[發(fā)明專利]腺病毒腫瘤診斷法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710561603.2 | 申請日: | 2013-03-14 |
| 公開(公告)號: | CN107267554A | 公開(公告)日: | 2017-10-20 |
| 發(fā)明(設計)人: | C·奧謝;C·帕沃斯 | 申請(專利權(quán))人: | 薩克生物研究學院 |
| 主分類號: | C12N15/861 | 分類號: | C12N15/861;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 永新專利商標代理有限公司72002 | 代理人: | 區(qū)斌 |
| 地址: | 美國加*** | 國省代碼: | 暫無信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 病毒 腫瘤 診斷 | ||
本申請為申請日為2013年3月14日、申請?zhí)枮?01380014047.7、發(fā)明名稱為“腺病毒腫瘤診斷法”的發(fā)明專利申請的分案申請。
相關(guān)申請的交叉引用
本申請要求于2012年3月14日提交的美國臨時申請No.61/610,970的優(yōu)先權(quán),所述臨時申請為了所有目的全文納入本文。
對聯(lián)邦政府資助研發(fā)做出的發(fā)明的權(quán)利的聲明
本發(fā)明是在美國國家衛(wèi)生研究院授予的政府支持的基金R01HG004876、R21RR024453和R43RR031424下進行的。政府對本發(fā)明擁有某些權(quán)利。
背景技術(shù)
細胞從實體瘤擴散到身體遠端的被稱為轉(zhuǎn)移的過程造成了所有腫瘤相關(guān)的死亡的90%以上。起源于原發(fā)性腫瘤的細胞可進入循環(huán)系統(tǒng)并流動以侵入遠離原發(fā)性腫瘤的器官和組織并在其中定殖和增殖。因此,這些循環(huán)腫瘤細胞(CLC)的檢測為轉(zhuǎn)移性癌細胞的早期鑒定和治療靶向提供了寶貴的機會(Cristofanilli,2004;de Bono,2008)。目前用于檢測CTC的技術(shù)包括反轉(zhuǎn)錄酶-聚合酶鏈式反應(RT-PCR)、流式細胞術(shù)、熒光原位雜交以及最近的微流體技術(shù)。遺憾的是,RT-PCR不能區(qū)分活的轉(zhuǎn)移性CTC和源于原發(fā)性腫瘤的核酸或細胞片段。
基于抗體的技術(shù)不能用于檢測所有癌癥,而僅能檢測那些表達最常見的和被很好地表征的標記物的癌癥。當前系統(tǒng)的CTC計數(shù)(enumeration)僅提供了一層關(guān)于癌癥診斷的信息。已經(jīng)證明(Veridex,Raridan NJ)裝置取得了CTC分析的商業(yè)成功并且其被FDA批準用于乳腺、前列腺和結(jié)腸,然而在卵巢、直腸和肺中的使用還有待批準。所述系統(tǒng)的局限性包括:(a)依賴于EpCAM的表達水平(Punnoose EA,等人,PLoS ONE.2010;5(9):e12517),(b)不使用間充質(zhì)標記物(Punnoose EA,等人,PLoS ONE.2010;5(9):e12517),(c)依賴于抗體親和力用來捕獲(Nagrath S,等人,Nature,2007;450(7173):1235-9.18097410),以及最重要的(d)缺少CTC表型特征。
沒有任何抗體具有100%的腫瘤或組織特異性,而且抗體既結(jié)合活的CTC也可以結(jié)合死的CTC。因此需要更敏感的、更加特異的以及可應用更加廣泛的檢測血液中非常少量的CTC的技術(shù)。另外,急需開發(fā)新的診斷劑和工具,其不僅能檢測和捕獲CTC還能對它們的惡性潛能進行定量以及“預先”確定在切除個體患者的腫瘤中最有效療法。
盡管癌癥在基因組范圍內(nèi)具有復雜性和可變性,但是共同點是它們都具有生長失調(diào)的表型,即所謂的癌癥標志,這是由相對少量的關(guān)鍵途徑發(fā)生突變而引起的。申請人沒有將重心放在檢測大量的且在腫瘤之間高度可變的單個基因損傷上,而是構(gòu)建了診斷性病毒,所述病毒在其基因組中整合了多個轉(zhuǎn)錄和分子模塊以感染和檢測患者的腫瘤,報告腫瘤的分子“標志”以及“預先”報告腫瘤對不同療法的反應。使用這些試劑,任何給定腫瘤的分子損傷和惡性特征可被快速識別(24小時以內(nèi))并可通過標準化自動平臺來評分。另外,這些試劑也能作為報告分子以快速且直接地測定患者的腫瘤是否可能對具體治療產(chǎn)生反應。
發(fā)明內(nèi)容
在一方面,提供了檢測受試者中癌癥的方法。所述方法包括給予受試者重組報告性腺病毒。使所述重組報告性腺病毒感染受試者中的癌細胞從而形成報告病毒感染的癌細胞。從受試者中獲得含有所述報告病毒感染的癌細胞的樣品并檢測所述報告病毒感染的癌細胞,從而檢測了所述受試者中的癌癥。
在另一方面,提供了檢測受試者中癌癥的方法。所述方法包括從受試者中獲得含有癌細胞的樣品。使重組報告性腺病毒與所述癌細胞接觸。使所述重組報告性腺病毒感染所述癌細胞從而形成報告病毒感染的癌細胞,檢測所述報告病毒感染的癌細胞從而檢測了所述受試者中的癌癥。
在另一方面,提供了確定測試化合物是否抑制了來自癌癥患者的癌細胞的生長的方法。所述方法包括從受試者中獲得含有癌細胞的樣品。將重組報告性腺病毒與所述癌細胞接觸。使所述重組報告性腺病毒感染所述癌細胞從而形成報告病毒感染的癌細胞。使所述報告病毒感染的癌細胞生長足夠的時間。測定所述報告病毒感染的癌細胞的生長水平并將所述水平與對照水平對比,其中與對照水平相比的低水平表明所述測試化合物抑制了來自所述患者的細胞癌的生長。
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