[發明專利]HCV2a亞型NS5B突變檢測的PCR擴增引物、試劑盒及檢測方法有效
| 申請號: | 201710373709.X | 申請日: | 2017-05-24 |
| 公開(公告)號: | CN106939360B | 公開(公告)日: | 2018-04-20 |
| 發明(設計)人: | 馮宇鵬;郭曉磊;曾征宇;徐艷艷;劉聲碧 | 申請(專利權)人: | 貴州金域醫學檢驗中心有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州華進聯合專利商標代理有限公司44224 | 代理人: | 林青中 |
| 地址: | 550008 貴州省貴陽市高新*** | 國省代碼: | 貴州;52 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | hcv2a ns5b 突變 檢測 pcr 擴增 引物 試劑盒 方法 | ||
1.一種HCV 2a亞型NS5B突變檢測的PCR擴增引物,其特征在于,包括第一引物對、第二引物對、第三引物對、第四引物對、第五引物對、第六引物對、第七引物對及第八引物對;所述第一引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示,所述第二引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示,所述第三引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:5所示,所述第四引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:6和SEQ ID NO:4所示,所述第五引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:2所示,所述第六引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:8所示,所述第七引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:5所示,所述第八引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:6和SEQ ID NO:8所示。
2.一種HCV 2a亞型NS5B突變檢測的試劑盒,其特征在于,含有引物試劑,所述引物試劑中的引物包括權利要求1所述的PCR擴增引物。
3.如權利要求2所述的HCV 2a亞型NS5B突變檢測的試劑盒,其特征在于,還包括RNA提取試劑、逆轉錄試劑、PCR擴增試劑及電泳鑒定試劑中的至少一種試劑。
4.如權利要求2或3所述的HCV 2a亞型NS5B突變檢測的試劑盒,其特征在于,還包括含有HCV 2a亞型的HCV陽性對照試劑。
5.一種HCV 2a亞型NS5B突變檢測方法,其特征在于,包括如下步驟:
對含有HCV 2a亞型RNA的待測樣本進行逆轉錄處理,合成HCV cDNA;
對合成的HCV cDNA使用第一引物對和第二引物對進行第一輪PCR擴增,其中,所述第一引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示,所述第二引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示;
對所述第一輪PCR擴增的產物進行測序分析;
所述HCV 2a亞型NS5B突變檢測方法還包括對第一輪PCR擴增的產物進行鑒定的步驟,若產物片段的長度滿足預設要求,則進行所述測序分析,否則使用第三引物對和第四引物對對第一輪PCR擴增的產物進行第二輪PCR擴增,再對第二輪PCR擴增的產物進行所述測序分析,其中,所述第三引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:5所示,所述第四引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:6和SEQ ID NO:4所示;
所述HCV 2a亞型NS5B突變檢測方法還包括對第二輪PCR擴增的產物進行鑒定的步驟,若產物片段的長度滿足預設要求,則進行所述測序分析,否則對合成HCV cDNA使用第五引物對和第六引物對重新進行第一輪PCR擴增,其中,所述第五引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:2所示,所述第六引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:8所示,并對使用所述第五引物對和所述第六引物對進行第一輪PCR擴增的產物進行鑒定,若產物片段的長度滿足預設要求,則進行所述測序分析,否則使用第七引物對和第八引物對對該第一輪PCR擴增的產物進行第二輪PCR擴增,再對擴增的產物進行鑒定和分析,其中,所述第七引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:5所示,所述第八引物對的兩條引物的序列分別如SEQ ID NO:6和SEQ ID NO:8所示。
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