[發明專利]一種基于高通量測序檢測非小細胞肺癌致癌基因突變的多重PCR引物、試劑盒和方法有效
| 申請號: | 201710732983.1 | 申請日: | 2017-08-23 |
| 公開(公告)號: | CN107723354B | 公開(公告)日: | 2021-09-07 |
| 發明(設計)人: | 林釗;張燕菲;張紀斌;何廣良;周艷河;何銘輝 | 申請(專利權)人: | 廣州永諾健康科技有限公司;廣州永諾醫學檢驗所有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6869 | 分類號: | C12Q1/6869;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州三環專利商標代理有限公司 44202 | 代理人: | 宋靜娜;郝傳鑫 |
| 地址: | 510000 廣東省廣州市*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 基于 通量 檢測 細胞 肺癌 致癌 基因突變 多重 pcr 引物 試劑盒 方法 | ||
1.一種基于高通量測序構建非小細胞肺癌致癌基因文庫的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)第一輪PCR擴增:以待檢樣本的基因組DNA為模板,用擴增引物混合液 R1-barcode、R2-barcode 分別進行 PCR 擴增,獲得第一輪PCR產物,所述R1- barcode包括SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:98所示的引物,所述R2-barcode包括SEQ ID NO:99~SEQ ID NO:196所示的引物;序列如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO: 196所示的引物為帶barcode序列的下游引物;所述引物的5’端具有接頭序列,所述引物的3’端具有特異性引物序列;所述barcode序列位于所述接頭序列和所述特異性引物序列之間,所述barcode序列是序列長度為10bp的DNA序列;
(2)第二輪PCR擴增:將步驟(1)中由R1-barcode擴增獲得的PCR產物用擴增引物混合液F1-non barcode以及通用的下游引物進行PCR擴增,將步驟(1)中由R2-barcode擴增獲得的PCR產物用擴增引物混合液F2-non barcode以及通用的下游引物進行PCR擴增,所述F1-nonbarcode包括SEQ ID NO:197~SEQ ID NO:294所示的引物,所述F2-non barcode包括SEQID NO:295~SEQ ID NO:392所示的引物,所述通用的下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:393所示;序列如SEQ ID NO:197~SEQ ID NO: 392所示的引物為不帶barcode的上游引物;
(3)第三輪PCR擴增:將步驟(2)獲得的PCR 產物混合后純化,再用接頭引物進行第三輪PCR擴增,得到測序文庫。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟(3)中接頭引物為用于Illumina測序儀測序文庫構建的接頭引物。
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