[發明專利]豬SNP分子標記在豬日增重性狀研究和/或豬育種中的應用

在審

• 申請號: 201710427052.0
• 申請日: 2017-06-08
• 公開（公告）號: CN107177681A
• 公開（公告）日: 2017-09-19
• 發明（設計）人: 吳珍芳;楊杰;付帝生;全建平;鄭恩琴;劉德武;蔡更元
• 申請（專利權）人: 華南農業大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 廣東廣信君達律師事務所44329
• 代理人: 楊曉松

技術領域

本發明屬于分子生物技術和分子標記技術領域，特別涉及一種豬SNP分子標記在豬日增重性狀研究和/或豬育種中的應用。

背景技術

日增重性狀是評估豬生長性能的重要指標，因此是種豬遺傳改良研究中的重點。近百年來，西方豬種的育種目標往往集中在提升瘦肉率和降低背膘厚，這在一定程度上提高了日增重的遺傳進展，但也一直缺乏較為直接的選育方法。傳統的育種方法對于表型難以鑒定的性狀(如日增重)收效甚微，而分子標記輔助選擇(marker assisted selection，MAS)則打破了這一技術壁壘。該方法可用于改良肉質(如肌內脂肪)和抗病性狀(如抗腹瀉)等活體很難度量或活體測量花費很大(如日增重)的性狀，以及繁殖(如產仔數)等在生命活動中表達較晚的限性性狀。而且MAS不易受環境影響、性別、年齡影響，因此能進行早期選擇，進而能起到縮短世代間隔、提高選選種效率的目的(柳小春等，2008年)。因此如能利用MAS技術改良種豬的日增重性狀，將具備廣闊的應用前景。

大白豬是世界上著名的瘦肉型豬種之一。在現代豬的繁育體系中，大白以繁殖力高、生長育肥性好、適應性強等優點而著稱。由于其綜合性能優秀，故可以作為諸多合成系商品豬的父本或母本，應用范圍十分廣泛。因此，對大白豬的日增重性狀進行改良，可以有效地縮短商品豬的育肥時間從而節約養殖成本。

發明內容

為了克服現有技術對日增重遺傳選育的不足和缺點，本發明的目的在于提供一種豬SNP分子標記在豬日增重性狀研究和/或豬育種中的應用。

本發明的目的通過下述技術方案實現：

一種豬SNP分子標記在豬日增重性狀研究和/或豬育種中的應用；所述的豬SNP分子標記的SNP位點對應于國際豬參考基因組10.2版本3號染色體上第15588826bp處的C>T突變；所述分子標記的SNP位點為SEQ ID NO.1所示，其中序列中的M是T或C，導致日增重性狀的不同；

所述的豬為大白和其合成系中的至少一種；

用于鑒定上述豬SNP分子標記的引物優選為PCR-F和PCR-R；

上游引物PCR-F：5'-CAGGTAGGACACCTCCACT-3'；

下游引物PCR-R：5'-TGACAGCAGCACTAAATGAC-3'；

所述的豬日增重性狀研究優選為利用上述豬SNP分子標記鑒定豬日增重性狀；

所述的豬日增重性狀研究優選還包括利用上述豬SNP分子標記調節豬日增重；

所述的育種優選為分子標記輔助育種；

一種檢測豬日增重性狀的方法，包含如下步驟：

檢測豬3號染色體上上述豬SNP分子標記的單核苷酸是C還是T；

所述的豬為大白和其合成系中的至少一種；

一種豬的遺傳改良的方法，包含如下步驟：

確定種豬核心群中種豬的上述豬SNP分子標記，并根據豬SNP分子標記做出相應的選擇：種豬的繼代選育國際豬參考基因組10.2版本3號染色體上15588826bp處的CT型和TT型個體，淘汰該點的CC型個體；以逐代提高該位點的等位基因T的頻率，從而提高后代豬的日增重；

所述的種豬為大白和其合成系中的至少一種；

本發明相對于現有技術具有如下的優點及效果：

(1)本發明研究并確定影響日增重相關的分子標記，使用該分子標記進行標記輔助選擇，能夠極大地增加大白及其合成系的日增重進程。

(2)本發明提供一種用于鑒定影響豬日增重性狀分子標記的引物對，通過該分子標記及引物對，可建立高效準確的分子標記輔助育種技術，將其應用于種豬日增重性狀遺傳改良中，從而提高豬的日增重，進而節約糧食，降低企業生產成本，提高企業利潤，增加核心競爭力。

(3)本發明通過優選該分子標記的優勢等位基因，能夠增加大白日增重性狀的遺傳進展，減少大白的日增重性狀的育種時間，從而有效提高種豬育種的經濟效益，其中，通過該分子標記，本發明將CC型個體全部選育成TT型個體，則每頭豬平均日增重可以提高88.7g，一個規模化萬頭豬場則可以在70日內增加豬肉62.09t，由此可見優秀的日增重性能為養豬產業提供收益的潛力是巨大的。

附圖說明

圖1是不同基因型豬的日增重分析圖。

圖2是大白豬在3號染色體上關于日增重性狀的全基因組關聯(GWAS)分析圖；其中：橫坐標表示豬的染色體編號；縱坐標表示-logP值。

具體實施方式