[發明專利]用于人的23個STR位點的復合擴增系統、試劑盒及其用途

有效

• 申請號: 201710530885.X
• 申請日: 2017-07-03
• 公開（公告）號: CN107557475B
• 公開（公告）日: 2020-06-30
• 發明（設計）人: 李生斌;伏東科;熊文娟;李棟;曾柳眉;李波
• 申請（專利權）人: 深圳華大法醫科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 深圳鼎合誠知識產權代理有限公司 44281
• 代理人: 孫銀行;彭家恩

一種用于人的23個STR位點的復合擴增系統、試劑盒及其用途，同時擴增23個基因座D10S1248、D5S818、D21S11、D1S1656、AMEL、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、D19S433、D22S1045、D2S441、D12S391、D2S1338、D18S1364、SE33、Penta D、D11S2368、D13S325、D6S1043、Penta E、Y?indel和Y?GATA?H4，既能夠滿足中華民族遺傳多態性又兼容國外核心位點，具有高多態性、高穩定性，信息量大、準確性高的特點，能夠很好地用于個體識別、親權鑒定、群體遺傳學分析和/或構建人類DNA數據庫中。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，尤其涉及人類基因組中具有多態性的遺傳標記基因的檢測技術，特別涉及用聚合酶鏈式反應在一個復合擴增系統中同時擴增23個基因座的系統、檢測試劑盒及其用途。

背景技術

短串聯重復序列(short tandem repeat，STR)是一類廣泛存在于真核生物基因組中的分子遺傳標記。其信息量大，約占整個基因組的10％。一般由2～6個堿基構成核心重復單元，核心單元重復次數在不同個體間存在差異，具有較高的多態性并遵循孟德爾遺傳定律。此外，STR片段較小，約在70～500bp左右，易于擴增，適用于一些微量或降解檢材。因此，基于STR的擴增檢測技術被廣泛應用于法醫個體識別、親權鑒定、群體遺傳學分析及構建人類DNA數據庫等。

目前，STR復合擴增因其包含信息量大、靈敏度高、檢測速率快等優點已成為法醫學個體識別、親權鑒定及群體遺傳分析的主要技術手段，被廣泛應用于全球各地實驗室的DNA分析鑒定，尤其在一些刑偵案件中，相關部門通過構建犯罪分子及嫌疑人的DNA數據庫，并通過DNA數據的比對和排查就能夠為一些特殊刑事案件的偵破提供有力證據，如一些連環案及串并案。

早期的STR復合擴增包含的位點太少，一般在10個STR位點左右，無法滿足在個體識別和親權鑒定中需要的遺傳信息量。為此，國內外廠家紛紛增加位點數目，從而提高相關試劑盒的個體識別及非父排除率，如國外ABI公司的Identifiler^TM、Sinofiler^TM、GlobalFiler^TM以及Promega公司的PowerPlex 16和PowerPlex 21；國內基點認知公司的Goldeneye 25A，閱微基因公司的MicroReader^TM 21D，中德美聯公司的AGCU Expressmarker22，寧波海爾施基因科技有限公司的STRtyper-21G等。

然而，這些商用試劑盒大多都是在美國CODIS標準規定的13個核心位點(vWA、D21S11、D18S51、D5S818、D7S820、D13S317、D16S539、FGA、D8S1179、D3S1358、CSF1PO、THO1、TPOX)的基礎上增加其他位點，但13個核心位點是針對西方人群的，其中部分位點在中國人群中多態性低，如位點TPOX和TH01。其中，TPOX在中華民族中主要以8、9和11三個等位基因為主，其多態性遠低于南非人群；TH01在中華民族中則主要以6、7和9三個等位基因為主。且TPOX和TH01兩個位點的個體識別率(DP)、排除率(EP)、雜合度(He)以及多態信息量(PIC)等法醫學參數也低于其他位點。另外，部分位點在中華民族群體中的突變率過高，如位點D18S51、CSF1PO、D8S1179、VWA和FGA5。這些位點在中華民族群體中易出現錯誤及丟峰的情況，突變率也高于其他位點。其中FGA的突變率為0.25％。因此，上述13個CODIS位點并不完全適合用于中華民族群體。

隨著全球各種族的交流愈來愈頻繁，STR復合擴增試劑盒在應用終端的應用越來越廣泛，應用終端對試劑盒的信息量、兼容性、準確性及靈敏度要求越來越高。

因此，選取既滿足中華民族遺傳多態性又部分兼容國外核心位點的高多態性、高穩定性的合適位點，增加位點數目等對提高試劑盒的信息量、準確性及兼容性具有重要的意義。

發明內容