[發明專利]一種快速檢測融合基因的方法

在審

• 申請號: 201710293318.7
• 申請日: 2017-04-28
• 公開（公告）號: CN107437002A
• 公開（公告）日: 2017-12-05
• 發明（設計）人: 閆成海;唐元華;徐健
• 申請（專利權）人: 首度生物科技（蘇州）有限公司;蘇州首度基因科技有限責任公司
• 主分類號: G06F19/22
• 分類號: G06F19/22
• 代理公司: 北京恒泰銘睿知識產權代理有限公司11642
• 代理人: 胡艷

1.一種快速檢測融合基因的方法，其特征在于，包括以下步驟：

A.建立融合基因數據庫：將已知的融合基因斷裂點以及斷裂點前面的N個序列和斷裂點后面的M個序列組成種子，種子的集合形成融合基因數據庫；

B.獲取待檢測基因：通過基因檢測裝置，獲取待檢測基因的序列數據;

D.將種子與待檢測基因的序列數據比對，確定待檢測基因的序列數據是否包含種子信息;

E.當包含待檢測基因包含種子信息時，則認為待檢測基因內含有融合基因；否則認為不包含融合基因。

2.根據權利要求1所述的快速檢測融合基因的方法，其特征在于，在所述步驟B之后還包括步驟C.將序列數據建立數據庫索引。

3.根據權利要求1所述的快速檢測融合基因的方法，其特征在于，在所述步驟D之后還包括步驟F.當含有融合基因時，判斷待檢測基因包含融合基因的含量，當融合基因的含量大于一定閾值時，提示存在風險。

4.根據權利要求1所述的快速檢測融合基因的方法，其特征在于，所述步驟B中的基因檢測裝置為二代高通量測序平臺或三代測序平臺或基因芯片。

5.根據權利要求1所述的快速檢測融合基因的方法，其特征在于，所述步驟A中，N≥5或M≥5。

6.根據權利要求1所述的快速檢測融合基因的方法，其特征在于，所述步驟D中種子與序列數據采用局部比對。