[發(fā)明專利]一套適用于鑒定啤酒花品種及純度的SNP位點及其應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201710279239.0 | 申請日： | 2017-04-25 |
| 公開（公告）號： | CN107446991A | 公開（公告）日： | 2017-12-08 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 欒春光;郝建秦;劉詩宇;王德良 | 申請（專利權(quán)）人： | 中國食品發(fā)酵工業(yè)研究院 |
| 主分類號： | C12Q1/68 | 分類號： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 暫無信息 | 代理人： | 暫無信息 |
| 地址： | 100015 北京市朝*** | 國省代碼： | 北京;11 |
| 權(quán)利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 一套 適用于 鑒定 啤酒花 品種 純度 snp 及其 應(yīng)用 | ||
1.本發(fā)明篩選出的啤酒花基因組中的5個SNP位點，其特征在于，可在如下應(yīng)用中使用：
啤酒花品種基因分型；
構(gòu)建啤酒花SNP位點指紋數(shù)據(jù)庫；
啤酒花樣品純度定量鑒定；
啤酒花樣品混雜品種定性鑒定；
所述5個SNP位點如下：
SNP位點1為NCBI上提交的Contig LD161349.1的第9970位核苷酸，具體所在序列如下：GCCACCTACAACAATTCAAGGTGCCAGAAGGACACTTGGATCTCAGCGAACCAGGTCCTGAGGGCGCCCACATAAGAATATCAGCCACTCTGTCAGGAAAACAACTCCT(A/C)GTATGCAGTTGCTATTTGGAGGGCAAACACCCCAAGTTGAACTACAACGAGTTAATCAGATAGCTCGGGAAAACAGAGACGGACTCCCTTCTAATCCGAC；
SNP位點2為NCBI上提交的Contig LD205009.1的第1776位核苷酸，具體所在序列如下：
CTCGTGGAGAGTGAGACCACGCGGTTCTAAGAACACGCGCCTGTGCTCCCAACAAATCCCCAATTACTCGGAATTCGTGTGTCAGGAGGGTCAGGTTAGAATTTT(G/T)CCTTGGAGGGAAAGTTCCAATAGGCAAGAAAGGCAAAACCGCCTGTGAAGCGTGTCCCCTAAGCTACCTGGTTTTGGACCCAAAATACTGGAAA；
SNP位點3為NCBI上提交的Contig LD169680.1 的第2676位核苷酸，具體所在序列如下：
GTCAGGAGTTCTCAGATTACAGCTGCAAGAAGAAAGGACAGGTAAGAGAAGAATTGATCTGAAGCCGCAA AGAAGCTAATGAAGAGCGTCTGAAG(A/G)ATTGAAAGCATAACAAGACTGGTAAGCGCGTCATCTATTGCACAAGCACCTCCGGAGACGACTACATCAGAGATGAGAAGAACAGCAAAACTTG；
SNP位點4為NCBI上提交的Contig LD167190.1 的16972位核苷酸，具體所在序列如下:
TCCCGCAAGGTTCGACCCATCCTCGCGCCAGATGCGCCTGGGCGTGCACAATCCGTGACGCACTCCCACAAGTCCATGTCCTCATCATAGA(T/C)CACGTCCTTTATGCCACCACTCTTAACTTAACCATAACACACATATATTCCAGCATCATCAGATGTCAATCAATTCTTACCTTGTCTTCTGAATTTCT；
SNP位點5為NCBI上提交的Contig LD201072.1的2650位核苷酸，具體所在序列如下：
GATATTACCAGTTCGCTGACATCTATCACAGGCCTTGACAAAAACATTAGCATCCTTGAATAATGAAGGCCAATAGAAACCACTTTGTAATACCTTGGC(T/C)GCCGTTCTTGATGCTCCAAAGTGCCCACCACATTGTTGAGTGTGACAATGGTTGAGAATTGACTGCATCTCTTCTTCAGGAACACACCTTCTGATAATCT。
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