[發明專利]基因測序的圖像處理方法及系統及計算機可讀存儲介質

有效

• 申請號: 201710607295.2
• 申請日: 2017-07-24
• 公開（公告）號: CN107945150B
• 公開（公告）日: 2021-11-09
• 發明（設計）人: 徐偉彬;金歡;顏欽;姜澤飛
• 申請（專利權）人: 深圳市真邁生物科技有限公司
• 主分類號: G06T7/00
• 分類號: G06T7/00;G06T7/11;G06T7/136;G06T5/00
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種基因測序的圖像處理方法，其特征在于，包括：

圖像預處理步驟，所述圖像預處理步驟分析輸入的待處理圖像以獲得去噪圖像，所述圖像處理方法包括簡化步驟，所述簡化步驟將所述去噪圖像簡化為二值化圖像，所述待處理圖像包含至少一個亮點，所述亮點具有至少一個像素點；

亮點檢測步驟，所述亮點檢測步驟包括步驟：

分析所述待處理圖像以計算亮點判定閾值，

分析所述去噪圖像以獲取候選亮點，

根據所述亮點判定閾值判斷所述候選亮點是否為所述亮點，包括：在所述二值化圖像中查找大于(p*p-1)連通的像素區域并將查找到的所述像素區域的中心像素點作為所述候選亮點的中心，p為自然數且為大于1的奇數；

判斷所述候選亮點的中心是否滿足條件：I_max*A_BI*ceof_guassT，其中，I_max為p*p窗口的中心最強強度，A_BI為p*p窗口中所述二值化圖像中為設定值所占的比率，ceof_guass為p*p窗口的像素和二維高斯分布的相關系數，T為所述亮點判定閾值，所述設定值選自所述二值化圖像的值，

若滿足上述條件，判斷所述候選亮點的中心對應的亮點為所述亮點，

若不滿足上述條件，棄去所述候選亮點的中心對應的亮點。

2.根據權利要求1所述的基因測序的圖像處理方法，其特征在于，所述亮點檢測步驟還包括步驟：

若判斷結果為是，計算所述亮點的亞像素中心坐標和/或所述亞像素中心坐標的強度值，

若判斷結果為否，丟棄所述候選亮點。

3.根據權利要求1或2所述的基因測序的圖像處理方法，其特征在于，所述圖像預處理步驟包括圖像濾波步驟，所述圖像濾波步驟對所述待處理圖像進行濾波以獲取所述去噪圖像。

4.根據權利要求3所述的基因測序的圖像處理方法，其特征在于，所述圖像濾波步驟對所述待處理圖像進行墨西哥帽濾波。

5.根據權利要求4所述的基因測序的圖像處理方法，其特征在于，在進行墨西哥帽濾波時，使用m*m窗口對所述待處理圖像進行高斯濾波，對高斯濾波后的待處理圖像進行二維拉普拉斯銳化，m為自然數且為大于1的奇數。

6.根據權利要求3所述的基因測序的圖像處理方法，其特征在于，在所述圖像濾波步驟之前，所述圖像預處理步驟還包括減背景步驟，所述減背景步驟對所述待處理圖像進行減背景處理，獲得減背景圖像。

7.根據權利要求6所述的基因測序的圖像處理方法，其特征在于，對所述待處理圖像進行減背景處理，包括：

利用開運算確定所述待處理圖像的背景，

根據所述背景對所述待處理圖像進行減背景處理。

8.根據權利要求1所述的基因測序的圖像處理方法，其特征在于，所述簡化步驟根據所述去噪圖像獲取信噪比矩陣，并根據所述信噪比矩陣簡化所述去噪圖像以得到所述二值化圖像。

9.根據權利要求1、2、8任一項所述的基因測序的圖像處理方法，其特征在于，所述分析所述待處理圖像以計算亮點判定閾值的步驟，包括：

通過大津法處理所述待處理圖像以計算所述亮點判定閾值。

10.根據權利要求2所述的基因測序的圖像處理方法，其特征在于，計算所述亮點的亞像素中心坐標和/或所述亞像素中心坐標的強度值的步驟，包括：

采用二次函數插值計算所述亮點的亞像素中心坐標，和/或采用二次樣條插值計算所述亞像素中心坐標的強度值。

11.根據權利要求2或10所述的基因測序的圖像處理方法，其特征在于，所述基因測序的圖像處理方法還包括步驟：

利用標識標示出所述亮點的亞像素中心坐標所在圖像的位置。