[發明專利]一種聯合利用microRNA及其靶基因內SNP篩選楊樹木材品質性狀的方法

有效

• 申請號: 201710099761.0
• 申請日: 2017-02-23
• 公開（公告）號: CN108467898B
• 公開（公告）日: 2021-07-27
• 發明（設計）人: 張德強;肖亮;權明洋;杜慶章
• 申請（專利權）人: 北京林業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;A01H1/04;C12M1/34
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 趙天月

本發明提出了預測楊樹木材品質性狀的方法、楊樹選育方法、用于預測楊樹木材品質性狀的試劑盒、用于預測楊樹木材品質性狀的設備、楊樹選育系統以及預定位點的基因型在預測楊樹的木材品質性狀中的用途。所述方法包括：(1)確定所述楊樹下列預定位點的基因型：Pto?MIR475b基因的第1929位、Pto?RPF3?1基因的第1828位以及Pto?EMP16基因的第365位；以及(2)基于所述預定位點的基因型，預測所述楊樹的木材品質性狀，其中，所述Pto?MIR475b基因的第1929位基因型為GG、Pto?RPF3?1基因的第1828位基因型為GG和Pto?EMP16基因的第365位基因型為GG，是所述楊樹的木材品質性狀優的指示。利用本發明的方法能夠預測出楊樹的木材品質性狀，選育出優質楊樹，縮短育種周期。

技術領域

本發明涉及生物領域。具體地，本發明涉及一種聯合利用microRNA及其靶基因內SNP篩選楊樹木材品質性狀的方法。更具體地，本發明涉及預測楊樹木材品質性狀的方法、楊樹選育方法、用于預測楊樹木材品質性狀的試劑盒、用于預測楊樹木材品質性狀的設備、楊樹選育系統以及預定位點的基因型在預測楊樹木材品質性狀中的用途。

背景技術

楊樹是世界上分布最廣、適應性最強的樹種，是北半球地區廣泛栽培的重要用材樹種，具有廣泛的工業用途，已成為膠合板、纖維板、造紙、火柴以及包裝業的重要加工原料，具有重要的經濟價值。隨著楊樹工業用材林定向培育的發展，對楊樹新品種也提出了相應要求，需具備優良的木材品質。在楊樹優良品種的定向培育中，與造紙有關的材性性狀，如木材密度、纖維素、木質素含量以及纖維長度和寬度、微纖絲角等，作為評價木材品質指標的主要參考因素。

分子標記輔助選擇育種，是指利用分子標記對育種材料進行選擇，是傳統遺傳育種與現代分子生物學有機結合的育種方法。由于林木生長周期長，然而分子標記輔助選擇育種可以在早期進行準確穩定的選擇，從而加速育種進程，提高育種效率。在分子育種應用之前，需要鑒定與目標性狀關聯的分子標記。單核苷酸多態性(SNP)具有數量多、分布廣泛、遺傳穩定性高、共顯性等特點，是目前分子遺傳學研究中重要的技術手段。目前，通過對表型和基因型進行聯合遺傳學研究，利用功能SNP位點對優良種質資源的選擇育種，已成為人工林新品種選育的重要方法。

然而，目前利用功能SNP位點對楊樹品質性狀的選育方法仍有待開發。

發明內容

本發明旨在至少在一定程度上解決現有技術中存在的技術問題至少之一。

在本發明的一個方面，本發明提出了一種預測楊樹木材品質性狀的方法。根據本發明的實施例，所述方法包括：(1)確定所述楊樹下列預定位點的基因型：Pto-MIR475b基因的第1929位、Pto-RPF3-1基因的第1828位以及Pto-EMP16基因的第365位；以及(2)基于所述預定位點的基因型，預測所述楊樹的木材品質性狀，其中，所述Pto-MIR475b基因的第1929位基因型為GG、Pto-RPF3-1基因的第1828位基因型為GG和Pto-EMP16基因的第365位基因型為GG，是所述楊樹的木材品質性狀優的指示。發明人發現，Pto-MIR475b基因的第1929位、Pto-RPF3-1基因的第1828位以及Pto-EMP16基因的第365位是與楊樹木材品質性狀顯著關聯的SNP位點，通過確定其基因型，能夠預測出楊樹的木材品質性狀，選育出優質楊樹，縮短育種周期。

根據本發明的實施例，所述預測楊樹木材品質性狀的方法還可以具有下列附加技術特征：

根據本發明的實施例，在步驟(1)中，確定所述預定位點的基因型是利用第一引物至第九引物進行的，其中，所述第一引物至第九引物分別具有SEQ ID NO：1～9所示的核苷酸序列。發明人發現，利用上述引物，能夠確定Pto-MIR475b基因的第1929位、Pto-RPF3-1基因的第1828位以及Pto-EMP16基因的第365位的基因型，從而預測出楊樹的木材品質性狀，選育出優質楊樹，縮短育種周期。