[發明專利]漢族人群家族性擴張型心肌病的篩查試劑盒

有效

• 申請號: 201710732660.2
• 申請日: 2017-08-24
• 公開（公告）號: CN107475259B
• 公開（公告）日: 2020-08-11
• 發明（設計）人: 舒先紅;王小林;周年偉;秦勝梅;仇子龍;張翼;潘翠珍;趙維鵬
• 申請（專利權）人: 復旦大學附屬中山醫院
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C07K14/47;C12Q1/6883;A61K48/00;A61K38/17;A61P9/00
• 代理公司: 上海卓陽知識產權代理事務所(普通合伙) 31262
• 代理人: 巫蓓麗

本發明涉及漢族人群家族性擴張型心肌病的篩查試劑盒。本發明運用二代測序技術，通過外顯子捕獲富集全基因組DNA編碼序列，發現了擴張型心肌病相關的致病基因及致病突變，包括：Chmp4c基因c.488AG突變、LMNA基因c.961CT突變和MYH7基因c.2458GC突變，基于此提供了檢測以上突變的擴張型心肌病篩查試劑盒。應用本發明的試劑盒能夠提高擴張型心肌病患者早期檢出率，有利于早期預防和治療，提高患者生存率。

技術領域

本發明涉及生物醫學的疾病診斷技術領域，具體地說，涉及漢族人群家族性擴張型心肌病致病基因及突變位點的發現，和基于該致病基因及突變位點的擴張型心肌病篩查試劑盒。

背景技術

隨著二代測序技術(Next-Generation Sequencing，NGS)的出現，特別是與外顯子組捕獲技術相結合的NGS能快速準確的了解基因序列信息，極大地幫助我們了解遺傳性疾病，通過對家族相關基因的比對分析，能夠較準確地發現致病基因及突變。

擴張型心肌病(Dilated Cardiomyopathy，DCM)是以左心室或雙心室擴大，心室收縮功能障礙、心室壁變薄為主要特點的一種原發性心肌病，是導致心源性猝死和心力衰竭的主要原因。通過在患者家族中進行相關致病基因的研究發現，家族遺傳所占的比例較高。家族性DCM的臨床表型存在異質性，攜帶同一致病基因的家系不同成員之間的臨床表現不盡相同，這可能與年齡，性別，基因突變的部位、類型等因素有關。根據以往研究報道統計，由于受限于檢測技術以及對DCM整體認識水平，家族性DCM相關致病基因及突變檢出率不到30％。經典的Sanger測序法準確性高，但檢測序列的長度有限，效率較低，僅適用于篩選已知致病基因突變位點，很大程度上阻礙了DCM的致病基因檢測。由于不同人種的遺傳信息可能有差異，目前遺傳分析中使用的數據歐美人群占很大的比例，漢族人群的數據較少，因此需要在漢族人群中近一步篩查研究。

專利文獻CN1824776A，公開日2006.08.30，公開了目前已經有8個染色體定位與擴張型心肌病有關，并已確定了7個主要致病基因，包括：肌動蛋白(Actin)、肌營養不良蛋白(Dystrophy)、tafazzin、橋粒蛋白(Desmin)、δ-sarcoglycan、SCN5A和Lamin A/C，該發明還發現LMNA基因中G244A突變或者lamin A蛋白質中E82K突變會導致患者疾病如心臟疾病特別是擴張型心肌病的發生，基于此，提供了診斷患者疾病(如心臟疾病特別是擴張型心肌病)或者確定患者對疾病(如心臟疾病特別是擴張型心肌病)的遺傳易感性的方法，所述方法包括檢測來自所述患者的樣品的LMNA基因中第244位G突變如G244A突變的存在或者lamin A蛋白質中第82位E突變如E82K突變的存在。專利文獻CN103509867A，公開日2014.01.15，篩選出中國漢族人群最易感的4個散發性擴張型心肌病致病基因：MYBPC3、SCN5A、MYH7和MYPN，基于此開發出對中國漢族人群散發性擴張型心肌病有效的早期診斷方法和診斷試劑盒，有效提高擴張型心肌病患者早期檢出率，從而做到早期治療，提高患者生存率。

然而，發現新的致病基因及突變位點對于提高擴張型心肌病的篩查準確率來說仍然是十分必要的。

發明內容

本申請發明人運用二代測序技術發現了漢族人群家族性擴張型心肌病新的致病基因及突變位點，基于此完成了本發明。

第一方面，本發明提供一種分離的編碼突變體的核酸分子或其片段，所述的核酸分子或其片段選自下列中的任一種：

d)與SEQ ID NO:1相比，具有c.488AG突變；

e)與SEQ ID NO:7相比，具有c.961 CT突變；

f)與SEQ ID NO:13相比，具有c.2458 GC突變。

第二方面，本發明提供了一種分離的多肽或其片段，所述的多肽或其片段選自下列中的任一種：