[發明專利]水稻抽穗期相關基因、功能標記及應用

在審

• 申請號: 201710206317.4
• 申請日: 2017-03-31
• 公開（公告）號: CN106967725A
• 公開（公告）日: 2017-07-21
• 發明（設計）人: 占小登;孫濱;程式華;曹立勇;張迎信;沈希宏
• 申請（專利權）人: 中國水稻研究所
• 主分類號: C12N15/29
• 分類號: C12N15/29;C12N15/82;A01H5/00;C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 北京方韜法業專利代理事務所11303
• 代理人: 朱貝貝

1.水稻抽穗期相關基因qHD5，其特征在于，所述基因是如下a)或b)或c)的基因：

a)其cDNA的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.1所示，命名為qHD5-NIL(BG1)；

b)其cDNA的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.2所示，命名為qHD5-NIL(XLJ)；

c)與a)或b)的基因具有90％以上的同源性，且編碼相同功能的蛋白質。

2.權利要求1所述的基因的PCR擴增引物，其特征在于，為如下引物a)或b)：

a)具有SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列的正向引物qHD5-cDNA-F，以及具有SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列的反向引物qHD5-cDNA-R；

b)具有SEQ ID NO.5所示的核苷酸序列的正向引物qHD5-com-F，以及具有SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列的反向引物qHD5-com-R。

3.含有權利要求1所述的基因的生物材料，所述生物材料為載體、宿主細胞或表達盒。

4.權利要求1所述的基因或其編碼的蛋白在選育不同抽穗期水稻品種中的應用。

5.一種改變水稻抽穗期性狀的方法，是將權利要求1中所述的基因a)導入目的水稻組織或細胞中，得到抽穗期提前的轉基因水稻。

6.一種檢測水稻抽穗期相關基因qHD5的功能標記，其特征在于，所述功能標記為qHD5-1032-dCAPs1，該功能標記的引物包括：

正向引物qHD5-1032-dCAPs1-F，其核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示；

反向引物qHD5-1032-dCAPs1-R，其核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。

7.權利要求6所述的功能標記在選育不同抽穗期水稻品種中的應用。

8.一種鑒別水稻抽穗期性狀的方法，其特征在于，包括以下步驟：

S1：利用權利要求6所述的功能標記的引物對待測水稻植株DNA/cDNA進行PCR擴增，獲得擴增產物；

S2：將上述擴增產物用EspⅠ內切酶進行酶切，酶切產物經電泳分離，并根據電泳結果進行判斷：

若獲得141bp條帶和120bp條帶，則該水稻植株為早抽穗型；

若獲得141bp的條帶，則該水稻植株為早抽穗型；

若獲得120bp的條帶，則該水稻植株為晚抽穗型。

9.權利要求8所述的鑒別水稻抽穗期性狀的方法，其特征在于，所述步驟S1中PCR擴增體系為12μL，包含H₂O 3μL，2×PCR Mix 5.0μL，正反向引物各1μL，cDNA模板2.0μL；

PCR擴增條件為94℃預變性4min；94℃變性30s，60℃退火30s，72℃延伸1min，32個循環；72℃延伸10min。

10.權利要求8所述的鑒別水稻抽穗期性狀的方法，其特征在于，所述步驟S2中EspⅠ內切酶體系為15μL，包含EspⅠ內切酶0.6μL，10×Buffer 1.2μL，PCR產物12μL，H₂O 1.2μL；反應條件為37℃，5min。