[發明專利]兩個黑芥重復DNA序列及其應用

有效

• 申請號: 201710227558.7
• 申請日: 2017-04-06
• 公開（公告）號: CN106916895B
• 公開（公告）日: 2020-08-18
• 發明（設計）人: 王桂香;劉凡;趙泓;何群燕;宗梅;韓碩;郭寧;李靜;蔡澤熙
• 申請（專利權）人: 北京市農林科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6841;C12N15/11;C12N15/63
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢;白艷

本發明公開了兩種黑芥基因組DNA序列及其應用。本發明提供了用于鑒定蕓薹屬植物B基因組的成套DNA分子，為由序列表的序列1所示的單鏈DNA分子和序列表的序列2所示的單鏈DNA分子組成。本發明的實驗證明，BNSAT28和BNSAT68的獲得使蕓薹屬作物的染色體的識別更容易、準確，填補了蕓薹屬作物染色體鑒定上無理想探針可用的空缺。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，尤其涉及兩種黑芥基因組DNA序列及其應用。

背景技術

十字花科蕓薹屬蔬菜包括以白菜為代表的A基因組Brassica rapa(AA,n＝10)，黑芥的B基因組，Brassica nigra(BB,n＝8)，和甘藍為代表的C基因組Brassica oleracea(CC,n＝9)，以及他們自然加倍形成的三個異緣四倍體復合種：甘藍型油菜類B.napus(AACC,n＝19),芥菜類B.juncea(AABB,n＝18)，和埃塞俄比亞芥B.carinata(BBCC,n＝17)，組成了著名的U三角。包含了世界范圍內最重要的食用，油用及調味用蔬菜，也是研究屬內遺傳多樣性和物種及多倍性演化的模式材料。

黑芥是蕓薹屬的野生種，在長期的生態適應下保留了很多優良性狀，如抗多種病原菌(Groat,2003；Pradhan et al.,2011)，和優異的種油質量(Chèvre et al.,1991；Pradhan et al.,2011)。這些都是蕓薹屬育種的重要基因源，然而，B基因組遺傳和細胞學信息的缺乏阻礙了其基因的轉移和利用。蕓薹屬物種進化和倍性演化研究也受到B基因組信息缺乏的限制。

隨著A、C基因組的快速研究，黑芥B基因組的研究也將越來越受到重視，黑芥基因組測序計劃也已啟動，因此其細胞遺傳學研究也必須先前一步。開發穩定的細胞學標記和建立方便可靠的核型鑒定方法是基礎。

蕓薹屬蔬菜染色體小，尤其是B基因組的黑芥，完全不可能靠形態識別所有染色體，核型是細胞遺傳學研究的基礎和關鍵。目前，關于蕓薹屬B基因組的染色體核型分析鮮有報道，基本還停留在染色體形態和C顯帶技術上，重復性差，辨別受主觀因素影響大，方法繁瑣。

發明內容

本發明的一個目的是提供用于鑒定蕓薹屬植物B基因組的成套DNA分子。

本發明提供的成套DNA分子，為如下1)或2)：

1)由序列表的序列1所示的單鏈DNA分子和序列表的序列2所示的單鏈DNA分子組成；

2)由序列A所示的單鏈DNA分子和序列B所示的單鏈DNA分子組成；

序列A為與序列1同源性大于90％的序列；

序列B為與序列2同源性大于90％的序列。

本發明另一個目的是提供用于鑒定蕓薹屬植物B基因組的成套載體。

本發明提供的成套載體，由表達序列1所示的單鏈DNA分子的重組載體和表達序列2所示的單鏈DNA分子的重組載體組成。

表達序列1所示的單鏈DNA分子的重組載體為將序列1所示的BNSAT28序列克隆到PMD-18T載體上得到的質粒。

表達序列2所示的單鏈DNA分子的重組載體為將序列2所示的BNSAT68序列克隆到PMD-18T載體上得到的質粒。

本發明第3個目的是提供用于鑒定蕓薹屬植物B基因組的試劑盒。

本發明提供的試劑盒，包括上述的成套DNA分子或上述的成套載體。

上述中，所述序列1所示的單鏈DNA分子的核苷酸和所述序列2所示的單鏈DNA分子的核苷酸標記不同的熒光基團。