[發明專利]用于診治骨肉瘤的長鏈非編碼RNA標志物

有效

• 申請號: 201710723968.0
• 申請日: 2017-08-22
• 公開（公告）號: CN107475386B
• 公開（公告）日: 2018-08-21
• 發明（設計）人: 楊承剛;石小峰
• 申請（專利權）人: 固安博健生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11;A61K45/00;A61P35/00
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本發明提供一種長鏈非編碼RNA及其應用。本發明的研究表明LINP1在骨肉瘤組織中和在癌旁組織中的表達存在顯著差異，據此認為LINP1可以作為診斷骨肉瘤的分子標志物。根據LINP1在骨肉瘤組織中呈現低水平表達，在骨肉瘤細胞中過表達LINP1，研究LINP1在骨肉瘤中的作用，結果表明過表達LINP1能夠明顯抑制骨肉瘤細胞的增殖。本發明揭示了LINP1在骨肉瘤發病機制中的重要作用，也為骨肉瘤的臨床診斷、治療和預后監測提供了新的分子標記和藥物靶點。

技術領域

本發明屬于生物醫學領域，涉及用于診治骨肉瘤的長鏈非編碼RNA標志物。

背景技術

骨肉瘤是來源于間葉組織的惡性腫瘤，其主要致病特征為體內增殖的腫瘤細胞直接形成未成熟骨或骨樣組織。是一種人類骨骼系統最常見的原發性惡性腫瘤。典型的骨肉瘤是一種罕見的(占全部惡性腫瘤的0.2％)高致癌惡性腫瘤，其發病率約每年每一百萬人里有三例。骨肉瘤主要出現在較長的骨骼以及少部分的軟組織。其主要發病人群集中在10～20歲青少年，具有發病率高，早期轉移率高，治愈生存率低等特點。X-射線，斷層攝影技術，核磁共振，血管造影技術以及動態骨閃爍攝影技術等廣泛應用于該病的診斷、腫瘤發生的程度及手術類型判斷等等。但是利用上述臨床手段進行骨肉瘤的診斷，常常導致患者的病情延誤，錯過最佳治療時期。因此尋找一種骨肉瘤早期診斷標志物是亟待解決的問題。

人體中編碼蛋白質的基因大約有2-3萬個，僅占人類基因組的2％，其余98％不編碼蛋白質的基因組DNA最初被認為是沒有功能的，是生物體中的垃圾，通常被稱為“垃圾DNA”。但目前的研究表明，這些垃圾DNA大多可轉錄產生非編碼RNA(non-coding RNA，ncRNA)。根據成熟轉錄本大小的不同，ncRNA可分為小分子ncRNA(如siRNA，miRNA，piRNA等)，中等長度ncRNA(70-200nt)和長ncRNA(long ncRNA，LncRNA，>200nt)。

目前，ncRNA領域研究較多的是小分子ncRNA，而對LncRNA的研究還處于起步階段。由于序列內部存在過多的終止密碼子，LncRNA不能被翻譯成蛋白質，他們通常是以RNA轉錄本的形式行使其生物學功能，如發育過程中的細胞分化、細胞增殖、細胞凋亡和類固醇代謝等。

最近的研究發現LncRNA與肺癌、非霍杰金淋巴瘤、皮膚T細胞淋巴瘤和慢性淋巴細胞白血病等腫瘤疾病有關。這表明LncRNA與細胞的癌變有著極為密切的聯系，LncRNA在細胞增殖、分化和癌變中發揮著重要的作用。目前，已經克隆的人類lncRNAs基因已超過4萬多個，但絕大部分lncRNA的功能未知。

目前，有關LncRNA在骨肉瘤的發病機制、疾病診斷及治療方面的研究基本空白，因此本申請利用生物信息學分析研究探討LncRNA在骨肉瘤的發病機制、疾病診斷及治療方面的的作用，同時為后續深入研究提供實驗基礎及研究方向。

發明內容

本發明的目的在于提供一種用于診治骨肉瘤的長鏈非編碼RNA標志物。本發明利用芯片和QPCR實驗證明LINP1在骨肉瘤組織中的表達水平明顯低于在癌旁組織中的水平，因此可以將LINP1作為診斷骨肉瘤的分子標志物。

為了實驗上述目的，本發明采用了如下技術方案：

本發明提供了檢測長鏈非編碼RNA表達的試劑在制備骨肉瘤輔助診斷或預后預測產品中的應用；所述長鏈非編碼RNA的Gene ID：108570035。

本發明的長鏈非編碼RNA在NCBI中的命名為LINP1。LINP1的Genbank登錄號NR_138480.1，具有838bp的長度，相應的DNA序列如SEQ ID NO.1所示。

進一步，所述試劑包括利用SYBR Green、TaqMan探針、分子信標、雙雜交探針、或復合探針檢測LINP1表達量時使用的PCR擴增引物。