[發(fā)明專利]一種兒童膿毒性休克預(yù)后預(yù)測的建模方法及系統(tǒng)

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201710661510.7
• 申請日: 2017-08-04
• 公開（公告）號: CN107480441B
• 公開（公告）日: 2021-02-09
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 方芳
• 申請（專利權(quán)）人: 方芳
• 主分類號: G16H50/50
• 分類號: G16H50/50
• 代理公司: 北京品源專利代理有限公司 11332
• 代理人: 鞏克棟

1.一種基于支持向量機的兒童膿毒性休克預(yù)后預(yù)測的建模系統(tǒng)，其特征在于，包括：

(1)數(shù)據(jù)收集模塊：用于在GEO數(shù)據(jù)源內(nèi)收集膿毒性休克基因表達(dá)的高通量數(shù)據(jù)；

(2)數(shù)據(jù)預(yù)處理模塊：與所述數(shù)據(jù)收集模塊相連，用于對高通量數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理和數(shù)據(jù)匯總，得到預(yù)處理后數(shù)據(jù)；

(3)篩選模塊：與所述數(shù)據(jù)預(yù)處理模塊相連，從預(yù)處理后數(shù)據(jù)中篩選出相對于存活組在死亡組中異常表達(dá)的基因，得到兒童膿毒性休克預(yù)后不良的異常表達(dá)基因數(shù)據(jù)集；

(4)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換模塊：與所述篩選模塊相連，用于對兒童膿毒性休克預(yù)后不良的異常表達(dá)基因數(shù)據(jù)集進(jìn)行格式轉(zhuǎn)換，形成訓(xùn)練生物標(biāo)記數(shù)據(jù)集，所述格式轉(zhuǎn)換為通過Perl程序?qū)和摱拘孕菘祟A(yù)后不良的異常表達(dá)基因數(shù)據(jù)集轉(zhuǎn)換為符合R程序進(jìn)行特征選擇的數(shù)據(jù)格式；

(5)特征篩選模塊：與所述數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換模塊相連，對訓(xùn)練生物標(biāo)記數(shù)據(jù)集進(jìn)行特征篩選，采用R程序，構(gòu)造特征排序系數(shù)，對訓(xùn)練生物標(biāo)記數(shù)據(jù)集的每次迭代去掉一個排序系數(shù)最小的特征，最終得到所有特征的遞減排序，選出使兒童膿毒性休克預(yù)后預(yù)測準(zhǔn)確度達(dá)到最高的最少特征的集合，即用于模型構(gòu)建的特征集合；

(6)模型建立模塊：與所述特征篩選模塊相連，使用所述特征集合和訓(xùn)練生物標(biāo)記數(shù)據(jù)集，采用支持向量機算法，使用R程序中的kernlab程序包構(gòu)建兒童膿毒性休克預(yù)后預(yù)測模型，根據(jù)訓(xùn)練生物標(biāo)記數(shù)據(jù)集中屬于所述特征集合部分的數(shù)據(jù)子集運行支持向量機算法，訓(xùn)練得到高斯核函數(shù)的參數(shù)σ和支持向量機的錯誤懲罰因子C，然后構(gòu)建兒童膿毒性休克預(yù)后預(yù)測模型；所述高斯核函數(shù)的參數(shù)σ為0.05-0.5，所述支持向量機的錯誤懲罰因子C為8-15。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述高斯核函數(shù)的參數(shù)σ為0.08-0.3，所述支持向量機的錯誤懲罰因子C為9-13。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述高斯核函數(shù)的參數(shù)σ為0.11-0.13，所述支持向量機的錯誤懲罰因子C為10-11。