[發(fā)明專利]與中國兒童肥胖相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)及其應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201710126858.6
• 申請(qǐng)日: 2017-03-06
• 公開（公告）號(hào): CN106834501B
• 公開（公告）日: 2020-04-28
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 米杰;張美仙;吳建新;趙小元;吳麗君;程紅;侯冬青
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 首都兒科研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/6883
• 分類號(hào): C12Q1/6883
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

本發(fā)明涉及一種與中國兒童肥胖相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)及其應(yīng)用。本發(fā)明公開了一種與中國兒童肥胖相關(guān)的生物標(biāo)志物，所述生物標(biāo)志物包括以下中國兒童肥胖易感性SNP位點(diǎn)中的一種或兩種：易感SNP位點(diǎn)(1)：rs1059491具體為chr16:28603655，c.704AC，p.N235T；易感SNP位點(diǎn)(2)：rs768847893具體為chrX:3241682，c.2044CT，p.R682C。本發(fā)明發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)易感SNP位點(diǎn)并研究了其在兒童肥胖輔助檢測的應(yīng)用前景，本發(fā)明提供的肥胖相關(guān)的基因位點(diǎn)可能是肥胖的早期生物標(biāo)志物，為進(jìn)一步研究肥胖的遺傳分子機(jī)制，探索肥胖早期防治的藥物靶點(diǎn)提供了新的方向。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及與中國兒童肥胖相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

肥胖是一種常見的營養(yǎng)代謝性疾病。2002年WHO將肥胖列為造成人類疾病負(fù)擔(dān)的全球一級(jí)風(fēng)險(xiǎn)因素之一，預(yù)防肥胖癥的流行也是21世紀(jì)前50年世界各國面臨的最大公共衛(wèi)生挑戰(zhàn)之一。家系分析和雙生子研究表明遺傳因素在肥胖發(fā)生中起著非常重要的作用。與人體體脂相關(guān)的40％以上的基因變異可以產(chǎn)生遺傳差異。

單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)是1996年由美國麻省理工學(xué)院的人類基因組研究中心學(xué)者Lander提出的一類分子遺傳標(biāo)記，主要是指基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。SNP僅涉及到單個(gè)堿基的變異，有轉(zhuǎn)換、顛換、插入和缺失等不同形式。SNP為第三代遺傳標(biāo)志，人體許多表型差異、對(duì)藥物或疾病的易感性等都可能與SNP有關(guān)。

全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)正是以SNP為遺傳標(biāo)記的研究復(fù)雜性疾病遺傳易感性的有效策略。到目前為止，應(yīng)用GWAS策略已成功地發(fā)現(xiàn)了大量肥胖的易感基因位點(diǎn)。例如，F(xiàn)TO基因位于第16號(hào)染色體(16q12.2)，含有9個(gè)外顯子，基因長度為410.50kb，廣泛表達(dá)于人體組織的各發(fā)育階段，且在下丘腦、骨骼肌及脂肪等組織中高表達(dá)。它是GWAS發(fā)現(xiàn)與普通人群肥胖關(guān)聯(lián)的第一個(gè)基因。2007年，F(xiàn)rayling TM等最初進(jìn)行FTO與2型糖尿病的關(guān)聯(lián)研究時(shí)，在控制BMI后，F(xiàn)TO與2型糖尿病之間的聯(lián)系消失，從而意外地發(fā)現(xiàn)FTO基因與肥胖相關(guān)。此后，F(xiàn)TO基因變異與BMI及肥胖的關(guān)聯(lián)陸續(xù)在不同種族人群中得到重復(fù)，其中位于第1內(nèi)含子的rs9939609是重復(fù)性最好的多態(tài)性位點(diǎn)。FTO基因多態(tài)性陸續(xù)被證實(shí)與肥胖或2型糖尿病的遺傳易感性有關(guān)。

盡管對(duì)與肥胖和肥胖相關(guān)的性狀關(guān)聯(lián)的基因和基因位點(diǎn)的認(rèn)識(shí)逐漸增加，但臨床上還沒有發(fā)現(xiàn)有用的遺傳變異可作為針對(duì)肥胖的個(gè)體尤其兒童進(jìn)行早期篩查和干預(yù)的有效產(chǎn)品。最近的研究甚至得出結(jié)論，在一組肥胖相關(guān)的候選基因中的普通SNP在調(diào)控由某些膳食誘導(dǎo)的體重改變中，即使發(fā)揮作用的話，也僅發(fā)揮較小的作用。

鑒于目前還沒有與肥胖相關(guān)早期生物標(biāo)志物和早期診斷試劑盒，如能發(fā)現(xiàn)相應(yīng)的標(biāo)記物和研制相應(yīng)的診斷試劑盒，將為探索肥胖早期防治的藥物靶點(diǎn)提供新的方向，并為其藥物篩選、藥效評(píng)價(jià)及靶向治療開辟新的途徑。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是針對(duì)上述技術(shù)問題，首先利用高通量外顯子測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)一種與中國兒童肥胖相關(guān)的生物標(biāo)志物。

本發(fā)明的第二個(gè)目的是提供所述生物標(biāo)記物在預(yù)測兒童肥胖診斷試劑中的應(yīng)用。

本發(fā)明的第三個(gè)目的是提供兒童肥胖易感性輔助診斷試劑盒。

本發(fā)明的目的是通過下列技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的：