[發明專利]基因檢測產品探針分管組合的優化方法、裝置及系統

有效

• 申請號: 201710506936.5
• 申請日: 2017-06-28
• 公開（公告）號: CN109147869B
• 公開（公告）日: 2021-10-22
• 發明（設計）人: 楊韓雁;葉亦舟;李英丹
• 申請（專利權）人: 上海思路迪生物醫學科技有限公司
• 主分類號: G16B25/20
• 分類號: G16B25/20;G16B50/00
• 代理公司: 北京慧智興達知識產權代理有限公司 11615
• 代理人: 韓龍;郭群

1.一種基因檢測產品探針分管組合的優化方法，其特征在于，所述方法包括：

獲取基因檢測產品對應基因組合的覆蓋區域信息以及探針分管集合中各個探針分管的探針分管信息，所述探針分管信息包括探針分管所包含的探針和各個探針所對應的基因檢測區域；

利用預設的探針分管組合優化模型，根據所述覆蓋區域信息和探針分管信息確定優化后的探針分管組合結果，所述探針分管組合結果為構建所述探針分管組合所需要的目標探針分管，其中，在所述探針分管組合優化模型中，覆蓋區域作為約束條件，覆蓋區域的最小值作為優化目標，探針分管是否應用在所述基因檢測產品的探針分管組合作為所述探針分管組合優化模型的輸出結果。

2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法還包括：

將得到的所述探針分管組合結果發送給用戶終端。

3.根據權利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述方法還包括：

若利用預設的探針分管組合優化模型，根據所述覆蓋區域信息和探針分管信息，無法得到探針分管組合結果時，則在所述探針分管集合中添加探針分管；

利用預設的探針分管組合優化模型，根據所述覆蓋區域信息和更新后的探針分管集合中各個探針分管的探針分管信息，確定優化后的探針分管組合結果。

4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，所述獲取基因檢測產品對應基因組合的覆蓋區域信息以及探針分管集合中各個探針分管的探針分管信息，包括：

從預先設置的數據庫中獲取所述覆蓋區域信息和所述探針分管信息。

5.根據權利要求4所述的方法，其特征在于，所述方法還包括:

將添加到所述探針分管集合中的探針分管的探針分管信息加入所述預先設置的數據庫。

6.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述探針分管組合優化模型采用0/1整數線性規劃模型實現，其中，覆蓋區域作為約束條件，覆蓋區域的最小值作為優化目標，探針分管是否應用在所述基因檢測產品的探針分管組合作為0/1整數的輸出結果。

7.根據權利要求6所述的方法，其特征在于，所述0/1整數線性規劃模型的運行環境為嵌入在IBM ILOG CPLEX優化引擎中或R開源軟件包中。

8.一種基因檢測產品探針分管組合的優化裝置，其特征在于，包括：

信息獲取模塊，用于獲取基因檢測產品對應基因組合的覆蓋區域信息以及探針分管集合中各個探針分管的探針分管信息，所述探針分管信息包括探針分管所包含的探針和各個探針所對應的基因檢測區域；

優化模塊，用于利用預設的探針分管組合優化模型，根據所述覆蓋區域信息和探針分管信息確定優化后的探針分管組合結果，所述探針分管組合結果為構建所述探針分管組合所需要的目標探針分管，其中，在所述探針分管組合優化模型中，覆蓋區域作為約束條件，覆蓋區域的最小值作為優化目標，探針分管是否應用在所述基因檢測產品的探針分管組合作為所述探針分管組合優化模型的輸出結果。

9.一種基因檢測產品探針分管組合的優化設備，包括存儲器、處理器及存儲在存儲器上并可在處理器上運行的計算機程序，其特征在于，所述處理器執行所述程序時實現如權利要求1-7任一項所述方法的步驟。

10.一種基因檢測產品探針分管組合的優化系統，其特征在于，包括用戶終端、計算引擎服務器、數據庫服務器以及分別與所述用戶終端、計算引擎服務器、數據庫服務器連接的如權利要求9所述的優化設備，其中：

數據庫服務器，用于存儲所述基因檢測產品對應基因組合的覆蓋區域信息以及探針分管集合中各個探針分管的探針分管信息；

計算引擎服務器，用于為所述的優化設備提供計算服務；

用戶終端，用于接收經所述優化設備優化后的探針分管組合結果。