[發明專利]親緣關系鑒定方法、系統、計算機設備及可讀存儲介質有效
| 申請號: | 201710692106.6 | 申請日: | 2017-08-14 |
| 公開(公告)號: | CN107609343B | 公開(公告)日: | 2019-11-08 |
| 發明(設計)人: | 劉晶星;燕啟江;詹益鑫;喻長順;胡朝暉 | 申請(專利權)人: | 廣州金域司法鑒定技術有限公司 |
| 主分類號: | G16B20/40 | 分類號: | G16B20/40;G16B40/00 |
| 代理公司: | 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224 | 代理人: | 林青中 |
| 地址: | 510330 廣東省廣州市海珠區*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 親緣 關系 鑒定 方法 系統 計算機 設備 可讀 存儲 介質 | ||
本發明公開了一種親緣關系鑒定方法、系統、計算機設備及可讀存儲介質。該親緣關系鑒定方法通過軟件自動計算各種情況下的PI值,進而得到總的親權指數。通過本發明的親緣關系鑒定方法、系統、計算機設備及可讀存儲介質可自動進行各種二聯體或三聯體親緣關系鑒定,無需人工操作,計算效率高且準確率高。
技術領域
本發明涉及遺傳工程領域,尤其是涉及一種親緣關系鑒定方法、系統、計算機設備及可讀存儲介質。
背景技術
遺傳學理論已證實,子女的基因組DNA各有一半分別來源于親生父母一方。親緣關系鑒定就是依據遺傳學的基本原理,采用現代化的DNA分型檢測技術來綜合評判爭議個體之間是否存在親生、隔代或其他血緣關系。目前親緣關系鑒定包括以下幾類:
(1)常規的親生血緣關系鑒定:這是目前需求量最大的一類親權關系鑒定,包括父母子三方(又稱為三聯體)、父子(或母子)雙方(又稱為二聯體)的親權鑒定。
(2)隔代親緣關系鑒定:這類鑒定指要確認曾祖父母、祖父母、與曾孫子(曾孫女)、孫子(孫女)之間的親緣關系。此外,還包括單純的父系親緣關系鑒定如要確認曾祖父、祖父、與曾孫子、孫子之間的親緣關系,以及單純的母系親緣關系鑒定如要確認曾祖母,外祖母,與外孫女,曾外孫女之間的親緣關系。
(3)疑難的親緣關系鑒定:除上述兩類外,還有一些比較疑難的親緣關系鑒定,如父母皆疑(無)的同胞(兄弟、兄妹、姐弟、姐妹)、表兄妹關系的鑒定,叔侄之間、姨和外甥女之間、舅舅與外甥(外甥女)之間的親緣關系鑒定等。
其中,三聯體或二連體親緣關系鑒定是最常見的。親緣關系鑒定目前最常用的方法是通過檢測基因組中STR片段并對其分型,通過匹配父-子,母-子,或父-母-子的分型結果來判斷是否有親緣關系。在獲取分型結果后需要進行比較并計算親權指數(PI值),并匯總各個STR位點的PI值得到總CPI值,計算方法及其復雜,有數十種情況,每種情況都對應不同的計算公式,尤其是樣本出現STR突變情況下的親權指數計算,涉及的情況非常之多。傳統的對于有突變的親權指數只能手動計算,而這其中涉及幾十種情況和公式,手動計算對實驗員要求很高,且錯誤率非常高并費時費力。
發明內容
基于此,有必要提供一種能夠快速、準確計算親權指數的親緣關系鑒定方法、系統、計算機設備及可讀存儲介質。
一種親緣關系鑒定方法,包括如下步驟:
步驟S1:接收親緣關系鑒定的類別的輸入指令,若是二聯體親緣關系鑒定,則進入步驟S21;若是三聯體親緣關系鑒定,則進入步驟S22;
步驟S21:獲取孩子與假設親本的二聯體STR分型數據,進入步驟S3;
步驟S22:獲取孩子、母親與假設父的三聯體STR分型數據,進入步驟S4;
步驟S3:逐個計算每個STR的PI值,進入步驟S5,對于每個STR的PI值計算具體包括如下步驟:
步驟S31:判斷假設親本的基因型中是否具有與孩子相同的等位基因,若有,則進入步驟S32;否則進入步驟S33;
步驟S32:按照如下公式計算無突變情況下的該STR的PI值:
PI=(m×M/p+n×N/q)/2
其中,M與N分別為孩子基因型中等位基因P和Q在該基因型中的概率,p與q分別為等位基因P和Q在人群中的基因頻率,m與n分別為假設親本基因型中等位基因P與Q的數目;
步驟S33:判斷假設親本是男性還是女性,若是男性的假設父,則進入步驟S331,若是女性的假設母,則進入步驟S332;
步驟S331:按照如下公式計算考慮假設親本突變情況下的該STR的PI值:
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