[發明專利]一種檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒及其制備方法在審
| 申請號: | 201710114091.5 | 申請日: | 2017-02-28 |
| 公開(公告)號: | CN106906284A | 公開(公告)日: | 2017-06-30 |
| 發明(設計)人: | 車團結;同重湘;尤崇革;謝小冬;李琳;李亞鵬 | 申請(專利權)人: | 蘇州百源基因技術有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 廣州市越秀區哲力專利商標事務所(普通合伙)44288 | 代理人: | 胡擁軍,趙賽 |
| 地址: | 215000 江蘇省*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 檢測 cyp2c19 基因 snp rs4244285 基因型 試劑盒 及其 制備 方法 | ||
1.一種檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒:其特征在于包括:標準品、引物、含有熒光染料的qPCR擴增試劑;所述標準品為包含CYP2C19 rs4244285(c.681G>A)位點的野生型DNA序列和包含CYP2C19 rs4244285(c.681G>A)位點的純合突變型DNA序列;所述引物用于擴增標準品和待檢測樣品。
2.根據權利要求1所述的檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒,其特征在于:所述野生型DNA序列為序列W;所述純合突變型DNA序列為序列M。
3.根據權利要求2所述的檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒,其特征在于:所述標準品為連接有序列W的質粒和連接有序列M的質粒。
4.根據權利要求2所述的檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒,其特征在于:所述引物為CYP2C19-F和CYP2C19-R。
5.根據權利要求1所述的檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒,其特征在于:所述含有熒光染料的qPCR擴增試劑為生工生物工程(上海)股份有限公司所產的含EvaGreen的Green-2-Go qPCR Mastermix試劑盒。
6.一種如權利要求1所述的檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒的制備方法,其特征在于包括如下步驟:
1)引物設計與合成
根據CYP2C19 rs4244285基因序列,應用Primer express 3軟件、Primer Premier 5軟件以及Oligo 7軟件,設計一組引物;
2)制備標準品
A、合成含有CYP2C19rs4244285(c.681G>A)位點的野生型DNA序列和純合突變型DNA序列;
B、將野生型DNA序列和純合突變型DNA序列分別與質粒連接;將連接后的質粒導入細菌中;培養細菌并且獲得陽性克隆;
C、擴大培養步驟B所獲得的陽性克隆,提取質粒得到標準品;
3)選購或配制含有熒光染料的qPCR擴增試劑。
7.根據權利要求6所述的檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒的制備方法,其特征在于步驟B中所述的質粒為pMD18-T質粒。
8.根據權利要求7所述的檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒的制備方法,其特征在于:所述野生型DNA序列為序列W;所述純合突變型DNA序列為序列M。
9.根據權利要求8所述的檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒的制備方法,其特征在于:步驟B中將序列W或序列M分別與pMD18-T質粒連接,所采用的連接體系為:
連接的反應時間為10-16h,反應溫度為16℃。
10.根據權利要求6所述的檢測CYP2C19基因SNP位點rs4244285基因型的試劑盒的制備方法,其特征在于:步驟C的具體操作為將陽性克隆接種于含有氨芐抗性的LB液體培養基中,溫度為37℃攪拌速度為220rpm培養14-16h;再從菌體中提取質粒獲得標準品。
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