[發明專利]一種鑒別刺槐種質資源親緣關系的SSR標記引物組及其應用

有效

• 申請號: 201710077445.3
• 申請日: 2017-02-14
• 公開（公告）號: CN106868119B
• 公開（公告）日: 2021-04-30
• 發明（設計）人: 李傳榮;王燦燦;王年;申衛星;郭慧玲;張興忠
• 申請（專利權）人: 山東農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 濟南金迪知識產權代理有限公司 37219
• 代理人: 朱家富

本發明涉及一種鑒別刺槐種質資源親緣關系的SSR標記引物組及其應用。一種鑒別刺槐種質資源親緣關系的SSR標記引物組，SSR標記引物組共四組，每組包括4對引物；本發明還涉及利用上述引物組鑒別刺槐種質資源親緣關系的方法。本發明首次采用SSR標記引物組鑒別刺槐種質資源親緣關系，通過篩選16個SSR標記并設計特異引物，從而確保了鑒定的準確性，較現有鑒別方法可以顯著縮短鑒別時間。

技術領域

本發明涉及一種鑒別刺槐種質資源親緣關系的SSR標記引物組及其應用，屬于生物技術技術領域。

背景技術

SSR簡稱重復序列標記(Simple sequence repeats，SSR)，是基于PCR(基因擴增)技術的分子標記，具有高多態性、重復性、共顯性、豐富性等優點，對于分析品種親緣關系和遺傳多樣性研究具有重要意義，通過確定遺傳距離，來分析其親緣關系，遺傳距離為零時，表明植株出自同一無性系。

中國專利文獻CN102286613A(申請號201110127982.7)公開了防天麻退化的選育方法，它是采用AFLP或ISSR和SSR及天麻素含量標記同時檢測天麻，經軟件繪制聚類圖并繪制天麻遺傳多態性與天麻素含量關系圖，從而快速分析天麻種質資源親緣關系，鑒別天麻自交與雜交體，快速選擇確定天麻親本，快速鑒定天麻雜種純度等，能使中藥天麻優質可持續發展的育種選擇方法。

目前，現有技術多采用挖根的方法來調查刺槐是否出于同一無性系，然而由于刺槐連續多代萌生林無性系小株之間的連接根系可能已經死亡，挖根的方法并不能準確判斷它們的萌蘗擴散范圍和擴散規律。而且挖根的方法耗時費力，在判斷刺槐的萌生植株是否來自于同一個基株時存在一定的主觀性。如何準確鑒別刺槐的萌生植株是否來自于同一個基株成為研究刺槐擴散格局與過程的關鍵問題，也是判斷是否是同一無性系的主要環節。但由于目前未有采用SSR標記鑒別刺槐種質資源親緣關系的相關報道，如何利用相關SSR標記進行檢測，從而提高檢測的準確性和可靠性成為解決上述問題的關鍵。

發明內容

本發明針對現有技術的不足，提供一種鑒別刺槐種質資源親緣關系的SSR標記引物組及其應用。

本發明技術方案如下：

一種鑒別刺槐種質資源親緣關系的SSR標記引物組，SSR標記引物組共四組，每組包括4對引物；第一組的四對SSR標記引物分別為，標記Rops04的上游引物核苷酸序列如SEQID NO.1所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；標記RP106的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；標記Rops09的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；標記RP150的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示；

第二組的四對SSR標記引物分別為，標記RP035的上游引物核苷酸序列如SEQ IDNO.9所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示；標記RP109的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示；標記RP200的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示；標記RP032的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示；

第三組的四對SSR標記引物分別為，標記Rops02的上游引物核苷酸序列如SEQ IDNO.17所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.18所示；標記Rops06的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.19所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.20所示；標記Rops08的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.21所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.22所示；標記RP206的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.23所示，下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.24所示；