[發明專利]一種中醫網絡證候學分析平臺及構建方法和應用

在審

• 申請號: 201710305112.1
• 申請日: 2017-05-03
• 公開（公告）號: CN108830027A
• 公開（公告）日: 2018-11-16
• 發明（設計）人: 所同川;張硯;楊陽;李琳;高杉;高樹明;徐一蘭;李正;于春泉
• 申請（專利權）人: 天津中醫藥大學
• 主分類號: G06F19/00
• 分類號: G06F19/00;G06F19/12;G06F19/16;G06F19/24;G06F19/28
• 代理公司: 天津市北洋有限責任專利代理事務所 12201
• 代理人: 王麗

本發明涉及一種中醫網絡證候學分析平臺及構建方法和應用；通過文獻得到與證候相關的各種疾病，要求所采用的文獻為中文核心期刊目錄或科學引文索引所收錄、報道臨床研究的文獻，包括題目、摘要或正文中報道證候與疾病的直接對應關系；蛋白靶點鑒定信息通過DisGeNet數據庫查詢疾病信息，得到與各疾病相關全部蛋白靶點及蛋白靶點名稱縮寫信息和蛋白靶點UniProt編號信息；生物通路信息由Reactome數據庫收錄生物通路的名稱信息、生物通路編號信息及生物通路包含的蛋白信息得到；形成多層次網絡構建的平臺。應用網絡證候與疾病對應關系、疾病與蛋白靶點的對應關系、蛋白與生物通路的對應關系，得到多層次中醫證候生物學網絡。

技術領域

本發明屬于中醫證候學和系統生物學領域，特別涉及一種中醫網絡證候學分析平臺及利用中醫證候生物學網絡構建方法。

背景技術

證候作為中醫學的基本概念，與西醫“疾病”的概念既有區別又有聯系。從涵義上講，證候是對人體特定生理階段各種體征的總結，因此同一疾病的不同發展階段往往對應于不同證候，即“同病異證”；同時，不同疾病在各自特定的發展階段可以對應于同一證候，即“異病同證”。而中醫之證候與西醫之疾病最重要的聯系在于，當證候與疾病的特定階段產生對應關系時，二者應具有共同的生物學基礎；于是充分利用現代醫學對疾病的研究成果，可為證候生物學基礎的探究提供基礎和切入點。

近年來，“網絡”的概念在醫學和生理學研究中得到了越來越多的重視和應用。在中醫證候的研究中，以證候與相關疾病的聯系為媒介，將相關的生物網絡、蛋白靶標及生物通路與中醫證候聯接起來，便構成了“證候-疾病-蛋白靶標-生物通路”多層次復雜網絡結構。此類中醫證候生物學網絡結構上具有網絡的一般性特征，即由若干節點以及連接關聯節點的邊組成；節點代表系統內的不同個體，若2個節點以邊相連，則表示它們之間有某種聯系。網絡證候學的概念和方法便是基于這些思想提出的，旨在通過證候生物學網絡的構建和分析，全面準確地闡釋其生物學基礎。

發明內容

本發明的目的在于提供一種中醫網絡證候學分析平臺及中醫證候生物學網絡構建方法，該分析平臺及分析方法能結合中醫證候的相關疾病和蛋白靶標，準確、高效地構建中醫證候的生物學網絡，為中醫證候的生物學基礎研究提供指導，并可協助新型中藥的研發。

為達到上述目的，本發明采用的以下技術方案：

本發明的中醫網絡證候學分析平臺，所述分析平臺包括中醫證候基本信息、證候相關疾病信息、蛋白靶點鑒定信息、生物通路信息的中醫網絡證候學數據庫模塊。

所述的中醫證候基本信息包括證候編碼信息、證候名稱信息、證候分類信息、證候別名信息以及證候癥狀描述信息。

所述證候相關疾病信息包括各證候與各疾病的關聯信息、疾病中文名稱信息、疾病英文名稱信息、疾病ICD-10編碼信息以及疾病MeSH編碼信息。

所述蛋白靶點鑒定信息包括蛋白靶點名稱縮寫信息、蛋白靶點UniProt編號信息、蛋白靶點對應的疾病信息、以及蛋白靶點的數據來源信息。

所述生物通路信息包括生物通路所包含的蛋白靶點名稱縮寫信息、生物通路的名稱信息以及生物通路的編號信息。

本發明的中醫網絡證候學分析平臺的構建方法，通過文獻挖掘得到與證候相關的各種疾病，要求所采用的文獻為中文核心期刊目錄或科學引文索引(SCI)所收錄、報道臨床研究的文獻，且文獻的題目、摘要或正文中報道證候與疾病的直接對應關系；蛋白靶點鑒定信息通過在DisGeNet數據庫(www.disgenet.org)查詢疾病信息，得到與各疾病相關的全部蛋白靶點以及蛋白靶點名稱縮寫信息和蛋白靶點UniProt編號信息；生物通路信息由Reactome數據庫(www.reactome.org)收錄的生物通路的名稱信息、生物通路的編號信息以及生物通路所包含的蛋白信息總結得到；形成多層次網絡構建的平臺。