[發明專利]長尾噬菌體及其獲得方法和應用在審
| 申請號: | 201710328996.2 | 申請日: | 2017-05-11 |
| 公開(公告)號: | CN108220249A | 公開(公告)日: | 2018-06-29 |
| 發明(設計)人: | 張羽;單同領;馮希平;李飛;祝策;陳曦;葉瑋;于闐 | 申請(專利權)人: | 上海交通大學醫學院附屬第九人民醫院 |
| 主分類號: | C12N7/00 | 分類號: | C12N7/00;C12Q1/70;C12Q1/686;C12R1/92 |
| 代理公司: | 上海序倫律師事務所 31276 | 代理人: | 周東萍 |
| 地址: | 200011 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 長尾噬菌體 口腔疾病 氨基酸序列 核苷酸序列 策略提供 宏基因組 患者口腔 噬菌體 新病毒 牙周炎 病因 應用 病毒 治療 預防 | ||
1.一種長尾噬菌體,其特征在于,其TMP蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示。
2.根據權利要求1所述的長尾噬菌體,其特征在于,其DNA聚合酶B區域蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。
3.根據權利要求2所述的長尾噬菌體,其特征在于,其噬菌體結構蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.5所示。
4.根據權利要求3所述的長尾噬菌體,其特征在于,該噬菌體包含:編碼SEQ ID NO.1所示氨基酸序列的核苷酸序列。
5.根據權利要求4所述的長尾噬菌體,其特征在于,所述噬菌體具有SEQ ID NO.2所示的全長核苷酸序列。
6.一種長尾噬菌體,其特征在于,其DNA聚合酶B區域蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。
7.根據權利要求6所述的長尾噬菌體,其特征在于,其噬菌體結構蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.5所示。
8.一種長尾噬菌體,其特征在于,其噬菌體結構蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.5所示。
9.根據權利要求8所述的長尾噬菌體,其特征在于,其TMP蛋白的氨基酸序列如SEQ IDNO.3所示。
10.一種包含權利要求1-9任一項所述長尾噬菌體的藥物組合物或消毒液。
11.一種檢測長尾噬菌體的試劑盒,其特征在于,包含特異性針對SEQ ID NO.2所示全部或部分核苷酸序列設計的引物對。
12.一種長尾噬菌體的獲得方法,其特征在于,包括以下步驟:
取牙周炎患者牙齦組織樣品,提取該樣品中的病毒基因組;
將所述病毒基因組反轉錄成病毒cDNA,再用隨機引物進行PCR擴增,擴增后的產物通過高通量測序,構建測序文庫;
將高通量測序結果進行數據預處理后,把長度大于100bp的短序列拼接為重疊群;
將拼接的序列與數據庫中的已知序列數據進行比對,找出序列之間的相似性;
分析比對結果,依據已知序列設計擴增引物,通過巢式PCR擴增,獲得未知病毒的全長基因序列,該基因序列編碼SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列;
經同源性分析,對未知病毒進行物種分類,將該未知病毒歸類為長尾噬菌體。
13.權利要求1-9任一項所述長尾噬菌體的應用,其特征在于,用于制備或篩選預防或治療口腔疾病的藥物。
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