[發明專利]一種在27個群體中識別中國青藏高原藏族群體個體的方法和系統

有效

• 申請號: 201710713359.7
• 申請日: 2017-08-18
• 公開（公告）號: CN107400713B
• 公開（公告）日: 2020-06-30
• 發明（設計）人: 江麗;李彩霞;趙雯婷;劉京;黃美莎
• 申請（專利權）人: 公安部物證鑒定中心
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 北京同立鈞成知識產權代理有限公司 11205
• 代理人: 彭雪瑞;黃健

1.一種在27個群體中識別中國青藏高原藏族群體個體的方法，其特征在于，該方法包括：

1)提取個體的DNA；

2)獲得所述DNA的87個藏族特異高原適應SNP位點的基因型，所述87個藏族特異高原適應SNP位點為：rs10178633、rs10193827、rs10206434、rs1109285、rs1109286、rs11122280、rs11125068、rs115321619、s116062164、rs116611511、rs11675232、rs11675441、rs11689011、rs11805033、rs12467821、rs13003074、rs13006131、rs13419896、rs13424253、rs1374749、rs141366568、rs141426873、rs142826801、rs1447563、rs149306391、rs150877473、rs1562453、rs17034950、rs17035010、rs17035013、rs1867784、rs1868092、rs1992846、rs2066140、rs2121266、rs2153364、rs2244986、rs2275279、rs2486729、rs2486736、rs2486745、rs2491412、rs2739506、rs2739513、rs2790880、rs2790882、rs2808611、rs3088359、rs369097672、rs3768729、rs4450662、rs480902、rs4953342、rs4953343、rs4953353、rs4953354、rs4953357、rs4953359、rs4953360、rs4953372、rs55981512、rs58160876、rs61151542、rs6679627、rs6712143、rs6715787、rs6756667、rs73926263、rs73926264、rs73926265、rs74898705、rs7534248、rs7565341、rs7571218、rs7582701、rs7583088、rs7583392、rs7583554、rs7586141、rs7589621、rs7590087、rs7594278、rs76347095、rs78569471、rs9679290、rs982414以及rs9973653；

3)將所述各藏族特異高原適應SNP位點的基因型利用STRUCTURE軟件獲得所述個體的群體遺傳成分分析結果，根據該結果識別該個體是否為中國青藏高原藏族群體個體；

所述27個群體為岡比亞西部人群、塞拉利昂的門德人群、尼日利亞伊巴丹的約魯巴人群、肯尼亞盧西亞人群、尼日利亞艾森人群、美國西部黑人群、加勒比海巴巴多斯島人群、秘魯利馬人群、哥倫比亞麥德林的哥倫比亞人群、波多黎各人群、美國洛杉磯的墨西哥人群、美國猶他州的北歐和西歐后裔、芬蘭的芬蘭人群、蘇格蘭和英格蘭的英國人群、西班牙的伊比利亞人群、意大利的塔斯卡尼亞人群、孟加拉的孟加拉人群、巴基斯坦的旁遮普人群、德克薩斯州休斯頓的古吉拉特語系印度人群、英國的印度泰盧固人群、英國的斯里蘭卡泰米爾人群、日本東京地區的日本人群、中國北京漢族人群、中國南方漢族人群、越南京族人群、中國西雙版納傣族人群以及中國青藏高原藏族人群。

2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，2)包括采用與所述87個藏族特異高原適應SNP位點一一對應的87對擴增引物對其進行擴增以獲得擴增產物的步驟；以及使用與所述87個藏族特異高原適應SNP位點一一對應的87條延伸引物對所述擴增產物進行延伸以獲得延伸產物的步驟。

3.根據權利要求2所述的方法，其特征在于，所述擴增引物為序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.174的核苷酸序列；所述延伸引物為序列表中SEQ ID No.175至SEQ ID No.261的核苷酸序列。

4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，其中2)還包括在獲得延伸產物后，使用基因分型系統分析該延伸產物，以獲得所述87個藏族特異高原適應SNP位點的基因型的步驟。