[發明專利]光敏保護基保護的5-醛基胞嘧啶亞磷酰胺單體及其制備方法和寡聚核苷酸的合成和應用有效
| 申請號: | 201710600724.3 | 申請日: | 2017-07-21 |
| 公開(公告)號: | CN107474091B | 公開(公告)日: | 2019-08-23 |
| 發明(設計)人: | 周傳政;席真;李鳳超;章映茜;白靜 | 申請(專利權)人: | 南開大學 |
| 主分類號: | C07H19/073 | 分類號: | C07H19/073;C07H1/00;C07H21/04;C07H21/00 |
| 代理公司: | 北京潤平知識產權代理有限公司 11283 | 代理人: | 嚴政;劉依云 |
| 地址: | 300071*** | 國省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 光敏 保護 胞嘧啶 亞磷酰胺 單體 及其 制備 方法 核苷酸 合成 應用 | ||
1.一種光敏保護基保護的5-醛基胞嘧啶亞磷酰胺單體,其特征在于,其化學結構式為:
其中,R為甲基或苯基,“DMTrO-”為二甲氧基三苯甲基,“N(iPr)2-”為N,N-二異丙基胺基;
其中,所述光敏保護基為1-(2-硝基苯基)丙烷-1,3-二醇。
2.權利要求1所述的光敏保護基保護的5-醛基胞嘧啶亞磷酰胺單體的制備方法,其特征在于,該方法包括以下步驟:
(1)將3′,5′-(特丁基二甲基硅基)-5-醛基-2′-脫氧胞嘧啶、1-(2-硝基苯基)丙烷-1,3-二醇、原甲酸三乙酯和二氯甲烷進行第一混合后冷卻,形成第一混合溶液;再將所述第一混合溶液與四氯化鈦進行反應;然后將反應后得到的有機相洗滌、干燥、過濾、柱層析得到反應產物;
(2)將所述反應產物與四丁基氟化銨和四氫呋喃進行第二混合,形成第二混合溶液,然后將所述第二混合溶液旋蒸除去溶劑,柱層析得到5-[4-(2-硝基苯基)-1,3-二氧六環-2-基]-2′-脫氧胞嘧啶;
(3)將所述5-[4-(2-硝基苯基)-1,3-二氧六環-2-基]-2′-脫氧胞嘧啶與三甲基氯硅烷、吡啶進行第三混合,形成第三混合溶液;再將所述第三混合溶液與乙酸酐進行反應;然后將反應后得到的有機相洗滌、干燥、過濾、柱層析得到4-N-酰基-5-[4-(2-硝基苯基)-1,3-二氧六環-2-基]-2′-脫氧胞嘧啶;
(4)將所述4-N-酰基-5-[4-(2-硝基苯基)-1,3-二氧六環-2-基]-2′-脫氧胞嘧啶與4,4'-二甲氧基三苯基甲基氯、吡啶進行反應,然后將反應后得到的有機相洗滌、干燥、過濾、柱層析得到5′-(二甲氧基三苯甲基)-4-N-乙酰基-5-[4-(2-硝基苯基)-1,3-二氧六環-2-基]-2′-脫氧胞嘧啶;
(5)將所述5′-(二甲氧基三苯甲基)-4-N-酰基-5-[4-(2-硝基苯基)-1,3-二氧六環-2-基]-2′-脫氧胞嘧啶與雙(二異丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦、1H-四唑和二氯甲烷進行反應,將反應后得到的溶液旋蒸除去溶劑,然后進行柱層析;
其中,在步驟(1)中,所述1-(2-硝基苯基)丙烷-1,3-二醇、所述3′,5′-(特丁基二甲基硅基)-5-醛基-2′-脫氧胞嘧啶、所述原甲酸三乙酯、所述二氯甲烷和所述四氯化鈦的用量的摩爾比為1mmol:(3-5)mmol:(1.2-1.5)mmol:(5-7)mL:(0.4-0.5)mmol;
所述第一混合的條件包括:溫度為18-25℃,時間為0.5-1小時,攪拌速度為250-500轉/分鐘;
所述冷卻的條件包括:溫度為0-4℃,時間為0.1-0.5小時,攪拌速度為250-500轉/分鐘;以及
所述四氯化鈦以滴加的方式加入所述第一混合溶液中,且步驟(1)所述的反應過程包括兩個階段,第一階段的反應條件包括:溫度為18-25℃,時間為5-7小時,攪拌速度為250-500轉/分鐘,所述四氯化鈦的滴加速率為10滴/分鐘;以及第二階段的反應條件包括:溫度為18-25℃,時間為5-7小時,攪拌速度為250-500轉/分鐘,所述四氯化鈦的滴加速率為15滴/分鐘;
其中,在步驟(2)中,所述3′,5′-(特丁基二甲基硅基)-5-醛基-2′-脫氧胞嘧啶、所述四丁基氟化銨和所述四氫呋喃的用量的比為1mmol:(3-4)mmol:(5-7)mL;以及
所述第二混合的條件包括:溫度為18-25℃,時間為9-11小時,攪拌速度為250-500轉/分鐘;
其中,在步驟(3)中,所述5-[4-(2-硝基苯基)-1,3-二氧六環-2-基]-2′-脫氧胞嘧啶與所述三甲基氯硅烷、所述吡啶和所述乙酸酐的用量的比為1mmol:(5-7)mmol:(9-11)mL:(1.1-1.3)mmol;以及
所述第三混合的條件包括:溫度為18-25℃,時間為1-2小時,攪拌速度為250-500轉/分鐘;以及所述反應的條件包括:溫度為18-25℃,時間為3-5小時,攪拌速度為250-500轉/分鐘;
其中,在步驟(4)中,所述4-N-酰基-5-[4-(2-硝基苯基)-1,3-二氧六環-2-基]-2′-脫氧胞嘧啶與4,4'-二甲氧基三苯基甲基氯、吡啶的用量的比為1mmol:(1.5-2)mmol:(9-11)mL;以及
所述反應的條件包括:溫度為18-25℃,時間為12-18小時,攪拌速度為250-500轉/分鐘;
其中,在步驟(5)中,所述5′-(二甲氧基三苯甲基)-4-N-酰基-5-[4-(2-硝基苯基)-1,3-二氧六環-2-基]-2′-脫氧胞嘧啶與雙(二異丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦、1H-四唑和二氯甲烷的用量的比為1mmol:(1.3-1.6)mmol:(1.3-1.6)mmol:(10-30)mL;以及
所述反應的條件包括:溫度為18-25℃,時間為2-4小時,攪拌速度為250-500轉/分鐘。
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