[發(fā)明專利]用于基因分型檢測α0缺失型地中海貧血的引物組及試劑盒在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710486949.0 | 申請日: | 2017-06-23 |
| 公開(公告)號: | CN109112202A | 公開(公告)日: | 2019-01-01 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 陳治中;卿吉琳 | 申請(專利權(quán))人: | 陳治中 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京海虹嘉誠知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11129 | 代理人: | 向群 |
| 地址: | 530012 廣西壯*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 引物組 引物序列 試劑盒 基因分型檢測 地中海貧血 檢測 引物 靈敏 應(yīng)用 安全 | ||
1.用于基因分型檢測α0缺失型地中海貧血的引物組,包括如下引物對:
上下游引物序列分別如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的APF/APR;
上下游引物序列分別如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.3所示的SEAF/SEAR;
上下游引物序列分別如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示的THAIF/THAIR。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的引物組,其特征在于,所述檢測指以人體血液、和/或體液、和/或胚胎的遺傳物質(zhì)、和/或人體基因組DNA為模板,用所述引物組進(jìn)行PCR擴(kuò)增后,將所得擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳即可獲知結(jié)果。
3.用于快速檢測α0缺失型地中海貧血基因型的試劑盒,包括權(quán)利要求1所述的引物組。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的試劑盒,其特征在于,所述快速檢測指,直接以人體血液和/體液或和/或胚胎的遺傳物質(zhì)為模板,用所述引物組進(jìn)行PCR擴(kuò)增后,將所得擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳即可獲知結(jié)果。
5.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的試劑盒,其特征在于,還包括用于進(jìn)行PCR和/或電泳的試劑。
6.根據(jù)權(quán)利要求2-4任一所述的試劑盒,其特征在于,所述用于進(jìn)行PCR的試劑包括dNTP、DNA聚合酶、緩沖液、雙蒸水、MgCl2;
所述用于進(jìn)行電泳的試劑包括瓊脂糖、蒸餾水、核酸染料;
所述核酸染料選自:EB、GelGreen、SYBR GreenⅠ、GoldView、GelRed和GelGreen。
7.根據(jù)權(quán)利要求2-5任一所述的試劑盒,其特征在于,所述PCR的反應(yīng)體系為:模板1~10ng/μL;各引物:0.05~1μmol/L;MgCl2濃度為1.5~5mM/L;dNTP的濃度為100~500μM/L;DNA聚合酶的濃度為1~4U/反應(yīng);
所述PCR反應(yīng)體系優(yōu)選為:包含下述體積份數(shù)的各組分:MightyAmp Taq 0.1-1份、2×MightyAmp Buffer 10份、SEAF/APF 0.1-1份、SEAR 0.1-1份、APR 0.1-1份、THAIF 0.1-1份、THAIR 0.1-1份、模板+超純水4-9.4份;
所述PCR反應(yīng)體系進(jìn)一步優(yōu)選為:包含下述體積份數(shù)的各組分:MightyAmp Taq 0.5份、2×MightyAmp Buffer 10份、SEAF/APF 0.5份、SEAR 0.3份、APR 0.2份、THAIF 0.3份、THAIR 0.3份、模板+超純水7.9份;
優(yōu)選地,所述引物組各引物摩爾濃度比例如下:
SEAF/APF∶SEAR∶APR∶THAIF∶THAIR=5∶3∶2∶3∶3;
所述PCR的反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃3-5分鐘;以94℃15-30秒、62-66℃25~35秒、72℃35秒為1個循環(huán),進(jìn)行30~36個循環(huán);72℃5分鐘;12℃12秒;
所述PCR的反應(yīng)程序,優(yōu)選為:95℃5分鐘;以94℃30秒、64℃30秒、72℃35秒為1個循環(huán),進(jìn)行34個循環(huán);72℃5分鐘;12℃12秒;
所述電泳指,將所述PCR反應(yīng)產(chǎn)物置于添加了質(zhì)量比為0.8~1.5%的瓊脂糖凝膠中,在5V/cm電壓下電泳40~55分鐘;所述瓊脂糖凝膠中添加有體積比0.005%的核酸染料。
8.根據(jù)權(quán)利要求4或7所述的試劑盒,其特征在于,所述模板還包括固定在固體載體上的人體血液、和/或體液、和/或基因組DNA、和/或胚胎遺傳物質(zhì);
優(yōu)選地,所述模板可以選自濾紙片干血斑樣品、濾紙片干羊水樣品、濾紙片干漿膜腔液樣品、濾紙片干關(guān)節(jié)液樣品、濾紙片干唾液樣品、濾紙片干基因組DNA樣品、和/或?yàn)V紙片干胚胎的遺傳物質(zhì)樣品。
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