[發明專利]一種基于二代測序的預測腫瘤系統

在審

• 申請號: 201710140087.6
• 申請日: 2017-03-10
• 公開（公告）號: CN106834107A
• 公開（公告）日: 2017-06-13
• 發明（設計）人: 雷建強;唐元華;徐健
• 申請（專利權）人: 首度生物科技（蘇州）有限公司;蘇州首度基因科技有限責任公司
• 主分類號: C12M1/34
• 分類號: C12M1/34
• 代理公司: 北京恒泰銘睿知識產權代理有限公司11642
• 代理人: 蘇天功

技術領域

本發明涉及醫療設備技術領域，尤其是一種基于二代測序的預測腫瘤系統。

背景技術

遺傳性腫瘤是由特定致病基因（這類基因稱為遺傳性腫瘤相關基因）突變導致，且具有家族聚集性的一類疾病，約占癌癥的5%~10%，包括胃癌、黑色素瘤、結直腸癌、乳腺癌、卵巢癌等。

2014年最新研究解析中國腫瘤流行病譜研究表明，按照平均壽命74歲計算，每個人一生當中患惡性腫瘤的幾率是22%。具有遺傳性腫瘤相關基因突變的人群，其患惡性腫瘤的風險還要增加。目前大多數的檢測機構都只能提供幾種特定的遺傳性腫瘤篩查，篩查范圍不全面，并且預測的準確率相對較低。

發明內容

為了解決上述技術問題，本發明提供了一種基于二代測序的預測腫瘤系統，其針對所有腫瘤進行全面篩查，并且給出預測結論，使得客戶及早做好準備。

一種基于二代測序的預測腫瘤系統，包括用于收集血液的抗凝采血管、DNA提取試劑盒、二代測序裝置和基因突變評價系統，所述DNA提取試劑盒從抗凝采血管的血液中提取全血DNA,所述二代測序裝置檢測所述全血DNA的序列，所述基因突變評價系統依據二代測序裝置檢測的序列分析基因突變的情況，并根據突變基因的致瘤性等級和基因的顯隱性，預測腫瘤發生的風險等級。

進一步地，所述二代測序裝置包括建庫模塊和測序模塊，所述建庫模塊包括全外顯子捕獲探針，所述全外顯子捕獲探針對全血DNA進行全外顯子建庫。

進一步地，所述二代測序模塊為Illumina二代測序平臺。

進一步地，所述基因評價系統包括基因突變模塊、比較模塊和數據庫，基因突變模塊確定突變基因的情況，基因比較模塊比較突變基因與數據庫的信息，預測腫瘤發生的年齡。

采用上述系統，本發明具有以下的技術效果：

1.本發明采用二代測序平臺二代測序裝置對基因進行測序，速度快、從而可以對基因進行全面測序，對腫瘤進行全面篩查，并通過基因突變評價系統預測腫瘤的風險等級，使得客戶及早做好準備。分析基因突變的情況，并根據突變基因的致瘤性等級和基因的顯隱性，預測腫瘤發生的風險等級，充分考慮了突變基因對于發生腫瘤的影響，從而使得預測更加準確。

2.二代測序裝置包括全外顯子捕獲探針，通過外顯子捕獲探針對全血DNA進行全外顯子建庫，由于外顯子涵蓋了與個體表型相關的大部分功能性變異，而外顯子只占DNA的很小一部分。因此對全外顯子建庫，既可有效預測所有腫瘤的風險情況，同時提高了測序的效率。

3.預測腫瘤系統通過比較模塊比較突變基因與數據庫的信息，預測腫瘤的發病年齡，從而使得客戶及早進行準備，在相關年齡段更加關注身體狀況，有利于及早發現病情。

附圖說明

圖1是本發明預測腫瘤系統的結構示意圖。

抗凝采血管1、DAN提取試劑盒2、二代測序裝置3、建庫模塊31、測序模塊32、基因突變評價系統4、基因突變模塊41、比較模塊42、數據庫43。

具體實施例

下面結合本發明實施例的附圖對本發明實施例的技術方案進行解釋和說明，但下述實施例僅為本發明的優選實施例，并非全部。基于實施方式中的實施例， 本領域技術人員在沒有做出創造性勞動的前提下所獲得其他實施例，都屬于本發明的保護范圍。

實施例一：

本發明的基于二代測序的預測腫瘤系統包括抗凝采血管1、DNA提取試劑盒2、二代測序裝置3和基因突變評價系統4。

在本實施中，抗凝采血管為EDTA抗凝采血管，通過EDTA抗凝采血管采集2ml靜脈血，采血后立即輕柔顛倒10次使血液與管內成分混勻；然后通過DNA提取試劑盒從抗凝采血管的血液中抽提全血DNA,這種DNA提取試劑盒在市面上可以購買，在這里不做詳細論述。

在本實施例中，二代測序裝置包括建庫模塊31和測序模塊32，測序模塊為Illumina二代測序平臺，當然，本發明的保護范圍并不限于Illumina二代測序平臺。建庫模塊包括全外顯子捕獲探針，針對全血DNA的全外顯子進行建庫，然后通過Illumina二代測序平臺針對DNA測序，獲得所有基因的全長序列。使得后續的分析更加全面，由于二代測序平臺測序較快，因此保障了測序的效率。