[發(fā)明專(zhuān)利]一種檢測(cè)方法及裝置

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201710326413.2
• 申請(qǐng)日: 2017-05-10
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN107273715B
• 公開(kāi)（公告）日: 2020-03-17
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 李陽(yáng)
• 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人: 安吉康爾（深圳）科技有限公司
• 主分類(lèi)號(hào): G16B25/10
• 分類(lèi)號(hào): G16B25/10;G16B30/10
• 代理公司: 深圳中一聯(lián)合知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 44414
• 代理人: 張全文

本發(fā)明適用于分子生物信息檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域，提供了一種檢測(cè)方法及裝置，所述方法包括：獲取對(duì)樣本進(jìn)行高通量測(cè)序得到的結(jié)果數(shù)據(jù)；根據(jù)所述結(jié)果數(shù)據(jù)，采用貝葉斯方法統(tǒng)計(jì)所述樣本的污染率的概率集合；根據(jù)統(tǒng)計(jì)得到的所述概率集合確定所述樣本的污染水平。本發(fā)明的技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)了對(duì)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的樣本污染水平的準(zhǔn)確檢測(cè)，避免了在測(cè)序前進(jìn)行樣本污染控制帶來(lái)的難度和不確定性，極大的提高后期分析結(jié)果的準(zhǔn)確率。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于分子生物信息檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一種檢測(cè)方法及裝置。

背景技術(shù)

在使用高通量測(cè)序進(jìn)行遺傳病基因檢測(cè)時(shí)，會(huì)產(chǎn)生大量短讀長(zhǎng)序列來(lái)進(jìn)行脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid，DNA)測(cè)序和基因突變檢測(cè)，但是在此過(guò)程中，交叉污染尤其是樣本間交叉污染對(duì)高通量測(cè)序的影響較大，即使是少量的污染即可導(dǎo)致檢測(cè)結(jié)果不準(zhǔn)確，出現(xiàn)假陽(yáng)性或者假陰性的錯(cuò)誤結(jié)果。

在現(xiàn)有的高通量測(cè)序流程中，往往通過(guò)前期的實(shí)驗(yàn)流程和樣本處理來(lái)減少交叉污染的發(fā)生，但通過(guò)這種方式控制交叉污染難度較大，并且具有不確定性，由于測(cè)序深度和計(jì)算方法的局限性，目前尚沒(méi)有對(duì)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)直接的交叉污染檢測(cè)方法，也沒(méi)有可以定量分析遺傳病基因檢測(cè)過(guò)程中的高通量測(cè)序樣本交叉污染的方法。

發(fā)明內(nèi)容

有鑒于此，本發(fā)明實(shí)施例提供了一種檢測(cè)方法及裝置，以解決現(xiàn)有技術(shù)中無(wú)法對(duì)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行樣本污染檢測(cè)的問(wèn)題。

本發(fā)明實(shí)施例的第一方面提供了一種檢測(cè)方法，包括：

獲取對(duì)樣本進(jìn)行高通量測(cè)序得到的結(jié)果數(shù)據(jù)；

根據(jù)所述結(jié)果數(shù)據(jù)，采用貝葉斯方法統(tǒng)計(jì)所述樣本的污染率的概率集合；

根據(jù)統(tǒng)計(jì)得到的所述概率集合確定所述樣本的污染水平。

本發(fā)明實(shí)施例的第二方面提供了一種檢測(cè)裝置，包括：

獲取模塊，用于獲取對(duì)樣本進(jìn)行高通量測(cè)序得到的結(jié)果數(shù)據(jù)；

統(tǒng)計(jì)模塊，用于根據(jù)所述結(jié)果數(shù)據(jù)，采用貝葉斯方法統(tǒng)計(jì)所述樣本的污染率的概率集合；

確定模塊，用于根據(jù)統(tǒng)計(jì)得到的所述概率集合確定所述樣本的污染水平。

本發(fā)明實(shí)施例與現(xiàn)有技術(shù)相比存在的有益效果是：獲取對(duì)樣本進(jìn)行高通量測(cè)序得到的結(jié)果數(shù)據(jù)，根據(jù)結(jié)果數(shù)據(jù)采用貝葉斯方法統(tǒng)計(jì)樣本的污染率的概率集合，并根據(jù)該概率集合確定樣本的污染水平，實(shí)現(xiàn)了對(duì)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的樣本污染水平的準(zhǔn)確檢測(cè)，避免了在測(cè)序前進(jìn)行樣本污染控制帶來(lái)的難度和不確定性，極大的提高后期分析結(jié)果的準(zhǔn)確率。

附圖說(shuō)明

為了更清楚地說(shuō)明本發(fā)明實(shí)施例中的技術(shù)方案，下面將對(duì)實(shí)施例或現(xiàn)有技術(shù)描述中所需要使用的附圖作簡(jiǎn)單地介紹，顯而易見(jiàn)地，下面描述中的附圖僅僅是本發(fā)明的一些實(shí)施例，對(duì)于本領(lǐng)域普通技術(shù)人員來(lái)講，在不付出創(chuàng)造性勞動(dòng)性的前提下，還可以根據(jù)這些附圖獲得其他的附圖。

圖1是本發(fā)明實(shí)施例一提供的一種檢測(cè)方法的實(shí)現(xiàn)流程圖；

圖2是本發(fā)明實(shí)施例二提供的一種檢測(cè)方法的實(shí)現(xiàn)流程圖；

圖3是本發(fā)明實(shí)施例三提供的一種檢測(cè)裝置的結(jié)構(gòu)框圖；

圖4是本發(fā)明實(shí)施例四提供的一種檢測(cè)裝置的結(jié)構(gòu)框圖。

具體實(shí)施方式

以下描述中，為了說(shuō)明而不是為了限定，提出了諸如特定系統(tǒng)結(jié)構(gòu)、技術(shù)之類(lèi)的具體細(xì)節(jié)，以便透徹理解本發(fā)明實(shí)施例。然而，本領(lǐng)域的技術(shù)人員應(yīng)當(dāng)清楚，在沒(méi)有這些具體細(xì)節(jié)的其它實(shí)施例中也可以實(shí)現(xiàn)本發(fā)明。在其它情況中，省略對(duì)眾所周知的系統(tǒng)、裝置、電路以及方法的詳細(xì)說(shuō)明，以免不必要的細(xì)節(jié)妨礙本發(fā)明的描述。