沖洗干凈,放在操作臺上自然蒸干;
(2) 按照長板外短板內的順序,將玻璃板垂直安裝到電泳槽上,擰緊;然后用1.0%瓊脂膠封住底部,待用;
(3) 將模具傾斜45°,用搖晃均勻后的6%聚丙烯酰胺凝膠,緩緩倒入玻璃板的縫隙,至模具頂部為止;隨后迅速插上梳子,仔細觀察是否有氣泡殘留,確定好后,室溫放置1~2h進行凝固;
(4) 凝固好后,放到加滿1×TBE電泳緩沖液的電泳槽中,小心地拔出梳子,避免氣泡產生,隨后點樣,然后進行電泳;
(5) 結束后,緩緩倒出緩沖液,取下膠板,從玻璃板中取出凝膠,先放入固定液中輕搖2~3min;在染色液中輕晃3~5min;再在蒸餾水中漂洗2~3次,每次時間不超過15s;隨后放到顯影液中輕輕搖晃,直至條帶出現;最后觀察后拍照分析。
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