[發明專利]一種與大豆根干重相關的QTL、SNP分子標記及應用

有效

• 申請號: 201710203595.4
• 申請日: 2017-03-30
• 公開（公告）號: CN106755561B
• 公開（公告）日: 2020-09-04
• 發明（設計）人: 王躍強;邱紅梅;侯佳賢;王洋;馬曉萍;侯云龍;高淑芹;陳健;胡金海;姚麗穎
• 申請（專利權）人: 吉林省農業科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京國坤專利代理事務所(普通合伙) 11491
• 代理人: 黃耀鈞

本發明提供一種與大豆根干重相關的QTL、SNP分子標記及應用，涉及大豆分子育種領域，發掘與大豆根干重有關新的QTL，并將其用于大豆根干重性狀的選育。一種與大豆根干重相關的QTL,位于9號染色體的M45250?M45247區間，由SNP分子標記M45250、M45247定位。與該QTL緊密連鎖的分子標記為M45250、M45247，M45646的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，M45636的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本發明還公開了一種與大豆根干重相關的QTL的應用，該QTL和分子標記可用于分子標記輔助選擇育種，顯著提高大豆根干重較大材料的選擇效率，為進一步豐富大豆根干重調控網絡提供了一種經濟有效的分子育種新途徑。

技術領域

本發明涉及大豆分子育種領域，尤其涉及一種與大豆根干重相關的QTL、SNP分子標記及應用。

背景技術

大豆的根與肥料利用以及土壤逆境脅迫相關的重要器官。根系對大豆產量、品質以及抗逆性有重要影響，強大的根系可提高大豆的產量、改善品質和增強抗逆性。大豆根的干重是根部性狀的綜合指標之一。不同大豆品種的根干重差異明顯，根干重越大抗倒能力越強，豐產性越好。大豆的根干重難于直接觀察選擇，利用分子標記輔助選擇可提高其遺傳改良進程。

目前，通過連鎖分析對大豆根干重相關基因進行數量性狀基因位點(Quantitative trait locus，QTL)定位研究的較少，已報道的大豆根干重相關QTL分布在3號、8號、10號、11號、13號、17號、18號染色體上，相關的作用機理及應用研究還尚未充分進行。因此，有必要尋找一個可以更有效反應大豆根干重QTL以及與其相關的SNP(Singlenucleotide polymorphism，單核苷酸的多態性)分子標記，進而在大豆根干重遺傳改良中應用。

發明內容

本發明的目的在于提供一種與大豆根干重相關的QTL、SNP分子標記及應用，以解決上述技術問題。本發明發掘到1個與根干重相關的QTL，標記區間僅為0.125cM，篩選到SNP標記與目標性狀緊密連鎖，可用于分子標記輔助選擇育種，顯著提高根干重較大材料的選擇效率。

本發明所要解決的技術問題采用以下技術方案來實現：

一種與大豆根干重相關的QTL，其特征在于：與大豆根干重有關的QTL位于9號染色體的M45250-M45247區間，由SNP分子標記M45250、M45247定位。

一種與QTL緊密連鎖的SNP分子標記，其特征在于，所述SNP分子標記為M45250，M45250的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，M45250的擴增引物為：

M50F：5’-TCATTCCAGAGAGTGGTTCA-3’，如SEQ ID NO.3所示；

M50R：5’-GTTGTTTACTATTACGGTGCCC-3’，如SEQ ID NO.4所示。

一種與QTL緊密連鎖的SNP分子標記，其特征在于，所述分子標記為M45247，M45247的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，M45247的擴增引物為：

M47F：5’-GCCTCCTTTGTCATTCTTCT-3’，如SEQ ID NO.5所示；

M47R：5’-TCTCTTTGGCAACCTGGA-3’，如SEQ ID NO.6所示。

與大豆根干重相關的QTL在大豆根干重性狀選育中的應用。

所述的SNP分子標記，在大豆根干重性狀分子標記輔助選擇選育中的應用，是按照以下技術方案進行的：

1)利用CTAB法提取待鑒定材料基因組DNA

2)分別利用M45250、M45247的引物進行PCR擴增，分別得到M45250擴增產物和M452476擴增產物；