[發明專利]多重熒光定量PCR的方法有效
| 申請號: | 201710121610.0 | 申請日: | 2017-03-02 |
| 公開(公告)號: | CN106868140B | 公開(公告)日: | 2022-10-18 |
| 發明(設計)人: | 虞之龍;劉玚;邱海維 | 申請(專利權)人: | 北京酷搏科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6851 | 分類號: | C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 北京康信知識產權代理有限責任公司 11240 | 代理人: | 趙囡囡;吳貴明 |
| 地址: | 100871 北京市海淀區*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 多重 熒光 定量 pcr 方法 | ||
1.一種多重熒光定量PCR的方法,其特征在于,所述方法包括:
將多個目標片段的擴增引物對置于同一擴增體系中進行PCR擴增,所述PCR擴增包括N輪PCR熱循環,10≤N≤50,且所述同一擴增體系中包括雙鏈DNA染料;
每一輪PCR熱循環后,對PCR產物進行程序升溫;
在對所述PCR產物進行程序升溫的過程中,對所述PCR產物的熒光強度進行采集,從而獲得所述多個目標片段形成的混合片段的熔解曲線;
建立各單一目標片段的熔解曲線,利用公式(1)對各所述單一目標片段的熔解曲線進行擬合;
將各所述單一目標產物的熔解曲線的擬合公式進行疊加,得到所述公式(2);
在所述公式(1)中,x表示溫度,y表示觀測到的相對熒光強度,參數a表示對應的單一目標片段的含量所對應的熒光強度,參數b表示對應的單一目標片段產物的熒光強度隨溫度線性變化的系數,參數c表征對應的單一目標片段在溫度為Tm±5℃范圍內熒光強度的下降速率,參數d表示背景熒光強度,參數Tm表示對應的單一目標片段的熔解溫度,e為自然常數;
在所述公式(2)中,x表示溫度,y表示觀測到的相對熒光強度,n表示目標片段的數量,n為≥2的整數,i為自然數,參數ai表示第i個的目標片段的含量所對應的熒光強度,參數bi表示第i個目標片段的熒光強度隨溫度線性變化的系數,參數ci表征第i個目標片段在溫度為Tmi±5℃范圍內熒光強度的下降速率,參數d表示背景熒光強度,參數Tmi表示第i個目標片段的熔解溫度,e為自然常數;
利用公式(2)對所述混合片段的熔解曲線進行擬合的方式,計算所述每一輪PCR熱循環后各單一目標片段的含量,進而建立各單一目標片段的含量隨PCR熱循環次數增加而變化的擴增曲線;
根據各單一目標片段的擴增曲線計算得到各單一目標片段對應的Ct值,進而根據所述Ct值計算得到各單一目標片段的起始濃度。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述程序升溫是按照0.5~10℃/s的升溫速率從起點溫度升至終點溫度。
3.根據權利要求2所述的方法,其特征在于,所述起點溫度為40~90℃,所述終點溫度為60~100℃。
4.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,對所述PCR產物的熒光產物進行采集的速率為0.2~100點/秒。
5.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,建立各單一目標片段的熔解曲線的步驟包括:利用各單一目標片段對應的單一引物對進行PCR擴增,所述PCR擴增包括N輪PCR熱循環,10≤N≤50,其中,每一輪PCR熱循環的步驟包括:85~100℃的解鏈以及解鏈之后的40~75℃的延伸。
6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,在最后一輪PCR熱循環后,采集各單一目標片段的PCR產物的熒光強度,建立各所述單一目標片段的熔解曲線。
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