[發明專利]一種用于評估硫丹促癌風險的方法在審
| 申請號: | 201710322541.X | 申請日: | 2017-05-09 |
| 公開(公告)號: | CN107058556A | 公開(公告)日: | 2017-08-18 |
| 發明(設計)人: | 徐丹;郭瑜冰;林麗梅;孫野青 | 申請(專利權)人: | 大連海事大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;G01N33/574 |
| 代理公司: | 大連東方專利代理有限責任公司21212 | 代理人: | 李銀姬,李馨 |
| 地址: | 116026 遼*** | 國省代碼: | 遼寧;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 評估 硫丹促癌 風險 方法 | ||
技術領域
本發明屬于生物技術領域,涉及一種用于環境污染物促癌風險的方法,尤其是涉及一種評估硫丹暴露引起前列腺癌的方法。
背景技術
隨著科學技術的進步、工業化水平的提高、各類化學制劑正不斷地進入人們的生活,其中持久性有機環境污染物(POPs)對環境的危害和人體健康的影響已經不容忽視,包括二嗯英(PCDD/Fs)、多環芳烴(PAHs)、多氯聯苯(PCBs)、有機氯農藥硫丹等。
硫丹是一種有機氯農藥,作為殺蟲劑廣泛用于農業生產中,具有高生物毒性、潛在的致癌性和環境雌激素效應等特點,它對環境的污染和對生物的毒性作用近幾年來引起了廣泛的關注。作為一種持久性有機污染物,目前關于硫丹與人類疾病的關系研究僅限于流行病學調查,缺少實驗室的數據和生物信息學的分析,硫丹與癌癥的關系如何、涉及的關鍵因子及分子機制至今尚未完全闡明。
環境污染物暴露與人類多種疾病尤其是癌癥的發生發展密切相關,為了研究環境污染物的毒性特點與基因改變的關系,揭示毒性作用的分子機制,基因芯片技術以其良好的檢測基礎和分析標準已經應用于環境污染物的疾病機制分析研究。通過對基因表達譜數據進行分析,能夠揭示不同組織或不同時間基因表達差異的情況,有利于疾病的分子機制分析、診斷、預后和風險評估。
基因芯片技術在環境毒理學領域被用來分析污染物對某些組織或器官引起損傷的分子機制、預測和評估人類疾病的健康風險,但如何篩選致病關鍵基因,確定該基因表達改變與疾病的關系尚無有效可靠的方法。
NextBio和Metacore軟件是可以實現人類疾病預測和基因分析的兩個軟件,目前已得到廣泛的應用,兩種數據庫都能夠挖掘基因表達譜中的關鍵信息,然而二者卻有各自的優缺點。NextBio數據庫中的研究多為臨床醫學上的研究,其結果與臨床上的狀況較為相近,但是受研究數目的限制,使得所分析出結果的準確性受到影響。Metacore數據庫具有較多的功能分析,結果可靠性且準確度高,擅長分析轉錄因子調控網,但是只能實現人、大鼠、小鼠這三個物種的基因芯片分析。
發明內容
鑒于上述作為持久性有機污染物硫丹的生物毒性檢測的現有技術的不足,本發明提供一種用于評估環境污染物硫丹促癌風險的方法,尤其是提供檢測硫丹促癌風險的生物標志物。本發明發現PRL-3能夠參與硫丹對前列腺癌細胞促細胞游走和侵潤的作用,是硫丹暴露與前列腺癌最相關的關鍵基因。
本發明首先探討硫丹暴露對血管內皮細胞基因表達譜的影響,利用硫丹暴露所引起的差異表達基因進行生物信息學的分析,即利用Metacore軟件分析轉錄因子調控網,利用Nextbio數據庫比較已知疾病的基因表達譜,獲得表達變化趨勢一致的基因。在對前列腺癌差異表達基因的比較分析中發現有68個基因呈共同上調或下調的變化,PRL-3表達升高最明顯,并受到三種轉錄因子CREB1、p53、ESR1的調控。經文獻調研發現其參與多種癌的轉移和進展,進一步細胞學實驗也證實PRL-3能夠參與硫丹對前列腺癌細胞促細胞游走和侵潤的作用。本研究篩選出了硫丹促進前列腺癌的關鍵因子PRL-3,為揭示硫丹與前列腺癌的關系提供了重要的實驗依據。
本發明的技術方案如下:
一種用于評估硫丹促癌風險的方法,包括檢測生物樣品中生物標志物表達的步驟,所述生物標志物為PRL-3。
進一步地,在上述技術方案中,所述生物標志物為PRL-3蛋白或PRL mRNA中的一種或兩種。
進一步地,在上述技術方案中,所述檢測基于PRL-3的過表達。優先地,所述PRL-3的過表達為PRL-3蛋白的過表達、PRL mRNA的過表達或PRL-3蛋白和PRL mRNA的過表達。
進一步地,在上述技術方案中,所述生物樣品為培養的細胞、細胞裂解產物,組織、組織裂解產物、全血、血漿、血清。血管內皮細胞具有多種生理功能,可產生和分泌多種生物活性物質,參與機體的正常調節,在維持血管穩態方面起重要的作用,與癌癥的發生發展密切相關,血管內皮細胞可以作為本發明優選的生物樣品。
本發明還提供所述的生物標志物PRL-3在評估硫丹促癌風險中的應用。
本發明的有益效果:
本發明提供了一種用于評估環境污染物硫丹促癌風險的方法,提供檢測硫丹促癌風險的生物標志物PRL-3。本發明的方法簡便,相關性較高,可以快速評估硫丹的促癌風險。
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