[發(fā)明專利]新配雜交組合表型的預測方法

在審

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• 申請日: 2017-02-23
• 公開（公告）號: CN108470112A
• 公開（公告）日: 2018-08-31
• 發(fā)明（設計）人: 劉哲;封偉;劉瑋;史夢瑩;曲藝偉;李紹明;張曉東;朱德海
• 申請（專利權）人: 中國農業(yè)大學
• 主分類號: G06F19/20
• 分類號: G06F19/20;A01H1/02
• 代理公司: 北京路浩知識產權代理有限公司 11002
• 代理人: 王慶龍

本發(fā)明提供新配雜交組合表型的預測方法，包括：對所有自交系進行類群劃分；計算劃分后各群間的特殊配合力并根據(jù)特殊配合力或雜交種歷史測試表現(xiàn)確定目標區(qū)域的雜優(yōu)模式，確定參與組配的自交系；根據(jù)參與組配的自交系的指紋信息，通過預設指紋合成算法合成新配雜交種指紋信息；通過計算新配雜交種與訓練樣本中各已配雜交種指紋信息差異度，在訓練樣本中尋找新配雜交種的相似雜交種；根據(jù)新配雜交種與各相似雜交種的指紋信息差異度，對新配雜交種表型進行預測。能夠提高表型預測各環(huán)節(jié)成功率，充分利用歷史數(shù)據(jù)，從自交系表型、基因型和相似雜交種表型、基因型入手，尋找它們與新配雜交種表型的關系，從而提高表型預測準確性，最終提高育種成功率。

技術領域

本發(fā)明涉及玉米育種技術領域，尤其涉及一種新配雜交組合表型的預測方法。

背景技術

利用雜種優(yōu)勢進行玉米雜交組合設計需要先選擇親本進行雜交，然后再經過雜交種鑒定，篩選出強優(yōu)勢組合，此過程需耗費大量的人力、物力和時間成本，才能得到可靠的結果，因此有必要在雜交種鑒定之前預測雜交種表型，也迫切需要一種高效的預測雜交種表型的方法。

而且，每年進行雜交組合設計時，都要選配出數(shù)量巨大的雜交組合，但是由于玉米遺傳的不確定性，優(yōu)秀雜交種的比率即育種的成功率往往很低，如何提高雜交組合的成功率成為雜交組合設計成功與否的關鍵。

鑒于此，如何對新配雜交組合表型進行預測，提高表型預測的準確性，以最終提高雜交組合育種的成功率成為目前需要解決的技術問題。

發(fā)明內容

為解決上述的技術問題，本發(fā)明提供一種新配雜交組合表型的預測方法，能夠提高表型預測各個環(huán)節(jié)的成功率，充分利用歷史數(shù)據(jù)，從自交系表型、基因型和相似雜交種表型、基因型入手，尋找他們與新配雜交種表型的關系，從而提高表型預測的準確性，最終提高雜交組合育種成功率。

第一方面，本發(fā)明提供一種新配雜交組合表型的預測方法，包括：

對所有自交系進行類群劃分；

計算類群劃分后各群間的特殊配合力，并根據(jù)所述特殊配合力或雜交種歷史測試表現(xiàn)確定目標區(qū)域的雜優(yōu)模式，確定參與組配的自交系；

根據(jù)所述參與組配的自交系的指紋信息，通過預設指紋合成算法，合成新配雜交種的指紋信息；

通過計算所述新配雜交種與訓練樣本中各已配雜交種的指紋信息差異度，在訓練樣本中尋找所述新配雜交種的相似雜交種；

根據(jù)所述新配雜交種與其在訓練樣本中的各相似雜交種的指紋信息差異度，對所述新配雜交種的表型進行預測，獲得新配雜交種的表型預測結果。

可選地，在所述獲得新配雜交種的表型預測結果之后，所述方法還包括：

評價所述表型預測結果的可信度；

根據(jù)所述表型預測結果、所述表型預測結果的可信度和訓練樣本表型認知度，對所述新配雜交種的雜交組合進行評價篩選，確定最終組配方案。

可選地，所述評價所述表型預測結果的可信度，包括：

以訓練樣本中相似雜交種的權重均值，作為所述表型預測結果的可信度；

或者，

將所述表型預測結果作為已知值，將訓練樣本分為兩部分，一部分作為驗證樣本，將所述驗證樣本作為新的訓練樣本，按照權利要求1所述方法，將獲得的新配雜交種的第二表型預測結果，計算所述第二表型預測結果與所述已知值的相關系數(shù)，將所述相關系數(shù)作為所述表型預測結果的可信度。

可選地，所述對所有自交系進行類群劃分，包括：

計算不同自交系的DNA指紋的差異度；