[發明專利]用于量化生物擾動的影響的系統和方法

有效

• 申請號: 201710175970.9
• 申請日: 2012-06-11
• 公開（公告）號: CN106940758B
• 公開（公告）日: 2019-10-11
• 發明（設計）人: J·霍恩格;F·馬丁;M·派奇;A·塞沃爾
• 申請（專利權）人: 菲利普莫里斯生產公司
• 主分類號: G16B5/00
• 分類號: G16B5/00;G16H50/50;G06N5/02
• 代理公司: 中國國際貿易促進委員會專利商標事務所 11038
• 代理人: 宋巖

1.一種用于確定擾動對于生物系統的影響的計算機化的方法，所述方法包括：

在處理器處識別表示生物系統的多個網絡模型；

根據所述多個網絡模型和生物系統對于第一處理的響應，生成量化生物系統對于第一處理的響應的第一得分集；

根據所述多個網絡模型和生物系統對于第二處理的響應，生成量化生物系統對于第二處理的響應的第二得分集；以及

基于由第一得分集限定的第一多維表面和由第二得分集限定的第二多維表面之間的差異，生成表示擾動對于生物系統的整體生物影響的生物影響因子，

其中，生物系統包括多個生物實體，

每個生物實體與至少一個其他生物實體相互作用，

每個網絡模型包括表示至少一些生物實體的節點以及表示節點之間的關系的邊。

2.根據權利要求1所述的方法，其中，生成第一得分集包括：

將權重的集合應用于與生物系統對于第一處理的響應對應的數據集，以獲得第一加權數據集；以及

聚合第一加權數據集中的經加權的數據以獲得第一得分集中的得分。

3.根據權利要求2所述的方法，其中，權重的集合是至少部分地基于與生物系統對于第一處理的響應對應的數據集中的倍數變化值表示違反零倍數變化的基礎原假設的概率而被確定的。

4.根據權利要求2所述的方法，還包括使用優化技術選擇權重以獲得第一得分集內的得分和第二得分集內的得分之間的最大差異，其中優化技術包括對權重的集合的約束。

5.根據權利要求1所述的方法，其中，生物影響因子是標量值，所述方法還包括生成具有在存在不同擾動的情況下已經獲得的一個或多個附加生物影響因子的生物影響因子。

6.根據權利要求1所述的方法，其中，第一多維表面和第二多維表面各自具有劑量維度和暴露時間維度。

7.根據權利要求6所述的方法，其中，由第一得分集限定的第一多維表面和由第二得分集限定的第二多維表面之間的差異被選擇為對應于第一多維表面最接近第二多維表面處的劑量和暴露時間，第一處理包括暴露給已知有毒物質，第二處理包括暴露給未知物質。

8.根據權利要求6所述的方法，其中，由第一得分集限定的第一多維表面和由第二得分集限定的第二多維表面之間的差異被選擇為對應于第一多維表面最遠離第二多維表面處的劑量和暴露時間，第一處理包括已知是有益的療法，第二處理包括被預測為是有益的療法。

9.根據權利要求6所述的方法，其中，由第一得分集限定的第一多維表面和由第二得分集限定的第二多維表面之間的差異是基于第一多維表面和第二多維表面上的最接近的點的，而不考慮這些點是否對應于劑量維度和暴露時間維度上的相同值。

10.一種用于確定擾動對于生物系統的影響的計算機化的系統，該計算機化的系統包括被配置為執行以下操作的處理器：

識別表示生物系統的多個網絡模型；

根據所述多個網絡模型和生物系統對于第一處理的響應，生成量化生物系統對于第一處理的響應的第一得分集；

根據所述多個網絡模型和生物系統對于第二處理的響應，生成量化生物系統對于第二處理的響應的第二得分集；以及

基于由第一得分集限定的多維表面和由第二得分集限定的第二多維表面之間的差異，生成表示擾動對于生物系統的整體生物影響的生物影響因子，

其中，生物系統包括多個生物實體，

每個生物實體與至少一個其他生物實體相互作用，

每個網絡模型包括表示至少一些生物實體的節點以及表示節點之間的關系的邊。

11.根據權利要求10所述的系統，其中，處理器通過以下操作來生成第一得分集：

將權重的集合應用于與生物系統對于第一處理的響應對應的數據集，以獲得第一加權數據集；以及

聚合第一加權數據集中的經加權的數據以獲得第一得分集中的得分。