[發明專利]一種肺癌血清基因的檢測模型及其構建方法和應用

在審

• 申請號: 201710395506.0
• 申請日: 2017-05-27
• 公開（公告）號: CN107273717A
• 公開（公告）日: 2017-10-20
• 發明（設計）人: 楊琳;呂攀攀;劉曉晴
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍第三0七醫院
• 主分類號: G06F19/24
• 分類號: G06F19/24;G06F19/18;G06F19/26;G01N33/68
• 代理公司: 北京正理專利代理有限公司11257
• 代理人: 趙曉丹

技術領域

本發明涉及肺癌基因檢測領域。更具體地，涉及一種利用指紋圖譜技術建立肺癌血清基因檢測模型及其構建方法和應用。

背景技術

肺癌是世界范圍內癌癥死亡的主要原因。非小細胞肺癌(non–small-cell lung cancer,NSCLC)是最常見的病理類型，約占肺癌的80％。70％以上的肺癌患者確診時即是晚期，因此全身治療在肺癌的治療中發揮著重要作用。多年來，化療在NSCLC的治療中占據主導地位，然而表皮生長因子受體酪氨酸激酶抑制劑(epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitors,EGFR-TKIs)如厄洛替尼、吉非替尼和?？颂婺幔诓糠滞砥贜SCLC癌患者中顯示出比化療更好的療效和安全性。EGFR-TKI的敏感性與表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因激酶域的活性突變密切相關，特別是19外顯子缺失、21外顯子點突變和18外顯子點突變。各種EGFR基因激酶域的活性突變均導致EGFR酪氨酸激酶的激活，而激活的EGFR酪氨酸激酶是EGFR-TKI作用的靶點。因此EGFR基因突變患者的EGFR-TKI療效較好；反之，EGFR基因野生型患者EGFR-TKI療效較差。因此，EGFR基因突變狀態評估對做出正確的治療決定至關重要。

當前美國國立綜合癌癥網絡(national comprehensive cancer network，NCCN)指南推薦，用腫瘤組織進行DNA突變檢測是評估EGFR基因突變狀態的最佳方法。然而在某些情況下，腫瘤組織量不足、腫瘤細胞成分過少或腫瘤組織獲取困難都會導致依賴組織的EGFR基因突變檢測無法進行。一些研究者已經從血漿或血清循環DNA中檢測到EGFR基因突變，并顯示血漿或血清中的EGFR基因突變與腫瘤組織中EGFR基因突變密切相關，證實血漿或血清循環DNA可代替腫瘤組織DNA進行EGFR基因檢測，并預測EGFR-TKI療效。然而，這些應用血漿或血清進行EGFR基因檢測的方法往往特異性可達90％，但是靈敏性僅僅40％左右。因此，仍有必要尋找敏感的非侵入性的應用腫瘤組織替代物進行EGFR基因突變狀態評估的新方法。

質譜法是一種通過制備、分離、檢測帶電氣態離子碎片來分析化合物的譜學方法，其基本原理為在離子源中使用高能電子流等轟擊樣品，使樣品分子發生電離，生成不同荷質比的帶正電荷離子，經加速電場的作用，獲得動能形成離子束，帶電離子在質量分析器的電磁場中發生偏轉，質量不同的離子到達檢測器的時間不同，按質荷比(電荷-質量比)大小進行分離記錄分析樣品分子。質譜儀通常由樣品導入系統、離子源、質量分析器、離子檢測器、數據處理系統等部分組成。生物質譜在醫學中主要用于核酸檢測；氨基酸、脂肪酸和單糖類等小分子生物標志物檢測；蛋白質等大分子生物標志物檢測；微生物鑒定；藥物分析等用途。

基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技術具備敏感、快速、廉價、簡單的特點，可以用來分析組織、尿和血等復雜的生物樣本，進行蛋白質組學研究。質譜分析生物樣本得到的譜圖中的峰與樣本中的離子相對應，這些峰代表多肽和蛋白。近年來，由MALDI-TOF-MS發展而來的蛋白質指紋圖譜技術被廣泛應用于篩選疾病診斷、療效預測和預后相關標志物。