[發明專利]用于基因分型檢測東南亞缺失型α地中海貧血的方法及試劑盒在審
| 申請號: | 201710487917.2 | 申請日: | 2017-06-23 |
| 公開(公告)號: | CN109112206A | 公開(公告)日: | 2019-01-01 |
| 發明(設計)人: | 陳治中;卿吉琳 | 申請(專利權)人: | 陳治中 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京海虹嘉誠知識產權代理有限公司 11129 | 代理人: | 向群 |
| 地址: | 530012 廣西壯*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 試劑盒 引物組 地中海貧血 基因分型檢測 引物序列 分子生物學領域 引物 靈敏 檢測 應用 安全 | ||
1.用于基因分型檢測東南亞缺失型α地中海貧血的引物組,包括如下引物對:
上下游引物序列分別如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.1所示的APF/APR;
上下游引物序列分別如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的SEAF/SEAR。
2.根據權利要求1所述的引物組,其特征在于,所述檢測指以人體血液和/或體液和/或胚胎的遺傳物質和/或人體基因組DNA為模板,用所述引物組進行PCR擴增后,將所得擴增產物進行電泳即可獲知結果。
3.用于快速檢測東南亞缺失型α地中海貧血基因型的試劑盒,包括權利要求1所述的引物組。
4.根據權利要求2所述的試劑盒,其特征在于,所述快速檢測指,以待測樣品包括人體血液和/或體液和/或胚胎的遺傳物質和/或細胞為PCR反應的模板,用所述引物組進行PCR擴增后,將所得擴增產物進行電泳即可獲知結果。
5.根據權利要求2或3所述的試劑盒,其特征在于,還包括用于進行PCR和/或電泳的試劑。
6.根據權利要求2-4任一所述的試劑盒,其特征在于,所述用于進行PCR的試劑包括dNTP、DNA聚合酶、緩沖液、雙蒸水、MgCl2;
所述用于進行電泳的試劑包括瓊脂糖、蒸餾水、核酸染料;
所述核酸染料選自:EB、GelGreen、SYBR Green Ⅰ、GoldView、GelRed和GelGreen。
7.根據權利要求2-5任一所述的試劑盒,其特征在于,所述PCR的反應體系為:模板1~4ng/μL;各引物:0.05~1μmol/L;MgCl2濃度為1.5~5mM/L;dNTP的濃度為100~500μM/L;DNA聚合酶的濃度為1~4U/反應;
所述PCR的反應體系優選包括如下體積份數的各組分:MightyAmp Taq 0.1-1份、2×MightyAmp Buffer 10份、APF/SEAF 0.1-1份、SEAR 0.1-1份、APR 0.1-1份、模板+超純水7-9.3份;
所述PCR的反應體系進一步優選包括如下體積份數的各組分:MightyAmp Taq 0.5份、2×MightyAmp Buffer 10份、APF/SEAF 0.5份、SEAR 0.3份、APR 0.2份、模板+超純水8.5份;
優選的,所述引物組各引物摩爾濃度比例如下:
APF/SEAF∶SEAR∶APR=5∶3∶2;
所述PCR的反應程序為:95℃3-5分鐘;以94℃15-30秒、62-66℃25~35秒、72℃35秒為1個循環,進行34個循環;72℃5分鐘;12℃12秒;
所述PCR的反應程序優選為:95℃5min;以94℃30sec、64℃30sec、72℃35sec為1個循環,進行34個循環;72℃5min;12℃12sec;
所述電泳指,將所述PCR反應產物置于質量比為2~2.5%瓊脂糖凝膠中,在5V/cm電壓下電泳約30~35分鐘;所述瓊脂糖凝膠中還添加有體積比0.005%核酸染料。
8.根據權利要求4或7所述的試劑盒,其特征在于,所述模板還包括固定在固體載體上的人體血液、和/或體液、和/或基因組DNA、和/或胚胎的遺傳物質;
優選地,所述模板可以選自濾紙片干血斑樣品、濾紙片干羊水樣品、濾紙片干漿膜腔液樣品、濾紙片干關節液樣品、濾紙片干唾液樣品、濾紙片干基因組DNA樣品、和/或濾紙片干胚胎遺傳物質樣品。
9.根據權利要求4或8所述的試劑盒,其特征在于,所述人體體液選自下述物質的一種或多種:羊水、胚胎絨毛組織、漿膜腔液、關節液、唾液;所述血液包括外周血、臍帶血、末梢血;所述胚胎的遺傳物質包括配子如精子或卵子、卵裂期胚胎的卵裂球、囊胚滋養外胚層細胞,即囊胚細胞。
10.權利要求1所述的引物組,和/或,權利要求2-9任一所述的試劑盒在制備東南亞缺失型α地中海貧血檢測試劑方面的用途,其特征在于,在標有東南亞缺失型α地中海貧血檢測用途的包裝內放入所述引物組,和/或,在裝有所述引物組的容器上標有東南亞缺失型α地中海貧血檢測用途。
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