[發明專利]一種組蛋白免疫共沉淀(ChIP)試劑配方在審
| 申請號: | 201710660025.8 | 申請日: | 2017-08-04 |
| 公開(公告)號: | CN109387623A | 公開(公告)日: | 2019-02-26 |
| 發明(設計)人: | 李旦 | 申請(專利權)人: | 蘇州同因生物科技有限公司 |
| 主分類號: | G01N33/531 | 分類號: | G01N33/531;G01N33/543 |
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| 地址: | 215500 江蘇省蘇州市常熟高新技*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 組蛋白 免疫共沉淀 試劑配方 實例研究 基因型 配方 檢測 保證 | ||
本發明涉及一種組蛋白免疫共沉淀(ChIP)試劑配方,包含五步,本發明的有益成果為:本發明提供的一種組蛋白免疫共沉淀試劑配方,本發明的方法在經過實例研究后。本發明的配方會綜合被檢測者基因型和組蛋白信息,通過復雜的步驟保證試劑的質量。
技術領域
本發明涉及醫學領域,涉及一種組蛋白免疫共沉淀(ChIP)試劑配方。
背景技術
免疫共沉淀(ChIP)是一種能真實反映細胞內組蛋白與DNA相互作用的實驗技術。其原理是利用抗原抗體反應,通過用特異性抗體將目的蛋白及與之結合的DNA共同沉淀下來,再采用PCR、蛋白質分析技術、生物芯片技術等對目的DNA片段進行分析。組蛋白免疫共沉淀是表觀遺傳學研究的主要內容。
發明內容
有鑒于此,本發明提供一種解決或部分解決上述問題的組蛋白免疫共沉淀(ChIP)試劑配方。
為達到上述技術方案的效果,本發明的技術方案為:一種組蛋白免疫共沉淀(ChIP)試劑配方,包含:
(1)進行蛋白-DNA交聯和裂解細胞:用終濃度為1%甲醛溶液固定總數為1×107的K562細胞,室溫下放置10min,甘氨酸溶液中止反應;用預冷的PBS洗滌細胞兩次,離心去上清后加入1ml含蛋白酶抑制劑的SDS裂解液裂解細胞;
(2)超聲斷裂染色質:按優化好的條件(100W,每次超聲10s,共5次,間隔30s)斷裂細胞裂解液中的染色質,4℃下離心后保留上清;
(3)免疫共沉淀:超聲處理后的溶液中加入蛋白G-瓊脂糖小珠進行預清除,離心后吸取1%(v/v)上清留作Input溶液在剩余的上清中加入免疫共沉淀抗體,包括陽性對照抗體(anti-RNA Polymerase II,1.0μg/管)、陰性對照抗體(normal mouse IgG,1.0μg/管)和目的抗體(依抗體說明書推薦量:抗ac H3抗體10μg/管,抗ac H4抗體3μg/管),在4℃搖床上孵育過夜,次日溶液中加入蛋白G-瓊脂糖小珠吸附免疫沉淀復合物,短暫離心后去上清,順次用低鹽、高鹽、氯化鋰和TE緩沖液清洗蛋白G-瓊脂糖小珠;
(4)免疫沉淀復合物洗脫:用洗脫緩沖液洗脫免疫沉淀復合物,同時在裝有Input溶液的管中加入相同體積的洗脫緩沖液;
(5)蛋白-DNA結合物解交聯,釋放DNA:加入5mol/L Na Cl溶液,65℃水浴孵育4-5h或過夜;
(6)用DNA純化柱回收DNA。
本發明的有益成果為:本發明提供的一種組蛋白免疫共沉淀試劑配方,本發明的方法在經過實例研究后。本發明的配方會綜合被檢測者基因型和組蛋白信息,通過復雜的步驟保證試劑的質量。
具體實施方式
為了使本發明所要解決的技術問題、技術方案及有益效果更加清楚明白,以下結合實施例,對本發明進行詳細的說明。應當說明的是,此處所描述的具體實施例僅用以解釋本發明,并不用于限定本發明,能實現同樣功能的產品屬于等同替換和改進,均包含在本發明的保護范圍之內。具體方法如下:
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